本文選題：缺血性腦卒中 + 長(zhǎng)鏈非編碼RNA　； 參考：《廣西醫(yī)科大學(xué)》2017年碩士論文

【摘要】：目的:本研究旨在通過(guò)微陣列芯片技術(shù),鑒別缺血性腦卒中的長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA)和mRNA表達(dá)譜,豐富缺血性腦卒中外周血lncRNA和mRNA的表達(dá)譜數(shù)據(jù),為進(jìn)一步進(jìn)行缺血性腦卒中的lncRNA功能機(jī)制研究打下基礎(chǔ),從而促進(jìn)缺血性腦卒中的早期診斷與防控。方法:采用病例-對(duì)照研究,在10例缺血性腦卒中患者、10例健康對(duì)照中,進(jìn)行l(wèi)ncRNA和mRNA表達(dá)譜微陣列芯片檢測(cè)。所用芯片為Human LncRNA Expression Microarray V4.0(8*60K),能夠同時(shí)檢測(cè)lncRNA和mRNA的表達(dá)量變化。使用Gene Spring GX v12.1軟件對(duì)芯片數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,運(yùn)用通路富集分析和基因本體論(GO)分析方法,分析與缺血性腦卒中發(fā)生相關(guān)的信號(hào)通路以及可能參與的生物學(xué)過(guò)程、細(xì)胞成分和分子功能。采用qRT-PCR實(shí)驗(yàn),在78例缺血性腦卒中患者、80例健康對(duì)照中,檢測(cè)lncRNA SERPINB9P1的相對(duì)表達(dá)量。采用SPSS軟件18.0進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,使用GraphPad Prism 5軟件進(jìn)行l(wèi)ncRNA相對(duì)表達(dá)量作圖。結(jié)果:1.LncRNA芯片檢測(cè)結(jié)果:共有5067個(gè)lncRNAs在缺血性腦卒中與對(duì)照組之間的表達(dá)差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05,FDR0.05),包括2497個(gè)表達(dá)上調(diào)lncrnas、2570個(gè)表達(dá)下調(diào)lncrnas。其中,fc≥1.5的有3610個(gè),包括1788個(gè)表達(dá)上調(diào)、1822個(gè)表達(dá)下調(diào);fc≥2的有1403個(gè),包括630個(gè)表達(dá)上調(diào)、773個(gè)表達(dá)下調(diào)。2.mrna芯片檢測(cè)結(jié)果:共有3302個(gè)mrnas在缺血性腦卒中與對(duì)照組之間的表達(dá)差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p0.05,fdr0.05),包括1568個(gè)表達(dá)上調(diào)mrnas、1734個(gè)表達(dá)下調(diào)mrnas。其中,fc≥1.5的有2331個(gè),包括1119個(gè)表達(dá)上調(diào)、1212個(gè)表達(dá)下調(diào);fc≥2的有733個(gè),包括249個(gè)表達(dá)上調(diào)、484個(gè)表達(dá)下調(diào)。3.通路分析結(jié)果:1568個(gè)上調(diào)差異表達(dá)mrnas富集得到4條相關(guān)信號(hào)通路(p0.05);1734個(gè)下調(diào)差異表達(dá)mrnas共富集得到34條相關(guān)信號(hào)通路(p0.05)。4.go分析結(jié)果:1568個(gè)上調(diào)差異表達(dá)mrnas富集程度最高的生物學(xué)過(guò)程、細(xì)胞成分和分子功能分別是proteinmodificationbysmallproteinconjugation、membrane-boundedorganelle和rnabinding;1734個(gè)下調(diào)差異表達(dá)mrnas富集程度最高的生物學(xué)過(guò)程、細(xì)胞成分和分子功能分別是multicellularorganismdevelopment、nuclearlumen和tubulinbinding。5.本研究共鑒別出92個(gè)缺血性腦卒中差異表達(dá)的反義lncrnas與相對(duì)應(yīng)的mrnas(p0.05,fdr0.05,fc≥1.5)。差異表達(dá)倍數(shù)最大的10個(gè)反義lncrnas分別是rp11-445f12.2、hhip-as1、jmjd1c-as1、erich6-as1、loc101928069、ctb-187m2.2、rp5-955m13.4、hoxb-as3、sh3bp5-as1、g001868;分別對(duì)應(yīng)的10個(gè)mRNAs為L(zhǎng)HX1、HHIP、JMJD1C、FAM194A、PELI3、RNF112、KCNG1、HOXB5、SH3BP5、MFSD2A。6.qRT-PCR驗(yàn)證結(jié)果:SERPINB9P1在78例缺血性腦卒中患者、80例對(duì)照樣本之間差異表達(dá)有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(Z=-5.410,P=6.31×10-8),SERPINB9P1在病例組中相對(duì)表達(dá)量低于對(duì)照組。結(jié)論:1.本研究鑒別出了缺血性腦卒中相關(guān)的lncRNA和mRNA表達(dá)譜。2.可能與缺血性腦卒中相關(guān)的上調(diào)信號(hào)通路有:Protein processing in endoplasmic reticulum通路和Ubiquitin mediated proteolysis通路;可能與缺血性腦卒中相關(guān)的下調(diào)信號(hào)通路有:PI3K-Akt信號(hào)通路、HIF-1信號(hào)通路、TNF信號(hào)通路、ErbB信號(hào)通路、Neurotrophin通路、Focal adhesion通路、Estrogen信號(hào)通路。蛋白質(zhì)修飾在缺血性腦卒中的發(fā)生發(fā)展進(jìn)程可能起到較為關(guān)鍵的作用。3.本研究共鑒別出缺血性腦卒中差異表達(dá)倍數(shù)最大的10對(duì)反義lncRNAs與相對(duì)應(yīng)的mRNAs。其中,LHX1、HHIP、PELI3、HOXB5、RNF112、MFSD2A、SH3BP5、KCNG1等mRNAs可能參與調(diào)控缺血性腦卒中或者中樞神經(jīng)系統(tǒng)相關(guān)的病理生理過(guò)程。4.LncRNA SERPINB9P1可能可以作為缺血性腦卒中的一個(gè)新型生物標(biāo)志物。
[Abstract]:Objective : To investigate the expression of lncRNA and mRNA in ischemic stroke patients by microarray chip technique . The results were as follows : 1568 up - regulated differentially expressed mrnas were enriched to obtain four related signal pathways ( p0.05 ) ; 1734 downregulated differentially expressed mrnas were enriched to the highest biological processes , and the cellular and molecular functions were multicycle larorganography development , membrane - boundedorganelle and rnabinding . Results : 1 . There was a significant difference in the expression of mRNA and mRNA in patients with ischemic stroke ( Z = - 5.410 , P = 6.31 脳 10 - 8 ) and SERPINB9P1 showed a statistically significant difference in the progression of ischemic stroke ( Z = - 5.410 , P = 6.31 脳 10 - 8 ) . KCNG1 and other mRNAs may be involved in regulating the physiological processes related to ischemic stroke or the central nervous system . 4 . LncRNA SERPINB9P1 may be a new biomarker for ischemic stroke .
【學(xué)位授予單位】：廣西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號(hào)】：R743.3

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：2018834