本文關(guān)鍵詞：弱衍射樣品的高分辨成像及衍射增強(qiáng)相干X射線成像方法研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：相比可見(jiàn)光和電子,X射線具有波長(zhǎng)短,穿透能力強(qiáng)等特點(diǎn),是進(jìn)行無(wú)損、高分辨成像的理想光源。隨著x射線光源的發(fā)展,第三代同步輻射在光源亮度和相干性方面有了很大的提升；第四代光源—X射線自由電子激光(XFEL)的建立,不僅進(jìn)一步提高了x射線光源的亮度,實(shí)現(xiàn)了全相干,而且單脈沖的持續(xù)時(shí)間只有飛秒量級(jí),使得無(wú)輻射損傷成像、動(dòng)態(tài)成像和活體成像成為可能。傳統(tǒng)的X射線成像方法大多是基于x射線聚焦透鏡來(lái)成像,如K-B鏡、菲涅爾波帶片等。但是由于x射線難以聚焦,且聚焦元件制備工藝復(fù)雜,因此傳統(tǒng)X射線顯微鏡的成像分辨率與聚焦元件的加工制備精度緊密相關(guān)。近年來(lái),得益于不斷提高的同步輻射光源的亮度和相干性,在x射線晶體學(xué)基礎(chǔ)上發(fā)展出一種新的成像技術(shù)—相干X射線衍射成像(Coherent X-ray diffraction imaging-CDI)。該成像方法擺脫了對(duì)X射線聚焦元件的依賴(lài),成像樣品也不僅限于晶體,還可以對(duì)非晶體樣品進(jìn)行原位定量成像。其原理是使用一束相干x射線照射樣品,利用X射線探測(cè)器收集樣品在遠(yuǎn)場(chǎng)處的相干衍射圖樣,通過(guò)過(guò)度取樣與迭代相結(jié)合的算法對(duì)衍射圖樣進(jìn)行相位恢復(fù)和圖像重建,從而獲取樣品的高分辨圖像。由于成像光路中不使用任何x射線聚焦元件,因此成像分辨率僅與X射線的波長(zhǎng)和衍射角有關(guān),理論上可以達(dá)到原子量級(jí)。目前CDI已經(jīng)被廣泛應(yīng)用于生物學(xué)、物理學(xué)、材料學(xué)等學(xué)科的研究之中。成像方法由最初的平面波CDI不斷發(fā)展出了布拉格CDI、掃描CDI、菲涅爾CDI等多種相干衍射成像方法。在CDI成像分辨率方面,目前通過(guò)K-B鏡聚焦提高x射線亮度的方法,可獲得納米銀顆粒樣品2rnm分辨率的二維投影；采用XFEL-CDI單脈沖成像獲得了納米金顆粒5.5nm的三維圖像。對(duì)于弱衍射生物樣品,由于受到相干散射截面的限制,難以獲取高分辨率的衍射圖樣。而相干衍射成像分辨率最終取決于衍射圖樣的分辨率。為提高衍射圖樣分辨率,增加曝光時(shí)間是一種潛在方式,但對(duì)于生物樣品,長(zhǎng)時(shí)間的曝光勢(shì)必帶來(lái)輻射損傷的問(wèn)題。最新發(fā)展起來(lái)的XFEL-CDI單脈沖成像被證實(shí)能在輻射損傷發(fā)生前記錄下樣品的衍射圖樣,是理想的無(wú)輻射損傷成像方法。目前,生物樣品的XFEL-CDI單脈沖成像分辨率仍然有限,如何提高弱衍射生物樣品單脈沖成像的分辨率也是擺在研究者面前的一個(gè)挑戰(zhàn)。另外,對(duì)于CDI來(lái)說(shuō),一個(gè)高抗噪音和精確的相位恢復(fù)與圖像重建算法對(duì)于提高低信噪比衍射圖樣的相位恢復(fù)和圖像重建質(zhì)量非常重要。由于CDI記錄的是X射線與樣品電子發(fā)生彈性散射產(chǎn)生的衍射圖樣,理論上可以通過(guò)衍射圖樣計(jì)算樣品的電子密度,從而根據(jù)高襯度的密度差異對(duì)樣品的成分和結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析。同時(shí),結(jié)合斷層掃描成像的方法,通過(guò)旋轉(zhuǎn)樣品記錄在不同角度下的衍射圖樣,能夠?qū)崿F(xiàn)在不破壞樣品的情況下研究其三維高分辨結(jié)構(gòu)�；谝陨螩DI成像的優(yōu)勢(shì),以及在弱衍射樣品成像方面需要解決的科學(xué)問(wèn)題和本課題組的研究基礎(chǔ),本論文主要在提高弱衍射樣品成像分辨率、衍射增強(qiáng)成像方法研究以及生物材料的三維高分辨成像方面開(kāi)展了以下工作：(1)通過(guò)優(yōu)化CDI數(shù)據(jù)采集方法,定量研究了單個(gè)弱衍射趨磁細(xì)菌的二維高分辨成像。在實(shí)驗(yàn)中分別收集趨磁細(xì)菌的低分辨衍射圖樣和高分辨衍射圖樣,通過(guò)計(jì)算兩者重疊區(qū)域差異最小值將其最優(yōu)化拼接,最終獲得弱衍射趨磁細(xì)菌的衍射圖樣,并成功將中心衍射數(shù)據(jù)丟失限制在0級(jí)衍射斑以?xún)?nèi)。緊束縛有限空間約束條件的使用,提高了衍射圖樣重建的收斂速度和相位的恢復(fù)精度,獲得了像素分辨率為18.6nm的趨磁細(xì)菌二維重建圖像。根據(jù)衍射圖樣強(qiáng)度與入射X射線亮度之間的關(guān)系,計(jì)算得到趨磁細(xì)菌的質(zhì)量密度約為1.19g/cm3,并根據(jù)定量成像結(jié)果確定了趨磁細(xì)菌內(nèi)部的部分細(xì)胞器結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)了鏈狀分布的磁小體結(jié)構(gòu)。(2) 利用XFEL技術(shù),以金黃色葡萄球菌為模板,研究了用納米金團(tuán)簇標(biāo)定金黃色葡萄球菌來(lái)增強(qiáng)衍射信號(hào)和重建分辨率的XFEL-CDI單脈沖衍射增強(qiáng)成像方法。通過(guò)XFEL單脈沖照射樣品,在輻射損傷發(fā)生前記錄其衍射圖樣,解決了輻射損傷問(wèn)題。采用XFEL-CDI單脈沖分別對(duì)納米金團(tuán)簇標(biāo)定的金黃色葡萄球菌和對(duì)照樣品進(jìn)行成像。標(biāo)定樣品和對(duì)照樣品衍射圖樣的信號(hào)強(qiáng)度和功率譜密度(PSD)曲線的對(duì)比結(jié)果表明,納米金團(tuán)簇的標(biāo)定能夠有效提高生物樣品的衍射信號(hào)強(qiáng)度。采用緊束縛有限空間約束條件分別對(duì)標(biāo)定樣品和對(duì)照樣品的衍射圖樣進(jìn)行了重建。重建圖像的PRTF結(jié)果表明,標(biāo)定樣品重建圖像的分辨率相比對(duì)照樣品提高了2.6倍。結(jié)合理論計(jì)算和實(shí)驗(yàn)結(jié)果,分析討論了納米金團(tuán)簇標(biāo)定提高衍射圖樣信號(hào)強(qiáng)度和重建圖像分辨率的機(jī)理。(3)針對(duì)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)中普遍存在的問(wèn)題,構(gòu)建了抗噪音和中心衍射數(shù)據(jù)丟失的Guided oversampling smoothness (GOSS)相位恢復(fù)與圖像重建算法。將OSS算法中降噪音的高斯濾波器與GHIO算法中的最優(yōu)化引導(dǎo)傳代理論應(yīng)用于HIO算法之中,構(gòu)建了GOSS算法。通過(guò)對(duì)不同噪音以及不同中心衍射數(shù)據(jù)丟失尺寸的模擬衍射圖樣,分別采用HIO、GHIO、OSS及GOSS進(jìn)行圖像重建,其結(jié)果表明：GOSS在抗噪音方面與OSS相當(dāng),在抗中心衍射數(shù)據(jù)丟失、圖像重建一致性以及圖像分辨率方面均優(yōu)于HIO、GHIO和OSS算法。實(shí)驗(yàn)獲取的白色念珠菌細(xì)胞衍射圖樣的HIO、GHIO、OSS和GOSS重建結(jié)果進(jìn)一步證明了GOSS算法在相位恢復(fù)與圖像重建方面的有效性。對(duì)比四種算法重建圖像的PRTF曲線表明,GOSS重建結(jié)果具有最高成像分辨率,GOSS的重建結(jié)果可以分辨出最多的細(xì)胞多構(gòu)。(4)利用三維相干衍射成像方法,研究了不同礦化程度魚(yú)骨組織在納米尺度上的三維結(jié)構(gòu)。通過(guò)實(shí)驗(yàn)分別獲取了高礦化魚(yú)骨組織樣品在0°和±45°的衍射圖樣以及低礦化魚(yú)骨組織樣品在-69.4°到69.4°之間的27幅衍射圖樣。采用抗噪音和抗中心衍射數(shù)據(jù)丟失的GOSS算法,結(jié)合緊束縛有限空間約束條件,對(duì)魚(yú)骨組織樣品進(jìn)行了圖像重建,得到了高礦化和低礦化魚(yú)骨組織樣品的二維圖像,其像素分辨率分別優(yōu)于15nm和26nm。采用等斜率斷層掃描重建算法對(duì)低礦化魚(yú)骨組織樣品的27幅二維投影進(jìn)行了三維重建,得到了樣品高分辨三維結(jié)構(gòu)圖。與二維投影相比,三維成像結(jié)果消除了厚度的影響,可獲得更多的結(jié)構(gòu)信息。
【關(guān)鍵詞】：相干衍射成像 同步輻射與X射線自由電子激光 衍射增強(qiáng) 相位恢復(fù)與圖像重建 三維高分辨成像
【學(xué)位授予單位】：山東大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類(lèi)號(hào)】：O434.1
【目錄】：

• 摘要9-12
• ABSTRACT12-17
• 第一章 緒論17-46
• §1.1 引言17-19
• §1.2 相干X射線衍射成像技術(shù)基本原理19-24
• §1.2.1 X射線光源相干性19-22
• §1.2.2 多種CDI成像技術(shù)原理22-24
• §1.3 相干X射線衍射成像中的相位問(wèn)題及相位恢復(fù)24-29
• §1.3.1 衍射圖樣的相位問(wèn)題24-26
• §1.3.2 過(guò)度取樣理論26-28
• §1.3.3 相位恢復(fù)算法28-29
• §1.4 相干X射線衍射成像技術(shù)最新進(jìn)展29-34
• §1.4.1 CDI在材料研究領(lǐng)域的應(yīng)用及最新進(jìn)展29-31
• §1.4.2 CDI在生物研究領(lǐng)域的應(yīng)用及最新進(jìn)展31-34
• §1.5 CDI發(fā)展中有待解決的問(wèn)題34-35
• §1.6 本論文工作35-37
• 參考文獻(xiàn)37-46
• 第二章 弱衍射趨磁細(xì)菌的相干衍射高分辨定量成像研究46-68
• §2.1 引言46-47
• §2.2 趨磁細(xì)菌樣品制備47-48
• §2.3 相干衍射成像實(shí)驗(yàn)48-51
• §2.4 衍射圖樣的數(shù)據(jù)處理和圖像重建51-56
• §2.4.1 衍射圖樣的數(shù)據(jù)分析及處理51-54
• §2.4.2 衍射圖樣的相位恢復(fù)和圖像重建54-56
• §2.5 趨磁細(xì)菌的定量分析56-62
• §2.5.1 趨磁細(xì)菌的質(zhì)量密度分析57-60
• §2.5.2 重建圖像分辨率分析60-61
• §2.5.3 輻射劑量分析61-62
• §2.6 本章小結(jié)62-64
• 參考文獻(xiàn)64-68
• 第三章 衍射增強(qiáng)的X射線自由電子激光相干衍射單脈沖成像方法探究68-91
• §3.1 引言68-69
• §3.2 衍射增強(qiáng)原理分析69-70
• §3.3 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及數(shù)據(jù)獲取70-75
• §3.3.1 金黃色葡萄球菌培養(yǎng)及納米金團(tuán)簇標(biāo)定71-72
• §3.3.2 XFEL-CDI金黃色葡萄球菌樣品制備72-73
• §3.3.3 實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)收集73-75
• §3.4 衍射圖樣數(shù)據(jù)處理及圖像重建75-80
• §3.4.1 衍射數(shù)據(jù)處理75-77
• §3.4.2 圖像重建77-80
• §3.5 衍射增強(qiáng)分析80-84
• §3.5.1 衍射信號(hào)增強(qiáng)分析81-83
• §3.5.2 分辨率增強(qiáng)分析83-84
• §3.6 本章小結(jié)84-86
• 參考文獻(xiàn)86-91
• 第四章 高抗噪音及中心衍射數(shù)據(jù)丟失的Guided oversampling smoothness(GOSS)相位恢復(fù)算法91-123
• §4.1 引言91-92
• §4.2 HIO、GHIO以及OSS算法介紹92-98
• §4.2.1 HIO算法基本原理及框架92-94
• §4.2.2 GHIO算法基本原理及框架94-96
• §4.2.3 OSS算法基本原理及框架96-98
• §4.3 GOSS算法介紹及性能分析98-115
• §4.3.1 GOSS算法基本原理及框架98-101
• §4.3.2 GOSS算法性能分析101-115
• §4.3.2.1 GOSS算法重建模型101-104
• §4.3.2.2 GOSS重建性能分析104-108
• §4.3.2.3 GOSS抗噪音能力及中心衍射數(shù)據(jù)能力分析108-111
• §4.3.2.4 重建圖像一致性分析111-112
• §4.3.2.5 GOSS重建分辨率分析112-115
• §4.4 GOSS算法在實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)中的應(yīng)用115-118
• §4.5 本章小結(jié)118-120
• 參考文獻(xiàn)120-123
• 第五章 礦化魚(yú)骨組織的三維高分辨相干衍射成像研究123-139
• §5.1 引言123-125
• §5.2 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及數(shù)據(jù)獲取125-127
• §5.2.1 魚(yú)骨組織樣品制備125
• §5.2.2 相干衍射實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)獲取125-127
• §5.3 衍射圖樣數(shù)據(jù)處理及重建127-135
• §5.3.1 礦化魚(yú)骨組織樣品衍射數(shù)據(jù)處理示例127-128
• §5.3.2 高礦化魚(yú)骨組織的二維重建128-131
• §5.3.3 低礦化魚(yú)骨組織的三維重建131-135
• §5.4 本章小結(jié)135-136
• 參考文獻(xiàn)136-139
• 第六章 總結(jié)139-143
• §6.1 結(jié)論139-142
• §6.2 創(chuàng)新點(diǎn)142
• §6.3 有待進(jìn)一步解決的問(wèn)題142-143
• 攻讀學(xué)位期間取得的科研成果143-145
• 攻讀學(xué)位期間參與的科研項(xiàng)目和參加的學(xué)術(shù)會(huì)議145-146
• 攻讀學(xué)位期間獲得獎(jiǎng)項(xiàng)146-147
• 致謝147-149
• 附錄149-160
• 學(xué)位論文評(píng)閱及答辯情況表160

【共引文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：275614