染色體微陣列分析技術(shù)在先天性消化道梗阻胎兒的應(yīng)用研究
發(fā)布時(shí)間:2021-11-16 12:51
目的1.分析產(chǎn)前診斷中先天性消化道梗阻(congenital gastrointestinal obstructions,CGIO)胎兒的染色體核型結(jié)果情況;2.探究全基因組高分辨染色體微陣列(chromosome microarray analysis,CMA)技術(shù)在CGIO胎兒中的應(yīng)用價(jià)值;3.對(duì)CGIO胎兒病例的CMA結(jié)果進(jìn)行表型-基因型的關(guān)系分析,同時(shí)識(shí)別與消化道梗阻相關(guān)的拷貝數(shù)變異及候選基因;4.隨訪了解CGIO胎兒臨床結(jié)局,為提高對(duì)CGIO胎兒的認(rèn)知水平并建立先天性消化道梗阻胎兒病例的產(chǎn)前診斷及流程提供理論依據(jù)。方法1.將2012年5月到2019年5月在廣州市婦女兒童醫(yī)療中心產(chǎn)前診斷中心進(jìn)行侵入性產(chǎn)前診斷的203例CGIO胎兒樣本及其父母樣本納入研究。根據(jù)胎兒梗阻類型分類為:食管狹窄/閉鎖(n=27)、十二指腸狹窄/閉鎖(n=110)、小腸狹窄/閉鎖(n=38)、大腸狹窄/閉鎖(n=28)。依據(jù)超聲提示有無(wú)合并其他指標(biāo)異常分為2組,孤立性CGIO組(n=164)和復(fù)合性CGIO組(n=39,含其他結(jié)構(gòu)畸形和/或超聲軟指標(biāo)異常)。2.根據(jù)臨床知情同意及凍存樣本情況綜合考慮,分...
【文章來(lái)源】:廣州醫(yī)科大學(xué)廣東省
【文章頁(yè)數(shù)】:57 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
CMA操作實(shí)驗(yàn)流程圖
廣州醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文圖1:CMA操作實(shí)驗(yàn)流程圖具體操作步驟如下:3.4.1樣本DNA質(zhì)控:DNA濃度實(shí)驗(yàn)范圍50-100ng/ul,純度(OD260/OD280)位于1.8-2.0之間。濃度>100ng/ul時(shí)可加AE緩沖液稀釋。實(shí)驗(yàn)前評(píng)估樣本完整性,用1%-1.4%的瓊脂糖凝膠電泳分析,電泳條帶介于10-20kb之間。無(wú)條帶者提示已降解則不進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。圖2:DNA電泳評(píng)估圖譜16
材料和方法3.4.4.5將混合液緩慢倒入加樣槽中,使用100ul排槍吸取90ul混合液到相對(duì)應(yīng)的孔板中,此時(shí)每孔中樣本混合物總體積為100ul;3.4.4.6膠膜密封孔板,封閉完好后震蕩混勻,2000rpm,離心1分鐘;3.4.4.7將孔板放入已預(yù)熱好的PCR儀中,運(yùn)行CytoScanPCR程序:94℃;(3min94℃30s,60℃,45s68℃)15s×30個(gè)循環(huán);68℃;7min4℃維持。3.4.5PCR產(chǎn)物電泳質(zhì)檢3.4.5.1標(biāo)記新的8聯(lián)管,每孔各加入5ulNuclease-Freewater;3.4.5.2每份PCR產(chǎn)物中吸取3ul產(chǎn)物到對(duì)應(yīng)的8聯(lián)管中,蓋子緊閉,震蕩混勻后瞬時(shí)離心;3.4.5.3配制2%的瓊脂凝膠,將上述吸取到的8聯(lián)管產(chǎn)物稀釋液3ul加入到凝膠點(diǎn)樣孔中進(jìn)行電泳,凝膠成像并記錄,產(chǎn)物片段長(zhǎng)度應(yīng)在150-2000bp之間,如圖3。圖3:PCR產(chǎn)物電泳質(zhì)檢圖譜3.4.6PCR產(chǎn)物純化3.4.6.1將PCR產(chǎn)物中的4份擴(kuò)增物完全相對(duì)應(yīng)轉(zhuǎn)移至新的已標(biāo)記1.5ml離心管中;3.4.6.2從4℃冰箱中取出純化磁珠,上下混勻,并吸取720ul磁珠到各個(gè)離心管;蓋子緊閉,上下顛倒至少10次至混勻,室溫靜置10分鐘后放入離心機(jī),16100rcf,離心3分鐘;3.4.6.3將離心管放置于磁力架上,吸棄上清液,操作過程中勿觸碰磁珠;每管加入1mlPurificationWashBuffer,插入泡沫振蕩器中,震蕩2分鐘后放入離心機(jī),16100rcf,離心3分鐘;19
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Clinical relationship between EDN-3 gene, EDNRB gene and Hirschsprung’s disease[J]. Xiang-Long Duan Guo-Wei Li Department of General Surgery,Second Hospital of Xi’an Jiaotong University,Xi’an 710004,Shaanxi Province,ChinaXian-Sheng Zhang Department of Pediatric Surgery,Second Hospital of Xi’an Jiaotong University,Xi’an 710004,Shaanxi Province,China. World Journal of Gastroenterology. 2003(12)
本文編號(hào):3498926
【文章來(lái)源】:廣州醫(yī)科大學(xué)廣東省
【文章頁(yè)數(shù)】:57 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
CMA操作實(shí)驗(yàn)流程圖
廣州醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文圖1:CMA操作實(shí)驗(yàn)流程圖具體操作步驟如下:3.4.1樣本DNA質(zhì)控:DNA濃度實(shí)驗(yàn)范圍50-100ng/ul,純度(OD260/OD280)位于1.8-2.0之間。濃度>100ng/ul時(shí)可加AE緩沖液稀釋。實(shí)驗(yàn)前評(píng)估樣本完整性,用1%-1.4%的瓊脂糖凝膠電泳分析,電泳條帶介于10-20kb之間。無(wú)條帶者提示已降解則不進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。圖2:DNA電泳評(píng)估圖譜16
材料和方法3.4.4.5將混合液緩慢倒入加樣槽中,使用100ul排槍吸取90ul混合液到相對(duì)應(yīng)的孔板中,此時(shí)每孔中樣本混合物總體積為100ul;3.4.4.6膠膜密封孔板,封閉完好后震蕩混勻,2000rpm,離心1分鐘;3.4.4.7將孔板放入已預(yù)熱好的PCR儀中,運(yùn)行CytoScanPCR程序:94℃;(3min94℃30s,60℃,45s68℃)15s×30個(gè)循環(huán);68℃;7min4℃維持。3.4.5PCR產(chǎn)物電泳質(zhì)檢3.4.5.1標(biāo)記新的8聯(lián)管,每孔各加入5ulNuclease-Freewater;3.4.5.2每份PCR產(chǎn)物中吸取3ul產(chǎn)物到對(duì)應(yīng)的8聯(lián)管中,蓋子緊閉,震蕩混勻后瞬時(shí)離心;3.4.5.3配制2%的瓊脂凝膠,將上述吸取到的8聯(lián)管產(chǎn)物稀釋液3ul加入到凝膠點(diǎn)樣孔中進(jìn)行電泳,凝膠成像并記錄,產(chǎn)物片段長(zhǎng)度應(yīng)在150-2000bp之間,如圖3。圖3:PCR產(chǎn)物電泳質(zhì)檢圖譜3.4.6PCR產(chǎn)物純化3.4.6.1將PCR產(chǎn)物中的4份擴(kuò)增物完全相對(duì)應(yīng)轉(zhuǎn)移至新的已標(biāo)記1.5ml離心管中;3.4.6.2從4℃冰箱中取出純化磁珠,上下混勻,并吸取720ul磁珠到各個(gè)離心管;蓋子緊閉,上下顛倒至少10次至混勻,室溫靜置10分鐘后放入離心機(jī),16100rcf,離心3分鐘;3.4.6.3將離心管放置于磁力架上,吸棄上清液,操作過程中勿觸碰磁珠;每管加入1mlPurificationWashBuffer,插入泡沫振蕩器中,震蕩2分鐘后放入離心機(jī),16100rcf,離心3分鐘;19
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Clinical relationship between EDN-3 gene, EDNRB gene and Hirschsprung’s disease[J]. Xiang-Long Duan Guo-Wei Li Department of General Surgery,Second Hospital of Xi’an Jiaotong University,Xi’an 710004,Shaanxi Province,ChinaXian-Sheng Zhang Department of Pediatric Surgery,Second Hospital of Xi’an Jiaotong University,Xi’an 710004,Shaanxi Province,China. World Journal of Gastroenterology. 2003(12)
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