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中國(guó)石生真菌的分類(lèi)學(xué)與生態(tài)學(xué)研究

發(fā)布時(shí)間:2017-08-22 21:44

  本文關(guān)鍵詞:中國(guó)石生真菌的分類(lèi)學(xué)與生態(tài)學(xué)研究


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【摘要】:石生真菌(Rock-inhabiting fungi, RIF)是指生活在巖石上的一類(lèi)特殊微生物生態(tài)類(lèi)群,它們大都具有生長(zhǎng)緩慢、產(chǎn)生黑色素、呈分生組織狀生長(zhǎng)等特點(diǎn),從而能夠在惡劣環(huán)境中生存,能夠利用裸露巖石上或空氣中微量的有機(jī)質(zhì)生長(zhǎng)、抗極端干旱、溫度和輻射等不良環(huán)境,形成了適應(yīng)這些不良環(huán)境壓力的細(xì)胞及代謝特征。石生真菌是研究生命的起源、生命的極限及進(jìn)化等生命科學(xué)難題的理想材料。同時(shí),石生真菌在巖石分化和土壤形成過(guò)程中發(fā)揮著重要作用,也可為環(huán)境、農(nóng)業(yè)、工業(yè)、能源等領(lǐng)域的生物技術(shù)發(fā)展奠定基礎(chǔ)。資源調(diào)查和系統(tǒng)分類(lèi)研究是對(duì)石生真菌進(jìn)行科學(xué)研究和利用的基礎(chǔ)。由于石生真菌缺少足夠的形態(tài)特征進(jìn)行分類(lèi)鑒定,隨著基于多基因的分子系統(tǒng)學(xué)方法的發(fā)展,石生真菌成為目前真菌學(xué)領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)之一。本研究在采集我國(guó)石生真菌樣品的基礎(chǔ)上,系統(tǒng)分離石生真菌,應(yīng)用多基因分析手段結(jié)合形態(tài)特征,鑒定我國(guó)石生真菌種類(lèi),發(fā)現(xiàn)新分類(lèi)單元,豐富我國(guó)石生真菌多樣性,具有重要的意義。 1.石生真菌樣品采集及分離。從中國(guó)西藏、甘肅、四川、云南、廣西、江西、安徽、河南、河北和北京等地采集樣品348份,通過(guò)培養(yǎng)的方法分離石生真菌1215株;保存真菌干標(biāo)本85份,永久玻片339份。通過(guò)多基因序列分析,結(jié)合形態(tài)特征對(duì)747株真菌進(jìn)行了鑒定,共鑒定出石生真菌21屬,81種,其中包括Anthracina、Rupestriomyces和Spissiomyces等3個(gè)新屬,39個(gè)新種。 2. Dothideomycetes石生真菌分類(lèi)研究。通過(guò)基于18S、28S、mtSSU、RPB2、TUB和ITS等6個(gè)基因的多基因分析,明確了石生真菌在該綱中的分類(lèi)地位,包括描述了2個(gè)石生真菌新屬、確定了Rupestriomyces和Spissiomyces屬于Dothideomycetes incertae sedis,并討論了這些屬與相似屬的區(qū)別。石生真菌涉及Catenulostroma, Cryomyces、Coniosporium、Cladosporium、 Devriesia、Elasticomyces、Oleoguttula、Phaeothecoidea、Rachicladosporium、Rupestriomyces、 Spissiomyces等11個(gè)屬。共鑒定新種19個(gè),即Catenulostroma spissicolonia、C. catenulata、 Coniosporium globulosa、C. crassiparies、C. aridis、C. gemmiformis、C. meristema、Devriesia catenata、 D. separata、D. intermedia、Elasticomyces articulatus、Oleoguttula nagquisa、Phaeothecoidea endoconidia、Rupestriomyces sinensis、R. ampulliformis、R. torulosus、Spissiomyces aggregates、S.ramosus和S.globosus,并對(duì)每個(gè)物種進(jìn)行了詳細(xì)描述和討論。 3. Eurotiomycetes石生真菌分類(lèi)研究。大多數(shù)Eurotiomycetes石生真菌都屬于Trichomeriaceae,通過(guò)構(gòu)建基于18S、28S和mtSSU等3個(gè)基因的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)表明,Trichomeriaceae屬于Chaetothyriales,新屬Anthracina屬于Trichomeriaceae。Anthracina, Bradymyces, Knufia和Trichomerium等屬,盡管在形態(tài)學(xué)上相似,但是通過(guò)構(gòu)建基于18S、28S、mtSSU、RPB1、TUB、TEF1和ITS等7個(gè)基因的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)表明,能夠很好地將其區(qū)分開(kāi)來(lái),且均屬于Trichomeriaceae。明確了Chaetothyriales中石生真菌涉及Anthracina、Bradymyces、 Cladophialophora、Exophiala、Knufia和Trichomerium等6屬。共鑒定新種20個(gè),即Anthracina ramosa、A. saxincola、Bradymyces catenulatus、B. circinatus、B.pullus、B. yunnanensis、 Cladophialophora catenata、C. ellipsoidea、C. volcanica、C. aggregata、Exophiala ellipsoidea、E. indurata、E. clavispora、E. gemmipara、E. multa、Knufia gemmata、K. calcarecola、K. separata、 Trichomerium lapideum和T、cicatrices,并對(duì)每個(gè)物種進(jìn)行了詳細(xì)描述和討論。 4.石生真菌分離頻率及分布。在分離鑒定的石生真菌中,優(yōu)勢(shì)屬是Knufia,常見(jiàn)屬是Bradymyces、Catenulostroma、 Coniosporium、Cladophialophora、Devriesia、Exophiala、Knufia、 Rupestriomyces和Spissiomyces;優(yōu)勢(shì)種是Knufia sp.(8.7%)、Catenulostroma catenulata (5.4%)和Bradymyces pullus (4.2%)。不同地區(qū)優(yōu)勢(shì)種存在差異,如青藏高原優(yōu)勢(shì)種是:Knufia sp.(6.7%), Bradymyces pullus (4.2%)和Exophiala opportunistic (4.1%),東部地區(qū)優(yōu)勢(shì)種是:Catenulostroma catenulata (5.4%), Rupestriomyces torulosus (4.0%)和Trichomerium lapideum (3.8%)。發(fā)現(xiàn)我國(guó)石生真菌具有豐富的物種多樣性。同時(shí)也為深入研究石生真菌抗逆的機(jī)制及資源深入挖掘提供了重要支持。
【關(guān)鍵詞】:子囊菌門(mén) 系統(tǒng)學(xué) 石生真菌 分類(lèi)
【學(xué)位授予單位】:中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類(lèi)號(hào)】:Q939.11
【目錄】:
  • 摘要3-5
  • Abstract5-7
  • 目錄7-9
  • 插圖和附表清單9-12
  • ~.寫(xiě)和主要符號(hào)表12-13
  • 第一章 引言13-27
  • 1.1 石生真菌的研究進(jìn)展13-18
  • 1.1.1 石生真菌的研究歷史13-14
  • 1.1.2 石生真菌的重要性14
  • 1.1.3 石生真菌的生存環(huán)境14-15
  • 1.1.4 石生真菌的生物學(xué)特性15-17
  • 1.1.5 石生真菌的多樣性研究17-18
  • 1.2 石生真菌的分類(lèi)18-25
  • 1.2.1 石生真菌的物種多樣性18-22
  • 1.2.2 石生真菌的分類(lèi)問(wèn)題22
  • 1.2.3 座囊菌綱石生真菌22-24
  • 1.2.4 散囊菌綱石生真菌24-25
  • 1.2.5 星裂菌綱石生真菌25
  • 1.3 研究石生真菌的目的和意義25-27
  • 1.3.1 研究目的25-26
  • 1.3.2 研究意義26-27
  • 第二章 座囊菌綱石生真菌的分類(lèi)學(xué)研究27-71
  • 2.1 前言27
  • 2.2 材料與方法27-33
  • 2.2.1 樣品采集和真菌分離28-30
  • 2.2.2 形態(tài)學(xué)觀察和生長(zhǎng)溫度測(cè)試30-31
  • 2.2.3 DNA提取,PCR擴(kuò)增和測(cè)序31-32
  • 2.2.4 比對(duì)和系統(tǒng)發(fā)育分析32-33
  • 2.3 結(jié)果33-69
  • 2.3.1 Spissionmyces38-42
  • 2.3.2 Rupestriomyces42-46
  • 2.3.3 Cryomyces46-48
  • 2.3.4 Coniosporium48-54
  • 2.3.5 Devriesia54-58
  • 2.3.6 Elasticomyces58-60
  • 2.3.7 Cladosporium60-62
  • 2.3.8 Rachicladosporium62-64
  • 2.3.9 Catenulostroma64-66
  • 2.3.10 Oleoguttula66-68
  • 2.3.11 Phaeothecoidea68-69
  • 2.4 討論69-71
  • 第三章 散囊菌綱石生真菌的分類(lèi)學(xué)研究71-110
  • 3.1 前言71
  • 3.2 材料與方法71-72
  • 3.2.1 樣品采集和真菌分離71
  • 3.2.2 形態(tài)學(xué)觀察和生長(zhǎng)溫度測(cè)試71
  • 3.2.3 DNA提取,PCR擴(kuò)增和測(cè)序71-72
  • 3.2.4 比對(duì)和系統(tǒng)發(fā)育分析72
  • 3.3 結(jié)果72-108
  • 3.3.1 Anthracina77-79
  • 3.3.2 Bradymyces79-84
  • 3.3.3 Trichomerium84-86
  • 3.3.4 Knufia86-92
  • 3.3.5 Exophiala92-104
  • 3.3.6 Cladophialophora104-108
  • 3.4 討論108-110
  • 第四章 中國(guó)石生真菌的分布110-115
  • 4.1 前言110
  • 4.2 材料與方法110
  • 4.3 結(jié)果110-111
  • 4.4 討論111-115
  • 第五章 結(jié)論與展望115-117
  • 5.1 結(jié)論115
  • 5.2 展望115-117
  • 參考文獻(xiàn)117-127
  • 致謝127-128
  • 附錄128-144
  • 作者簡(jiǎn)介144

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 竇傳偉;連賓;;一株巖生真菌對(duì)方解石的風(fēng)化作用[J];礦物學(xué)報(bào);2009年03期

,

本文編號(hào):721145

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