本文關(guān)鍵詞：擬南芥中MBD7參與調(diào)控ROS1介導(dǎo)的DNA去甲基化機(jī)制的研究，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

《中國農(nóng)業(yè)大學(xué)》 2015年

擬南芥中MBD7參與調(diào)控ROS1介導(dǎo)的DNA去甲基化機(jī)制的研究

王春蕾  

【摘要】：DNA甲基化是動(dòng)植物中重要的表觀修飾,DNA甲基化通過建立、維持和去除而動(dòng)態(tài)變化。DNA甲基化的動(dòng)態(tài)變化增強(qiáng)了動(dòng)植物基因組的可塑性,使生物體能順利地生長繁殖和更好地適應(yīng)環(huán)境變化。擬南芥中已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的DNA去甲基化酶主要是ROSl及其同源蛋白DME、DML2(?)DML3,但它們是如何被特異招募到作用位點(diǎn)上的,目前還不是很清楚。 本研究使用穩(wěn)定表達(dá)ro35S::NPTII和proRD29A::LUC的擬南芥C24轉(zhuǎn)基因株系作為野生型。之前通過對C24野生型進(jìn)行EMS誘變,篩選pro35S::NPTII沉默的突變體,我們得到編碼釋放基因沉默的DNA去甲基化酶ROS1,以及其它釋放基因沉默的多種蛋白,包括ROS4/IDM1和ROS5/TDM2。ROS4/IDM1是組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶,通過促進(jìn)ROS1的功能參與DNA去甲基化；ROS5/IDM2是小熱激蛋白,通過與ROS4/IDM1和ROS1形成復(fù)合體,參與DNA去甲基化。本研究發(fā)現(xiàn)了另一個(gè)參與DNA去甲基化過程的MBD家族蛋白MBD7(METHYL-CpG-BINDING DOMAIN7).報(bào)道稱MBD7定位在擬南芥細(xì)胞核里的染色中心上。通過全基因組亞硫酸氫鹽測序發(fā)現(xiàn),mbd7突變體中pro35S::NPTII轉(zhuǎn)基因位點(diǎn)3’端NOS區(qū)的甲基化明顯上升,暗示MBD7可能是通過DNA去甲基化作用調(diào)控pro35S::NPTII轉(zhuǎn)基因位點(diǎn)的表達(dá)。同時(shí)發(fā)現(xiàn),MBD7不影響基因組整體水平的DNA甲基化狀態(tài),但在mbd7突變體中鑒定到2664個(gè)甲基化升高的DMR(Differentially Methylated Region)位點(diǎn),表明MBD7能在基因組特定位點(diǎn)上參與DNA的去甲基化過程。將mbd7突變體中的甲基化升高位點(diǎn)比對到擬南芥的五條染色體上,發(fā)現(xiàn)MBD7調(diào)控的位點(diǎn)主要分布在著絲粒區(qū)域。 通過體外的酵母雙雜、pull-down和體內(nèi)的Co-IP等實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),MBD7能與ROS5/IDM2相互作用。通過亞硫酸氫鹽測序發(fā)現(xiàn),在ROS5/IDM2調(diào)控的部分內(nèi)源位點(diǎn)上,mbd7突變體中的DNA甲基化水平也升高,并且ros5-1mbd7雙突變體中的DNA甲基化水平與單突變體相比沒有加強(qiáng)作用,暗示MBD7和ROS5/IDM2可能通過同一條通路參與DNA去甲基化。通過進(jìn)一步分析全基因組亞硫酸氫鹽測序數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn),在mbd7、rosl-l、ros4和ros5-1突變體中有一些甲基化共同升高的位點(diǎn)。以上結(jié)果暗示MBD7、ROS1、ROS4/IDM1和ROS5/IDM2共同參與DNA去甲基化過程。MBD7是擬南芥中能特異結(jié)合CG甲基化位點(diǎn)的MBD家族成員。通過染色質(zhì)免疫共沉淀實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)MBD7能特異結(jié)合mbd7突變體中DNA甲基化升高的DMR位點(diǎn),并且MBD7所結(jié)合的位點(diǎn)有高度密集分布的甲基化修飾。 以上實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,MBD7能特異結(jié)合甲基化高度密集分布的位點(diǎn),通過與ROS5/IDM2互作,最終招募ROS1,進(jìn)而參與DNA去甲基化過程。這些發(fā)現(xiàn)有助于我們更深入地了解植物中DNA去甲基化的作用機(jī)制,并增進(jìn)對植物MBD蛋白家族參與表觀修飾機(jī)制的認(rèn)識。

【關(guān)鍵詞】：
【學(xué)位授予單位】：中國農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號】：Q943.2
【目錄】：

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2 蔣舫瑋;徐曉峰;崔香環(huán);杜喜玲;祝建;;DRM1,DRM2參與擬南芥愈傷組織的形成[J];電子顯微學(xué)報(bào);2014年01期

3 Hélène Léger;Caroline Smet-Nocca;Amel Attmane-Elakeb;Sara Morley-Fletcher;Arndt G.Benecke;Sebastian Eilebrecht;;A TDG/CBP/RARα Ternary Complex Mediates the Retinoic Acid-dependent Expression of DNA Methylation-sensitive Genes[J];Genomics,Proteomics & Bioinformatics;2014年01期

4 張霹雲(yún);王斌;王軍;魏艷玲;孫文靜;吳林;羅茜;陳東風(fēng);;5-甲基胞嘧啶羥化酶TET1在肝再生時(shí)卵圓細(xì)胞向肝細(xì)胞分化過程中的作用[J];第三軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào);2014年08期

5 周貝貝;陳凌娜;張俊佩;裴東;;核桃MSAP試驗(yàn)體系建立及引物篩選[J];河北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào);2014年02期

6 郭有;高艷芳;胡恭華;;肝細(xì)胞癌表觀遺傳發(fā)病機(jī)制的研究進(jìn)展[J];重慶醫(yī)學(xué);2014年16期

7 梁喜龍;李國蘭;崔洪秋;鞠世杰;洪艷華;方淑梅;鄭殿峰;;大豆DNA去甲基化酶ROS1的生物信息學(xué)分析[J];大豆科學(xué);2014年03期

8 Pei Liu;Xiao-Hai Yang;Qing Wang;Jing Huang;Jian-Bo Liu;Ying Zhu;Lei-Liang He;Ke-Min Wang;;Sensitive detection of DNA methyltransferase activity based on rolling circle amplification technology[J];Chinese Chemical Letters;2014年07期

9 方淑梅;韓毅強(qiáng);張文慧;洪艷華;李丹丹;范金輝;梁喜龍;;大豆DNA去甲基化酶IDM1基因5'調(diào)控區(qū)生物信息學(xué)分析[J];大豆科學(xué);2014年04期

10 陳曉娟;閆少春;邵國;;人DNA甲基化轉(zhuǎn)移酶的分類及其功能[J];包頭醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào);2014年04期

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1 張紅宇;雙胚苗水稻中單倍體與二倍體表型和基因表達(dá)的差異分析[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2006年

2 彭海;SARⅡ-628雙胚苗水稻自然同源三倍化后DNA甲基化與基因表達(dá)的研究[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2006年

3 羅岸;煙草早期胚胎發(fā)生中印跡基因的篩選與分析[D];武漢大學(xué);2013年

4 鄧蘊(yùn)彥;藍(lán)光誘導(dǎo)海帶幼孢子體轉(zhuǎn)錄譜變化的研究[D];中國科學(xué)院研究生院（海洋研究所）;2013年

5 申晚霞;植物病毒衛(wèi)星RNA干擾其輔助病毒致病性的分子機(jī)理[D];西南大學(xué);2013年

6 黨振華;阿拉善荒漠區(qū)珍稀泌鹽植物長葉紅砂響應(yīng)鹽脅迫的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究[D];內(nèi)蒙古大學(xué);2013年

7 李琳;1、多灶肺癌的基因組學(xué)研究2、EMP2基因在非小細(xì)胞肺癌腫瘤轉(zhuǎn)移中的作用[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2013年

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9 郭娜;大豆miRNA的鑒定與在抗疫霉根腐病中的功能分析[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2011年

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2 楊慧軍;鹽漬條件下雙胚苗水稻同源3N和2N基因組DNA甲基化研究[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2008年

3 劉昊英;兩個(gè)小麥MBD基因的克隆、植物表達(dá)載體的構(gòu)建及遺傳轉(zhuǎn)化[D];河南農(nóng)業(yè)大學(xué);2009年

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5 張問;小麥甲基結(jié)合蛋白TaMBD1的體外表達(dá)及互作蛋白分析[D];河南農(nóng)業(yè)大學(xué);2010年

6 黃立群;SO_2誘導(dǎo)擬南芥抗逆相關(guān)miRNA轉(zhuǎn)錄響應(yīng)[D];山西大學(xué);2012年

7 劉登念;水稻染色質(zhì)變構(gòu)因子DDM1和CHR729的功能研究[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2012年

8 張艷霞;水稻甲基結(jié)合蛋白MBD701的克隆、植物表達(dá)載體的構(gòu)建及遺傳轉(zhuǎn)化[D];河南農(nóng)業(yè)大學(xué);2011年

9 賈海英;小麥TaMBD6-A、TaMBD6-B和TaMBD6-D基因的克隆及表達(dá)分析[D];河南農(nóng)業(yè)大學(xué);2012年

10 凌娜;小麥TaMBD2基因的全長cDNA克隆及互作蛋白的篩選[D];河南農(nóng)業(yè)大學(xué);2011年

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1 紀(jì)軍,楊瑞馥;電化學(xué)生物傳感器快速檢測DNA研究進(jìn)展[J];生物技術(shù)通訊;2002年02期

2 王志軍,袁正宏,聞?dòng)衩?DNA的電荷轉(zhuǎn)移[J];生命的化學(xué);2003年05期

3 冀海偉,劉道杰;卟啉試劑在DNA檢測中的應(yīng)用[J];化學(xué)試劑;2005年02期

4 ;Study on the binding mode of Mg(Sal_2trien) with DNA[J];Chinese Science Bulletin;2006年19期

5 劉孟黎;韋小謙;;兩種DNA抽提方法的操作過程及影響因素分析[J];現(xiàn)代檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志;2006年05期

6 ;Effect of Concentration of DNA in DNA Damage Induced by γ-ray[J];Annual Report of China Institute of Atomic Energy;2006年00期

7 ;Effect of Dose Rate in DNA Damage Induced by γ-ray[J];Annual Report of China Institute of Atomic Energy;2006年00期

8 焦鵬;葉文靜;常起;趙曉民;;從血液中提取DNA方法探討[J];實(shí)用醫(yī)技雜志;2007年03期

9 楊同文;朱自學(xué);;廚房中粗提DNA[J];生物學(xué)通報(bào);2007年03期

10 ;科學(xué)家確定一種新的與DNA復(fù)制相關(guān)的酶[J];廣西科學(xué);2008年01期

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1 梁金玲;吳玲玲;周劍章;林仲華;;電化學(xué)石英晶體微天平研究DNA的控電位雜交[A];第十三次全國電化學(xué)會(huì)議論文摘要集（下集）[C];2005年

2 范新萍;;孕婦外周血中游離DNA的分級分離方法初探[A];第五次全國中青年檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2006年

3 鄭利雄;李放娟;吳育慶;張桂梅;何桂蕎;熊峰;;熒光定量PCR法在檢測梅毒血清TP-DNA中的應(yīng)用[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)第十二次全國皮膚性病學(xué)術(shù)會(huì)議論文集[C];2006年

4 邵勇;劉亭麗;張罡棋;朱曉青;;基于脫堿基位點(diǎn)設(shè)計(jì)的DNA單核苷多型的小分子識別研究[A];中國化學(xué)會(huì)第十五屆全國有機(jī)分析及生物分析學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2009年

5 關(guān)明;;高分辨熔解技術(shù)在分子檢驗(yàn)中的應(yīng)用[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)第八次全國檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議暨中華醫(yī)學(xué)會(huì)檢驗(yàn)分會(huì)成立30周年慶典大會(huì)資料匯編[C];2009年

6 ;DNA G-quadruplexes as potential anticancer drug targets[A];第一屆全國生物物理化學(xué)會(huì)議暨生物物理化學(xué)發(fā)展戰(zhàn)略研討會(huì)論文摘要集[C];2010年

7 張新躍;;牧草DNA基因多態(tài)性研究與在草業(yè)中的應(yīng)用[A];中國草學(xué)會(huì)飼料生產(chǎn)專業(yè)委員會(huì)第十六次學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2011年

8 Michael M.Yang;;FABRICATION OF DNA CHIPS FOR DIAGNOSTIC AND ENVIRONMENTAL APPLICATIONS[A];首屆粵港生物物理學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];1999年

9 鄧用川;陳菊培;羅越華;李冠一;林棲鳳;;紅樹DNA導(dǎo)入水稻引起的變異[A];植物分子育種——第四屆全國植物分子育種學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2004年

10 李延;張成孝;;電化學(xué)發(fā)光檢測DNA的初步研究[A];中國化學(xué)會(huì)第十屆膠體與界面化學(xué)會(huì)議論文摘要集[C];2004年

中國重要報(bào)紙全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 記者 徐敏;[N];解放日報(bào);2005年

2 劉工;[N];經(jīng)濟(jì)參考報(bào);2002年

3 北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 侯巧明;[N];計(jì)算機(jī)世界;2001年

4 陳丹;[N];科技日報(bào);2001年

5 郭朝元;[N];民營經(jīng)濟(jì)報(bào);2005年

6 本報(bào)記者 翟永太 聶同鋼;[N];人民公安報(bào);2006年

7 張夢然;[N];科技日報(bào);2008年

8 韓梁;[N];新華每日電訊;2009年

9 記者 鄭曉春;[N];科技日報(bào);2009年

10 記者 王艷紅;[N];新華每日電訊;2001年

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1 李艷偉;DNA條形碼在中國榕小蜂中的應(yīng)用研究[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2009年

2 張鳳梅;石英致DNA雙鏈斷裂修復(fù)的DNA-PKcs/JNK/p53信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路[D];中國疾病預(yù)防控制中心;2009年

3 蔡宏;新型DNA電化學(xué)生物傳感器的研制及納米材料在其中的應(yīng)用研究[D];華東師范大學(xué);2003年

4 李雪梅;含N化合物的合成、表征及與DNA作用機(jī)理的電化學(xué)研究[D];青島科技大學(xué);2006年

5 梁樂;功能DNA納米結(jié)構(gòu)在生物成像中的應(yīng)用[D];中國科學(xué)院研究生院（上海應(yīng)用物理研究所）;2014年

6 王延峰;DNA計(jì)算中的編碼理論與方法研究[D];華中科技大學(xué);2007年

7 蔣偉;銅鋅超氧化物歧化酶的核酸酶活性和DNA對其聚集的加速作用[D];華中科技大學(xué);2007年

8 魯衛(wèi)平;DNA生物傳感器快速檢測病原微生物的實(shí)驗(yàn)研究[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2009年

9 樊浩;DNA電化學(xué)生物傳感器中的新方法學(xué)研究[D];華東師范大學(xué);2010年

10 周劍章;分子自組裝固定DNA和DNA與其他分子的相互作用及應(yīng)用[D];廈門大學(xué);2001年

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1 陳雪姣;釕多吡啶配合物與DNA/RNA的鍵合機(jī)理及其抗腫瘤活性研究[D];湘潭大學(xué);2010年

2 王平紅;一些金屬配合物與DNA相互作用研究[D];海南大學(xué);2006年

3 郭愛敏;DNA分子電子結(jié)構(gòu)及輸運(yùn)性能的研究[D];中南大學(xué);2007年

4 李春宏;DNA甲基化檢測方法的建立和廣西巴馬縣人群白細(xì)胞DNA總體甲基化水平研究[D];廣西醫(yī)科大學(xué);2008年

5 羅興;基于DNA自組裝模型的最大團(tuán)問題研究[D];湖南大學(xué);2012年

6 楊青喜;一種高效檢測石蠟切片中的DNA的方法研究[D];長春理工大學(xué);2013年

7 馮媛媛;聚苯胺及其衍生物復(fù)合納米材料在DNA電化學(xué)生物傳感器中的應(yīng)用[D];青島科技大學(xué);2009年

8 趙劍;基于企業(yè)DNA視角的企業(yè)進(jìn)化機(jī)制研究[D];陜西科技大學(xué);2010年

9 史庭燕;樹狀DNA放大技術(shù)在臨床基因診斷中的應(yīng)用[D];東南大學(xué);2004年

10 楊培菊;金屬配合物與DNA的相互作用[D];西北師范大學(xué);2005年

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