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河南華溪蟹ShToll1和ShToll3對鎘暴露和嗜水氣單胞菌攻毒的免疫應(yīng)答研究

發(fā)布時間:2021-07-23 06:56
  Toll信號通路是無脊椎動物先天性免疫中的重要一環(huán),對于無脊椎動物抵抗細菌、真菌和病毒等感染具有重要作用。雖然,在甲殼動物中已經(jīng)鑒定出一些Toll基因,但是在河南華溪蟹(Sinopotamon henanense)中還沒有發(fā)現(xiàn)。此外,鎘(cadmium,Cd)對Toll基因的影響,在生活于底泥中、易累積重金屬的溪蟹類中尚未見報道。我們對河南華溪蟹肝胰腺組織的轉(zhuǎn)錄組分析發(fā)現(xiàn),Cd暴露使Toll3基因表達降低。因此,本課題將從以下四個方面對河南華溪蟹ShToll1和ShToll3基因在Cd暴露和嗜水氣單胞菌(Aeromonas hydrophila)攻毒的應(yīng)答模式進行研究。主要研究內(nèi)容包括以下四個方面:1.河南華溪蟹ShToll1和ShToll3基因的序列分析與分布模式。通過RACE方法,克隆獲得Shtoll1和Shtoll3基因全長序列;預(yù)測ShToll1和ShToll3的蛋白結(jié)構(gòu)域,分析ShToll1和ShToll3蛋白各功能結(jié)構(gòu)域的特點;同時,構(gòu)建相似物種間的系統(tǒng)發(fā)育進化樹,預(yù)測ShToll1和ShToll3的進化地位,并推測它們的功能。同時,取河南華溪蟹血淋巴、鰓、肝胰腺、中腸、肌... 

【文章來源】:山西大學山西省

【文章頁數(shù)】:123 頁

【學位級別】:博士

【部分圖文】:

河南華溪蟹ShToll1和ShToll3對鎘暴露和嗜水氣單胞菌攻毒的免疫應(yīng)答研究


本學位論文的研究內(nèi)容和研究方法

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河南華溪蟹ShToll1和ShToll3對鎘暴露和嗜水氣單胞菌攻毒的免疫應(yīng)答研究18Shtoll3基因。(a)(b)圖2.1河南華溪蟹Shtoll1(a)和Shtoll3(b)全長序列凝膠電泳1,Shtoll1;2,Shtoll3Figure2.1Gelelectrophoresisresultsoffull-lengthsequenceofShtoll1(a)andShtoll3(b)fromS.henanense1,Shtoll1;2,Shtoll3Shtoll1基因的全長cDNA長度為4746bp,ORF區(qū)3033bp可編碼1011個氨基酸,5’UTR為255bp,3’UTR為1713bp(圖2.2)。氨基酸序列分析表明,ShToll1

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第二章河南華溪蟹Shtoll1和Shtoll3基因的克壟生物信息學分析與組織表達模式19含有一個典型的Toll蛋白結(jié)構(gòu),其中包括:(1)由17個LRR、2個LRRCT和1個LRRNT組成的胞外域(氨基酸144-786);(2)跨膜段(氨基酸794-816);(3)胞內(nèi)TIR結(jié)構(gòu)域(氨基酸846-984)(圖2.3)。在胞外域(圖2.2)中預(yù)測了19個潛在的N-糖基化位點。三維結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果發(fā)現(xiàn),ShToll1可以形成經(jīng)典的U形結(jié)構(gòu),胞外域卷曲并折疊成馬蹄形(圖2.4)。對細胞外LRR結(jié)構(gòu)進行序列圖譜分析,發(fā)現(xiàn)所有LRR結(jié)構(gòu)符合"xLxxLxLxxNxφxxφxxxxFxx"的保守序列模式,其中x表示任何氨基酸,N表示絲氨酸、天冬氨酸、半胱氨酸或蘇氨酸,φ表示任何疏水氨基酸,L和F表示其他疏水氨基酸(圖2.5)。圖2.2河南華溪蟹Shtoll1基因全長序列Figure2.2Full-lengthsequenceofShtoll1fromS.henanense

【參考文獻】:
期刊論文
[1]湖北地區(qū)暴發(fā)病池塘中嗜水氣單胞菌的遺傳多樣性和毒力特征研究[J]. 張旭杰,楊五名,李彤彤,李愛華.  水生生物學報. 2013(03)
[2]中國大陸特有華溪蟹屬分布格局探討(甲殼綱,十足目,溪蟹科)[J]. 陳少華,朱春潮,張小燕,鄒節(jié)新,周憲民.  動物分類學報. 2012(02)
[3]溫度變化對鋸緣青蟹免疫因子的脅迫影響[J]. 丁小豐,楊玉嬌,金珊,王國良.  水產(chǎn)科學. 2010(01)

碩士論文
[1]環(huán)境脅迫對養(yǎng)殖鋸緣青蟹主要免疫因子的影響[D]. 周素琴.中國海洋大學 2006



本文編號:3298841

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