基于復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)模型的中藥干預(yù)2型糖尿病的藥理作用機(jī)制研究
本文選題:復(fù)雜網(wǎng)絡(luò) + 二型糖尿病; 參考:《北京中醫(yī)藥大學(xué)》2017年碩士論文
【摘要】:糖尿病的發(fā)生與不良生活方式及遺傳基因等內(nèi)外因素的影響有關(guān),調(diào)查顯示,有95%的糖尿病患者為2型糖尿病(Type 2 Diabetes Mellitus,T2DM),T2DM正在以指數(shù)增長(zhǎng)的方式成為危害全球健康的嚴(yán)重問(wèn)題。就我國(guó)目前的情況來(lái)看,不僅糖尿病患者的數(shù)量在不斷增加,而且有相當(dāng)一部分的糖耐量人群,為我國(guó)T2DM患者的增加了后備軍。中醫(yī)藥以其獨(dú)特的思維和治療方式,發(fā)揮辨證論治和定量配伍的優(yōu)勢(shì),在T2DM的治療中起到了重要的作用。然而中藥復(fù)方成分復(fù)雜,其在人體內(nèi)發(fā)揮作用的具體機(jī)制尚不明確,且中藥復(fù)方具有多成分、多靶點(diǎn)及系統(tǒng)調(diào)控的思想,基于復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)模型的構(gòu)建為研究方式,從多靶點(diǎn)的研究策略出發(fā),探索"中藥—成分—靶點(diǎn)"網(wǎng)絡(luò)通路,摸清藥物在人體內(nèi)多途徑、多靶點(diǎn)及蛋白質(zhì)相互作用的方式,在研究糖尿病的中醫(yī)治療上是行得通的。1研究目標(biāo)本研究以T2DM中醫(yī)藥治療過(guò)程中的藥物、成分、靶點(diǎn)為研究對(duì)象,以復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)為基礎(chǔ),利用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)探索藥物-成分-靶點(diǎn)的關(guān)系,構(gòu)建疾病治療網(wǎng)絡(luò)模型并分析結(jié)果,將中醫(yī)驗(yàn)方與并將生物學(xué)通路分析運(yùn)用到研究過(guò)程中,探索中藥在治療T2DM治療中發(fā)揮作用的機(jī)理,為藥物研究提供明確的參考靶標(biāo),從而拓寬藥物研發(fā)新模式,縮短藥物研發(fā)時(shí)間;緊跟現(xiàn)代藥理學(xué)研究中多成分、多路徑、多靶點(diǎn)的研究趨勢(shì),追蹤藥物作用的生物學(xué)通路信息,為追溯中藥治療2型糖尿病中起作用的基因、通路提供信息支持。2研究方法與內(nèi)容2.1本研究以糖尿病為研究對(duì)象,檢索CNKI、萬(wàn)方、維普數(shù)據(jù)庫(kù)中有關(guān)中醫(yī)治療糖尿病的試驗(yàn)類文獻(xiàn),通過(guò)整合相關(guān)信息,建立基于文獻(xiàn)的T2DM中醫(yī)治療方藥數(shù)據(jù)集,利用描述性統(tǒng)計(jì)和關(guān)聯(lián)規(guī)則確定數(shù)據(jù)集中,統(tǒng)計(jì)出臨治療中常用的中藥。2.2將臨床常用中藥作為研究對(duì)象,通過(guò)數(shù)據(jù)檢索drugbank數(shù)據(jù)庫(kù)、KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)、中藥化學(xué)成分?jǐn)?shù)據(jù)庫(kù)等獲取成分、靶點(diǎn)數(shù)據(jù),構(gòu)建"中藥-成分"、"成分-靶點(diǎn)"、"中藥-成分-靶點(diǎn)"數(shù)據(jù)集;2.3以作用成分為連接的中間量,推測(cè)出藥物組方與作用靶點(diǎn)之間的關(guān)系。對(duì)T2DM"中藥-成分"、"成分-靶點(diǎn)"、"中藥-成分-靶點(diǎn)"數(shù)據(jù)集進(jìn)行可視化分析,分別構(gòu)建三個(gè)數(shù)據(jù)集的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)模型,并對(duì)整體的網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行描述和分析。2.4采用復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)方法對(duì)藥物靶標(biāo)相互網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行了研究。計(jì)算分析了藥物靶標(biāo)相互作用網(wǎng)絡(luò)的網(wǎng)絡(luò)性質(zhì)參數(shù),對(duì)模型進(jìn)行拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)參數(shù)分析、聚類分析、緊密中心性分析及網(wǎng)絡(luò)連接度分析等。2.5使用2型糖尿病治療上常用的方劑對(duì)模型進(jìn)行驗(yàn)證,探索常用復(fù)方在治療疾病時(shí)的作用機(jī)制。以所選復(fù)方中所含的中藥為目標(biāo)節(jié)點(diǎn),在構(gòu)建的網(wǎng)絡(luò)模型中選取這些點(diǎn),將這些中藥節(jié)點(diǎn)對(duì)應(yīng)的子網(wǎng)絡(luò)提取出來(lái),分析子網(wǎng)絡(luò)中出現(xiàn)的相對(duì)應(yīng)的靶點(diǎn)信息對(duì)于干預(yù)2型糖尿病靶點(diǎn)的可行性。2.6結(jié)合驗(yàn)方結(jié)論,運(yùn)用生物學(xué)通路信息分析中藥在治療2型糖尿病中作用的基因、位點(diǎn),追溯中藥治療過(guò)程中更深層次的作用機(jī)理。3.研究結(jié)果本研究以研究2型糖尿病中藥藥理作用的動(dòng)物實(shí)驗(yàn)作為文獻(xiàn)來(lái)源,初步檢索到文獻(xiàn)12 318篇,按照嚴(yán)格的納入排除標(biāo)準(zhǔn)對(duì)這些文獻(xiàn)進(jìn)行篩選,共獲取符合納排標(biāo)準(zhǔn)文獻(xiàn)291篇,統(tǒng)計(jì)得知共有藥物149味,當(dāng)歸、生地知母、甘草、麥冬等中藥在方劑中較為常見(jiàn);運(yùn)用Apriori算法對(duì)數(shù)據(jù)集內(nèi)的中藥做關(guān)聯(lián)分析,結(jié)果表明茯苓常與人參搭配使用,生地常與天花粉共同配伍,而甘草和人參、茯苓與麥冬、甘草與黃芪等,也是糖尿病遣方用藥中常常同時(shí)使用,配伍出現(xiàn)的藥對(duì)。本研究通過(guò)查詢Drugbank、TCMSP、KEGG等數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行成分、靶點(diǎn)數(shù)據(jù)篩選,以中國(guó)藥典作為數(shù)據(jù)篩選標(biāo)準(zhǔn),最終構(gòu)建了中藥-成分、成分-靶點(diǎn)、中藥-成分-靶點(diǎn)三個(gè)數(shù)據(jù)集,以Cytoscpae軟件作為建模和分析工具,對(duì)上述149味中藥所構(gòu)建的網(wǎng)絡(luò)模型進(jìn)行連接度分析、聚類分析、緊密中心性等分析,表明患者血糖、血脂、胰腺功能、炎性因子釋放、腦中樞神經(jīng)調(diào)節(jié)等一個(gè)或幾個(gè)生理指標(biāo)的改善,很可能與中藥及其有效成分對(duì)某些相關(guān)靶點(diǎn)的作用有關(guān)。從分析結(jié)果看可知,本研究的網(wǎng)絡(luò)模型構(gòu)建是有效的。最后本研究以消渴方、玉女煎、六味地黃丸、七味白術(shù)散等臨床上治療2型糖尿病的常用方劑,做模型精確性檢驗(yàn),以期探索方藥在臨床治療中的作用機(jī)制。方劑中的黃連、梔子、玄參、黃芪、茯苓、木香、藿香等藥與模型中所納入的中藥、成分、靶點(diǎn)信息所契合,故其所構(gòu)建的網(wǎng)絡(luò)反應(yīng)了此模型中的部分藥物的靶點(diǎn),一定程度上揭露了中藥在治療過(guò)程中的微觀作用機(jī)理;將生物學(xué)通路分析引入成分、靶點(diǎn)作用機(jī)制的最終問(wèn)題追溯上,根據(jù)已找到的生物通路可見(jiàn),中藥及其有效成分在直達(dá)基因位點(diǎn)、改善基因調(diào)控方面能夠起到正向作用。
[Abstract]:The research aims to study the mechanism of traditional Chinese medicine in the treatment of T2DM , and to explore the mechanism of traditional Chinese medicine in the treatment of T2DM . using descriptive statistics and association rules to determine the concentration of data , statistics show that the traditional Chinese medicines are used as the research object , and the traditional Chinese medicine is used as the research object , and the data set of the Chinese medicine - ingredient , the " component - target point " and the " traditional Chinese medicine - target point " data set is constructed by data retrieval , the database of the database , the database of the traditional Chinese medicine chemical composition and the like , and the relation between the drug group and the action target is estimated by taking the action component as the intermediate quantity of the connection . This study was conducted to study the effect of traditional Chinese medicine on the treatment of type 2 diabetes mellitus . In order to explore the mechanism of traditional Chinese medicine in the treatment of type 2 diabetes , it is found that the traditional Chinese medicine and its effective components can play a positive role in the direct gene locus and improve gene regulation .
【學(xué)位授予單位】:北京中醫(yī)藥大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:R285
【參考文獻(xiàn)】
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,本文編號(hào):2097785
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