本文關(guān)鍵詞：面向癌癥的數(shù)據(jù)集成分析方法和工具研究　出處：《中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)》2017年碩士論文　論文類型：學(xué)位論文

  更多相關(guān)文章： 癌癥網(wǎng)絡(luò) 生物通路差異篩選 基因子網(wǎng)絡(luò) 聚類分析 網(wǎng)絡(luò)功能 癌癥共性網(wǎng)絡(luò) 多維數(shù)據(jù)

【摘要】：癌癥作為威脅人類生命的頭號(hào)疾病,研究人員對(duì)其致病機(jī)理的研究已經(jīng)持續(xù)數(shù)十年。在后基因組時(shí)代,隨著各種生物技術(shù)和計(jì)算機(jī)技術(shù)的快速發(fā)展,各種生物數(shù)據(jù)也來(lái)到了爆發(fā)時(shí)期,癌癥的生物數(shù)據(jù)也急劇增長(zhǎng),癌癥生物數(shù)據(jù)的種類也在快速增多。與此同時(shí),計(jì)算機(jī)技術(shù)的快速發(fā)展,逐漸成為生命科學(xué)研究不可缺失的一部分。此外,對(duì)于癌癥這種在生命系統(tǒng)中由復(fù)雜內(nèi)部相互作用產(chǎn)生的疾病的研究角度已經(jīng)從局部轉(zhuǎn)向整體。海量的癌癥生物數(shù)據(jù)、計(jì)算機(jī)技術(shù)的快速發(fā)展以及癌癥研究角度的轉(zhuǎn)變給研究人員提供了一個(gè)機(jī)會(huì):如何利用計(jì)算機(jī)技術(shù)從各類的海量的癌癥大數(shù)據(jù)中集成多種不同癌癥數(shù)據(jù)源從系統(tǒng)的角度探索其內(nèi)部功能機(jī)制。針對(duì)癌癥的數(shù)據(jù)源的海量性及多樣性,本文利用計(jì)算機(jī)技術(shù)集成多數(shù)據(jù)源從系統(tǒng)的角度探索癌癥致病機(jī)理,展開了若干項(xiàng)研究,主要工作包括:(1)基于癌癥多源數(shù)據(jù)構(gòu)建以及分析癌癥網(wǎng)絡(luò)。針對(duì)目前癌癥網(wǎng)絡(luò)構(gòu)造數(shù)據(jù)源片面性導(dǎo)致網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建不準(zhǔn)確的問(wèn)題,從系統(tǒng)的角度,整合多種網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建的數(shù)據(jù)來(lái)源方式,多種癌癥數(shù)據(jù)源,提供數(shù)據(jù)來(lái)源較為全面、準(zhǔn)確的癌癥網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建方式,以及癌癥網(wǎng)絡(luò)聚類分析功能,給出了一種自動(dòng)化合成分析癌癥網(wǎng)絡(luò)的輔助工具系統(tǒng)(SACNet)。(2)不同于從局部的相關(guān)數(shù)據(jù)層面研究癌癥致病機(jī)理,在基于癌癥網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建的基礎(chǔ)上,利用網(wǎng)絡(luò)聚類分析,結(jié)合DAVID的基因功能聚類分析工具,以胰腺癌為例,給出了一種探索癌癥網(wǎng)絡(luò)內(nèi)部生物分子功能作用的方法;基于10種癌癥網(wǎng)絡(luò),結(jié)合差異癌癥通路和致病基因,構(gòu)建癌癥共性網(wǎng)絡(luò),結(jié)合基因功能查詢工具(GeneCards),給出一種探索癌癥共性網(wǎng)絡(luò)內(nèi)部生物分子功能對(duì)癌癥致病機(jī)理的影響的方法,其結(jié)果和目前主流的癌癥致病機(jī)理相呼應(yīng)。(3)不同于其他單維度數(shù)據(jù)分析癌癥共性和異質(zhì)性,基于TCGA癌癥的多維組學(xué)數(shù)據(jù),結(jié)合DNA甲基化差異分析方法,對(duì)不同種類以及不同發(fā)病組織的癌癥的共性和異質(zhì)性進(jìn)行分析。給出一種分析癌癥間共性和異質(zhì)性的方法,相關(guān)分析揭示了不同發(fā)病組織的癌癥之間和相同發(fā)病組織的癌癥之間共性和異質(zhì)性的存在以及區(qū)別,同時(shí)識(shí)別了多個(gè)癌癥的重要致病基因。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】：中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號(hào)】：R73-3;TP311.13

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前5條

1 徐明義;鄭艷秋;孫娟;胡文良;王亞平;崔曉波;李玲香;;頭頸部鱗癌中TP53基因的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析[J];局解手術(shù)學(xué)雜志;2016年12期

2 鄧禎祥;李金明;;癌癥基因組圖譜計(jì)劃數(shù)據(jù)及分析[J];中國(guó)腫瘤臨床;2014年05期

3 Jiya Sun;Yuyun Pan;Xuemei Feng;Huijuan Zhang;Yong Duan;Hongxing Lei;;iBIG:An Integrative Network Tool for Supporting Human Disease Mechanism Studies[J];Genomics, Proteomics & Bioinformatics;2013年03期

4 李向真;劉子朋;李娟;方慧生;;KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)的進(jìn)展及其在生物信息學(xué)中的應(yīng)用[J];藥物生物技術(shù);2012年06期

5 甘霖,王勇,方平;關(guān)于Web網(wǎng)上智能檢索系統(tǒng)的研究——GeneCards介紹[J];情報(bào)學(xué)報(bào);1999年02期

，

本文編號(hào)：1354742