POLE2基因沉默通過(guò)調(diào)控PLK1表達(dá)抑制肺腺癌細(xì)胞的增殖
發(fā)布時(shí)間:2022-02-24 18:58
目的:在肺腺癌細(xì)胞中篩選POLE2(DNA聚合酶εB亞基)基因的下游關(guān)鍵基因,進(jìn)一步研究PLK1基因的增殖及凋亡功能,驗(yàn)證PLK1基因與POLE2基因的功能相關(guān)性,初步探索POLE2基因的作用機(jī)制,為闡明POLE2基因抗腫瘤作用的分子機(jī)制奠定基礎(chǔ)。方法:(1)設(shè)計(jì)合成針對(duì)POLE2 siRNA靶序列的寡核苷酸單鏈,包裝完成慢病毒表達(dá)載體并感染肺腺癌A549細(xì)胞。(2)對(duì)照組(shCtrl組)及實(shí)驗(yàn)組(shPOLE2組)慢病毒轉(zhuǎn)染的肺腺癌細(xì)胞72小時(shí)后于倒置熒光顯微鏡下拍照,初步篩選轉(zhuǎn)染效率達(dá)到80%的細(xì)胞株,細(xì)胞狀態(tài)正常即可進(jìn)行下一步實(shí)驗(yàn)。(3)提取shCtrl組及shPOLE2組肺腺癌細(xì)胞總RNA,采用qPCR檢測(cè)POLE2基因在mRNA水平的沉默效率。同時(shí)進(jìn)一步應(yīng)用免疫印跡法(Western blot)檢測(cè)干擾靶點(diǎn)的有效性。(4)采用Trizol試劑盒對(duì)6個(gè)樣品總RNA的進(jìn)行抽提,樣品質(zhì)控合格后進(jìn)入芯片實(shí)驗(yàn):(1)差異基因的篩選標(biāo)準(zhǔn):符合FDR(False Discovery Rate)<0.05和︳FC︳(︳Fold Change︳)>2,且P值<0.05。(2...
【文章來(lái)源】:延安大學(xué)陜西省
【文章頁(yè)數(shù)】:51 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
縮略詞中英文對(duì)照表
第一章 引言
第二章 材料與方法
2.1 細(xì)胞來(lái)源和細(xì)胞培養(yǎng)
2.2 shPOLE2 慢病毒載體構(gòu)建、慢病毒的產(chǎn)生及細(xì)胞感染
2.3 實(shí)時(shí)熒光定量核酸擴(kuò)增檢測(cè)系統(tǒng)驗(yàn)證shPOLE2 的沉默效率
2.4 Western blot檢測(cè)POLE2 基因的沉默效率
2.5 人類全基因組表達(dá)譜芯片分析技術(shù)篩選POLE2基因改變引起的差異基因
2.6 生物信息學(xué)分析
2.7 qPCR技術(shù)驗(yàn)證30個(gè)下游關(guān)鍵基因
2.8 Western blot 檢測(cè)POLE2基因沉默后PLK1基因蛋白水平的表達(dá)變化
2.9 shPLK1慢病毒載體的構(gòu)建、慢病毒的產(chǎn)生及細(xì)胞感染
2.10 Western blot檢測(cè)PLK1 基因的沉默效率
2.11 CCK-8 法檢測(cè)沉默PLK1 對(duì)于細(xì)胞增殖能力的影響
2.12 流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè)沉默PLK1對(duì)細(xì)胞周期的影響
2.13 流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè)沉默PLK1對(duì)細(xì)胞凋亡的影響
2.14 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
第三章 結(jié)果
3.1 檢測(cè)POLE2基因的沉默效率
3.2 人類全基因組表達(dá)譜芯片分析技術(shù)篩選差異表達(dá)基因
3.2.1 芯片數(shù)據(jù)的質(zhì)量評(píng)估
3.2.2 基因芯片篩選下游差異基因
3.2.3 顯著性差異基因的生物信息學(xué)分析
3.3 利用qPCR鑒定下游30個(gè)基因在mRNA水平的表達(dá)
3.4 沉默POLE2 后檢測(cè)下游基因PLK1在mRNA及蛋白水平表達(dá)
3.5 檢測(cè)PLK1基因的沉默效率
3.6 PLK1基因沉默抑制A549和NCI-H1299細(xì)胞增殖
3.7 PLK1基因沉默對(duì)A549和NCI-H1299細(xì)胞周期的影響
3.8 PLK1 基因沉默對(duì)A549和NCI-H1299 細(xì)胞凋亡的影響
第四章 討論
4.1 POLE2基因在肺腺癌發(fā)生發(fā)展中的重要作用
4.2 POLE2基因與下游基因的關(guān)系
4.3 下游關(guān)鍵基因PLK1基因?qū)Ψ蜗侔┘?xì)胞功能的影響
第五章 結(jié)論
第六章 展望與不足
參考文獻(xiàn)
附錄1
致謝
攻讀碩士學(xué)位期間的研究成果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]膠質(zhì)瘤差異表達(dá)基因篩選、功能富集和相關(guān)信號(hào)通路生物信息學(xué)分析[J]. 陳玉升,郭楊,申漢威,張鵬,陳航. 中華醫(yī)學(xué)雜志. 2019 (29)
[2]Gli通過(guò)PLK1對(duì)食管腺癌細(xì)胞腫瘤生物學(xué)行為影響的研究[J]. 趙鑫,杜媛鯤,張耀中,張磊,米源,王雷. 河北醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2019(05)
[3]FoxM1調(diào)節(jié)網(wǎng)絡(luò)——抗癌新靶點(diǎn)[J]. 時(shí)佳琪,劉超,張艷橋. 現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學(xué). 2019(06)
[4]siRNA沉默POLE2基因表達(dá)對(duì)非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞增殖的影響[J]. 李娜苗,張瑩瑩,范亞莉,趙鈺玲,董婭,白潔,李建英. 現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學(xué). 2019(01)
[5]女性原發(fā)性肺癌的流行病學(xué)特征及其危險(xiǎn)因素研究[J]. 王歡,李予林,陳志軍,樂(lè)涵波. 現(xiàn)代實(shí)用醫(yī)學(xué). 2018(11)
[6]上海社區(qū)65歲以上居民肺癌危險(xiǎn)因素現(xiàn)況調(diào)查[J]. 張寧,張賢,周謙君. 中國(guó)全科醫(yī)學(xué). 2018(36)
[7]β-欖香烯對(duì)肺癌A549細(xì)胞的差異基因篩選及鑒定[J]. 李娜苗,張瑩瑩,范亞莉,趙鈺玲,董婭,李建英. 現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學(xué). 2018(11)
[8]欖香烯抗肺癌作用的研究進(jìn)展[J]. 于海如,于韜. 遼寧醫(yī)學(xué)雜志. 2018(02)
[9]中國(guó)肺癌和煙草流行及控?zé)煬F(xiàn)狀[J]. 鄒小農(nóng),賈漫漫,王鑫,支修益. 中國(guó)肺癌雜志. 2017(08)
[10]POLE突變?cè)谀[瘤發(fā)生發(fā)展中的作用[J]. 黃茜,張聲. 臨床與病理雜志. 2015(12)
博士論文
[1]SIX1促進(jìn)宮頸癌細(xì)胞增殖和轉(zhuǎn)移[D]. 劉眈.華中科技大學(xué) 2014
本文編號(hào):3643324
【文章來(lái)源】:延安大學(xué)陜西省
【文章頁(yè)數(shù)】:51 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
縮略詞中英文對(duì)照表
第一章 引言
第二章 材料與方法
2.1 細(xì)胞來(lái)源和細(xì)胞培養(yǎng)
2.2 shPOLE2 慢病毒載體構(gòu)建、慢病毒的產(chǎn)生及細(xì)胞感染
2.3 實(shí)時(shí)熒光定量核酸擴(kuò)增檢測(cè)系統(tǒng)驗(yàn)證shPOLE2 的沉默效率
2.4 Western blot檢測(cè)POLE2 基因的沉默效率
2.5 人類全基因組表達(dá)譜芯片分析技術(shù)篩選POLE2基因改變引起的差異基因
2.6 生物信息學(xué)分析
2.7 qPCR技術(shù)驗(yàn)證30個(gè)下游關(guān)鍵基因
2.8 Western blot 檢測(cè)POLE2基因沉默后PLK1基因蛋白水平的表達(dá)變化
2.9 shPLK1慢病毒載體的構(gòu)建、慢病毒的產(chǎn)生及細(xì)胞感染
2.10 Western blot檢測(cè)PLK1 基因的沉默效率
2.11 CCK-8 法檢測(cè)沉默PLK1 對(duì)于細(xì)胞增殖能力的影響
2.12 流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè)沉默PLK1對(duì)細(xì)胞周期的影響
2.13 流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè)沉默PLK1對(duì)細(xì)胞凋亡的影響
2.14 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
第三章 結(jié)果
3.1 檢測(cè)POLE2基因的沉默效率
3.2 人類全基因組表達(dá)譜芯片分析技術(shù)篩選差異表達(dá)基因
3.2.1 芯片數(shù)據(jù)的質(zhì)量評(píng)估
3.2.2 基因芯片篩選下游差異基因
3.2.3 顯著性差異基因的生物信息學(xué)分析
3.3 利用qPCR鑒定下游30個(gè)基因在mRNA水平的表達(dá)
3.4 沉默POLE2 后檢測(cè)下游基因PLK1在mRNA及蛋白水平表達(dá)
3.5 檢測(cè)PLK1基因的沉默效率
3.6 PLK1基因沉默抑制A549和NCI-H1299細(xì)胞增殖
3.7 PLK1基因沉默對(duì)A549和NCI-H1299細(xì)胞周期的影響
3.8 PLK1 基因沉默對(duì)A549和NCI-H1299 細(xì)胞凋亡的影響
第四章 討論
4.1 POLE2基因在肺腺癌發(fā)生發(fā)展中的重要作用
4.2 POLE2基因與下游基因的關(guān)系
4.3 下游關(guān)鍵基因PLK1基因?qū)Ψ蜗侔┘?xì)胞功能的影響
第五章 結(jié)論
第六章 展望與不足
參考文獻(xiàn)
附錄1
致謝
攻讀碩士學(xué)位期間的研究成果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]膠質(zhì)瘤差異表達(dá)基因篩選、功能富集和相關(guān)信號(hào)通路生物信息學(xué)分析[J]. 陳玉升,郭楊,申漢威,張鵬,陳航. 中華醫(yī)學(xué)雜志. 2019 (29)
[2]Gli通過(guò)PLK1對(duì)食管腺癌細(xì)胞腫瘤生物學(xué)行為影響的研究[J]. 趙鑫,杜媛鯤,張耀中,張磊,米源,王雷. 河北醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2019(05)
[3]FoxM1調(diào)節(jié)網(wǎng)絡(luò)——抗癌新靶點(diǎn)[J]. 時(shí)佳琪,劉超,張艷橋. 現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學(xué). 2019(06)
[4]siRNA沉默POLE2基因表達(dá)對(duì)非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞增殖的影響[J]. 李娜苗,張瑩瑩,范亞莉,趙鈺玲,董婭,白潔,李建英. 現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學(xué). 2019(01)
[5]女性原發(fā)性肺癌的流行病學(xué)特征及其危險(xiǎn)因素研究[J]. 王歡,李予林,陳志軍,樂(lè)涵波. 現(xiàn)代實(shí)用醫(yī)學(xué). 2018(11)
[6]上海社區(qū)65歲以上居民肺癌危險(xiǎn)因素現(xiàn)況調(diào)查[J]. 張寧,張賢,周謙君. 中國(guó)全科醫(yī)學(xué). 2018(36)
[7]β-欖香烯對(duì)肺癌A549細(xì)胞的差異基因篩選及鑒定[J]. 李娜苗,張瑩瑩,范亞莉,趙鈺玲,董婭,李建英. 現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學(xué). 2018(11)
[8]欖香烯抗肺癌作用的研究進(jìn)展[J]. 于海如,于韜. 遼寧醫(yī)學(xué)雜志. 2018(02)
[9]中國(guó)肺癌和煙草流行及控?zé)煬F(xiàn)狀[J]. 鄒小農(nóng),賈漫漫,王鑫,支修益. 中國(guó)肺癌雜志. 2017(08)
[10]POLE突變?cè)谀[瘤發(fā)生發(fā)展中的作用[J]. 黃茜,張聲. 臨床與病理雜志. 2015(12)
博士論文
[1]SIX1促進(jìn)宮頸癌細(xì)胞增殖和轉(zhuǎn)移[D]. 劉眈.華中科技大學(xué) 2014
本文編號(hào):3643324
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