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細胞內新生成蛋白及特定脂或酸的成像分析

發(fā)布時間:2017-12-24 02:20

  本文關鍵詞:細胞內新生成蛋白及特定脂或酸的成像分析 出處:《南京大學》2016年博士論文 論文類型:學位論文


  更多相關文章: 新生成蛋白 磷脂 脂肪酸 TOF-SIMS 抗體 熒光成像 FRET click 單細胞分析


【摘要】:蛋白質是各種生命功能的真正執(zhí)行者、直接參與者,在維持細胞平衡和各種細胞活動中發(fā)揮著巨大作用。而了解蛋白質與其它小分子如磷脂、脂肪酸的相互作用關系能更深入了解蛋白質在各種生命過程中的作用。許多病變如癌癥、老年癡呆癥和肌萎縮側索硬化癥跟某些特定新生成蛋白有密切關系。因此在時空上反應新生成蛋白和特定小分子的關系和追蹤特定新生成蛋白的分布對理解治療特定疾病有重大意義。然而,目前的常規(guī)熒光成像方法能對新生成蛋白進行較好成像,但很難實現(xiàn)新生成蛋白和其它小分子的同時成像,而且在追蹤內源性特定新生成蛋白上取得的進展較少,也存在假陽性信號較多的問題。因此,發(fā)展一種能原位同時可視化新生成蛋白和脂類或者可視化特定新生成內源性蛋白的方法顯得尤為迫切;诖,本論文將SLIAC或者click標記技術跟TOF-SIMS或熒光成像技術相結合,構建了2個能同時成像新生成蛋白和脂類小分子的分析體系和1個能成像新生成特定內源性蛋白的系統(tǒng),主要研究內容如下:1.細胞內新生成蛋白和特定磷脂的同時質譜成像研究結合TOF-SIMS成像和SILAC標記新生成蛋白的優(yōu)勢,通過摻入含’5N的精氨酸和賴氨酸到新合成蛋白中,利用TOF-SIMS檢測精氨酸和賴氨酸’5N的特征碎片峰來成像新生成蛋白。我們對精氨酸和賴氨酸在儀器不同模式下的主要特征峰的靈敏度和信噪比進行比較,發(fā)現(xiàn)不同的特征峰靈敏度和信噪比差別較大。我們通過檢測不同時間段新合成的蛋白及用15N的特征峰與相對應的’4N的特征峰的比值,能對新生成蛋白進行相對定量。由于TOF-SIMS特別適合檢測磷脂的一些特征峰,因此我們在成像新生成蛋白的同時還能成像磷脂。此外,還利用氬團簇離子(Ar 3500+ gas cluster ion)濺射細胞,得到細胞的3D成像。我們研究了細胞分裂過程中G1末期到M中期新生成蛋白和特定磷脂分布,發(fā)現(xiàn)了蛋白和磷脂在收縮環(huán)中分布的差異。因此,該方法為在生物樣品中成像新生成蛋白和磷脂提供了新的途徑。2.細胞內新生成蛋白和特定脂肪酸的同時質譜成像研究基于click反應構建了一種同時成像細胞內新生成蛋白和特定脂肪酸的新方法。首先加入含疊氮的氨基酸,使其替代甲硫氨酸摻入到新生成的蛋白中,然后通過疊氮與炔基之間的click反應接上溴或者碘原子,利用TOF-SIMS檢測溴或者碘的信號來成像新生成蛋白。同時TOF-SIMS對某些特定脂肪酸或者核酸特征峰有較高靈敏度,可以實現(xiàn)新生成蛋白和特定脂肪酸或核酸的同時檢測。該方法有望應用于檢測細胞的某些特定活動中新生成蛋白和脂肪酸或核酸相互作用的關系。3.細胞內新生成特定蛋白的熒光成像研究基于熒光共振能量轉移(FRET)的策略構建了一種成像新生成的特定內源性蛋白的方法:利用click反應在新生成蛋白里接上受體,再通過抗體在特定蛋白上接上供體,通過FRET信號去檢測新生成特定蛋白。首先我們發(fā)現(xiàn)相比三通道法,光漂白法和FLIM-FRET方法有更高的靈敏度。然后我們應用光漂白法和FLIM-FRET方法在不同的細胞系中檢測了新生成的TDP-43、tubulin、Camk2a蛋白。理論上,只要有感興趣蛋白的抗體,通過這種FRET和FLIM-FRET策略就能研究該新生成蛋白的分布情況。因此,該方法為細胞內追蹤新生成特定蛋白合成、轉運提供了新的思路,并有望應用于研究各種疾病中相關蛋白。
【學位授予單位】:南京大學
【學位級別】:博士
【學位授予年份】:2016
【分類號】:Q26

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