目的:Vogt-小柳原田綜合征（Vogt-Koyanagi-Harada,VKH）是一種多系統(tǒng)性的自身免疫性疾病,常伴發(fā)葡萄膜炎而致盲。為了更好地了解它的發(fā)病機制,我們用VKH病人的汗液進行了蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)的研究。方法:本研究納入30例VKH患者的汗液樣本作為疾病組和30例正常人的汗液樣本作為對照組。分別采用了label-free和超高效液相色譜與四級桿-飛行時間（UHPLC-Q-TOF MS）技術(shù)進行了蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)的分析。結(jié)果:本實驗可準確鑒定到716個蛋白質(zhì)和175個代謝物。采用倍數(shù)變化（FC）大于2或小于0.5且P值小于0.05作為標準,篩選到116個差異蛋白,其中有99個是顯著下調(diào)的,17個是顯著增高的。基于變量權(quán)重值（VIP）大于1且P值小于0.05的標準來篩選差異代謝產(chǎn)物,共得到21個差異表達的代謝物。其中有18個代謝產(chǎn)物是下調(diào)的,包括膽堿,L-色氨酸、甜菜堿和L-絲氨酸。而甲氧基肉桂酸、組氨酸和棕櫚酸則是上調(diào)的。通過蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)的聯(lián)合分析發(fā)現(xiàn)一條氨基酸通路（甘氨酸、絲氨酸和蘇氨酸的代謝）顯著失調(diào)。結(jié)論:本研究發(fā)現(xiàn)在VKH患者的汗液中有與正常人顯著不同... 

【文章來源】：重慶醫(yī)科大學(xué)重慶市

【文章頁數(shù)】：37 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

對44個差異蛋白進行熱圖分析

重慶醫(yī)科大學(xué)碩士研究生學(xué)位論文15圖2構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò)以直觀顯示差異汗液蛋白之間的連接度。Figure2.PPInetworkwasconstructedtovisuallyshowthedegreeofconnectivitybetweendifferentiallyexpressedproteins.Nodesinredweretheup-regulatedproteinsinVKHpatients,whereasgreynodesweredown-regulatedproteins.接下來，我們使用GO富集分析來進一步研究差異蛋白質(zhì)的功能性通路（圖3）。在P值小于0.05的條件下，一共可以得到2391個生物過程（BP）、267個細胞成分（CC）和233個分子功能（MF）。BP分析表明，許多通路都與免疫系統(tǒng)密切相關(guān)，包括immuneeffectorprocess、leukocyte-mediatedimmunity、positiveregulationofimmuneresponse和innateimmuneresponse。CC分析表明，這些蛋白大部分都參與extracellularregion,organelleandvesicleformation。在MF分析中主要包括binding,proteinbinding,identicalbinding和receptorbinding。

重慶醫(yī)科大學(xué)碩士研究生學(xué)位論文16圖3Go富集分析可得到差異蛋白的功能性通路。Figure3.Goenrichmentanalysisofdifferentialexpressedproteinsassociatedwithbiologicalprocess(BP),cellcomponent(CC)andmolecularfunction(MF)wasperformed.然后，將所有差異表達的蛋白質(zhì)進行了通路富集分析，可以進一步分析他們之間的生物學(xué)功能。如圖4所示，proteinprocessinginendoplasmicreticulum,carbonmetabolism,Hipposignalingpathway,pyruvatemetabolism和pathogenicEscherichiacoliinfection這些通路上富集到的蛋白數(shù)量最多。圖4差異蛋白的通路富集分析。Figure4.Pathwayenrichmentanalysisbasedondifferentiallyexpressedproteins.Themaincategoriesandsub-categoriesofeachpathwayareshowninthesamecolor.


本文編號：3248582