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Ash1L介導神經(jīng)元活性對neurexin-1α的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)

發(fā)布時間:2021-04-10 18:40
  神經(jīng)元可塑性主要通過神經(jīng)元活性對基因表達調(diào)節(jié)實現(xiàn)。受神經(jīng)元活性調(diào)節(jié)的基因包括立即早期基因,如Egr1,Fos和Npas4,常編碼轉(zhuǎn)錄因子,調(diào)節(jié)下游基因的轉(zhuǎn)錄;也包括一些突觸相關基因,如Bdnf,編碼腦源性神經(jīng)營養(yǎng)因子,直接影響神經(jīng)元存活和突觸功能。隨著高通量技術的應用,現(xiàn)已鑒定出很多基因表達受神經(jīng)元活性調(diào)節(jié)。但對調(diào)節(jié)過程的分子機理和表觀遺傳學機制還有待進一步研究。神經(jīng)元neurexin-1α(Nrxn1α)編碼突觸前粘黏蛋白,參與突觸形成和遞質(zhì)傳遞。盡管Nrxn1α突變與孤獨癥譜系障礙和精神分裂癥等神經(jīng)疾病密切相關,目前對其轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)還缺乏認識。本文以Nrxn1α基因為研究對象,發(fā)現(xiàn)短暫的神經(jīng)元活性刺激能夠長時程抑制Nrxn1α基因轉(zhuǎn)錄。為了深入探究這一轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)過程,我們針對Nrxn1α啟動子設計了與之特異結(jié)合的人工鋅指蛋白(GST-ZFP-pnrxn1α)。通過鋅指蛋白下拉實驗,分離并鑒定出生理狀態(tài)下Nrxn1α啟動子區(qū)的結(jié)合蛋白。其中,蛋白組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶Ash1L與Nrxn1α啟動子結(jié)合,介導神經(jīng)元活性對Nrxn1α轉(zhuǎn)錄抑制作用。原代皮層神經(jīng)元中,短暫的神經(jīng)元活性刺激能夠促使Ash1L在Nrxn1α啟動子上富集,增加啟動子區(qū)H3K36me2修飾,進而抑制Nrxn1α基因轉(zhuǎn)錄。而敲除Ash1L的表達,則能夠完全解除該抑制作用。小鼠海馬體中,Ash1L的表達量高于其它腦區(qū)。與WT小鼠相比,Ash1L+/-小鼠海馬體中Ash1L表達缺陷,使得Nrxn1α啟動子區(qū)H3K36me2的修飾減少,Nrxn1α基因的表達量上調(diào),且海馬體CA1紋狀層的突觸密度也顯著增加。Ash1L+/-小鼠具備正常的條件性恐懼學習和記憶能力。但是形成記憶的穩(wěn)定性降低,易受到干擾。在行為上表現(xiàn)為在對不同的環(huán)境的區(qū)辨能力的下降。本論文研究發(fā)現(xiàn),組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶Ash1L介導了神經(jīng)元活性對Nrxn1a基因轉(zhuǎn)錄的長時程抑制作用,揭示了一個全新的,受神經(jīng)元活性調(diào)節(jié)的基因轉(zhuǎn)錄抑制過程,為后續(xù)研究表觀修飾對突觸可塑性基因轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)提供新示例。為深入認識表觀遺傳學調(diào)節(jié)在大腦行使正常功能中的作用具有重要的參考意義。
【學位授予單位】:清華大學
【學位級別】:博士
【學位授予年份】:2016
【分類號】:R338
文章目錄
摘要
Abstract
第1章 前言
    1.1 真核生物基因轉(zhuǎn)錄激活
        1.1.1 真核生物基因組織結(jié)構(gòu)
        1.1.2 真核生物基因轉(zhuǎn)錄激活
    1.2 染色質(zhì)的表觀調(diào)控
        1.2.1 真核生物染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)
        1.2.2 核酸水平的化學修飾
        1.2.3 組蛋白水平的修飾
        1.2.4 染色質(zhì)重塑
        1.2.5 特定染色質(zhì)分離純化和結(jié)合蛋白的鑒定
    1.3 神經(jīng)元活性對基因表達調(diào)節(jié)
        1.3.1 神經(jīng)元活性誘發(fā)Ca2+內(nèi)流
        1.3.2 胞內(nèi)Ca2+介導細胞核基因表達調(diào)節(jié)的信號通路
        1.3.3 神經(jīng)元活性對基因表達調(diào)節(jié)
        1.3.4 神經(jīng)元活性對基因表達的時程調(diào)節(jié)
    1.4 表觀遺傳學在神經(jīng)元活性對基因表達調(diào)節(jié)中的作用
        1.4.1 表觀修飾因子在神經(jīng)元活性依賴的基因表達的作用
        1.4.2 Ash1L參與的組蛋白修飾及基因表達的調(diào)節(jié)
    1.5 Neurexins的生物學功能
        1.5.1 Neurexins蛋白家族的結(jié)構(gòu)
        1.5.2 Neurexins在突觸發(fā)生和突觸傳遞中的作用
        1.5.3 Neurexins在學習記憶中的作用
    1.6 本文的研究目的和主要研究內(nèi)容
第2章 實驗材料與方法
    2.1 實驗材料
        2.1.1 菌株,細胞株和動物材料
        2.1.2 質(zhì)粒載體與病毒
        2.1.3 藥品和試劑
        2.1.4 培養(yǎng)基與溶液配方
        2.1.5 引物序列
    2.2 實驗方法
        2.2.1 載體構(gòu)建
        2.2.2 感受態(tài)細胞熱激轉(zhuǎn)化,重組子篩選和質(zhì)粒提取
        2.2.3 GST融合蛋白的原核表達與純化
        2.2.4 Bradford法測定蛋白質(zhì)濃度
        2.2.5 利用鋅指蛋白分離純化Nrxn1α 啟動子
        2.2.6 串聯(lián)質(zhì)譜鑒定Nrxn1α 啟動子結(jié)合蛋白
        2.2.7 小鼠基因組DNA提取與基因鑒定
        2.2.8 NG細胞株的培養(yǎng)、轉(zhuǎn)染、誘導分化及活性刺激
        2.2.9 小鼠皮層原代培養(yǎng)物的制備、轉(zhuǎn)染與感染及活性刺激
        2.2.10 RNA提取和RT-PCR
        2.2.11 EMSA實驗分析
        2.2.12 Ch IP實驗分析
        2.2.13 SDS-PAGE及銀染
        2.2.14 sg RNA的特外轉(zhuǎn)錄與純化
        2.2.15 原核注射
        2.2.16 熒光素酶雙報告系統(tǒng)分析
        2.2.17 Western blot實驗
        2.2.18 免疫組織染色腦組織切片制備
        2.2.19 免疫組織化學染色
        2.2.20 環(huán)境豐富化訓練
        2.2.21 情景型條件性恐懼記憶測試
        2.2.22 依賴情景型恐懼記憶的分辨能力測試
        2.2.23 依賴線索型恐懼記憶的分辨能力測試
        2.2.24 統(tǒng)計學分析
第3章 Ash1L介導神經(jīng)元活性對Nrxn1α 基因表達抑制
    3.1 引言
    3.2 實驗結(jié)果
        3.2.1 短暫的神經(jīng)元活性刺激引起Nrxn1α 表達長時程抑制
        3.2.2 Nrxn1α 啟動子的分離與結(jié)合蛋白的鑒定
        3.2.3 Nrxn1α 啟動子結(jié)合蛋白的驗證
        3.2.4 神經(jīng)元活性促進Ash1L與Nrxn1α 啟動子的結(jié)合
        3.2.5 Ash1L介導神經(jīng)元活性對Nrxn1α 長時程抑制作用
        3.2.6 Ash1L+/-小鼠制備與鑒定
        3.2.7 Ash1L+/-小鼠海馬體中Nrnx1α 的表達上調(diào)
        3.2.8 敲除Ash1L能夠解除神經(jīng)元活性對Nrnx1α 的抑制作用
        3.2.9 Ash1L+/-小鼠顯示正常學習能力與運動能力
        3.2.10 Ash1L+/-小鼠對恐懼記憶分辨能力缺陷
        3.2.11 Carm1對Nrxn1α 的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)
    3.3 結(jié)論
第4章 討論和展望
    4.1 討論
    4.2 工作展望
參考文獻
致謝
個人簡歷、在學期間發(fā)表的學術論文與研究成果
    個人簡歷
    發(fā)表的學術論文

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本文編號:1911025

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