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基于CE-MS的代謝組學(xué)分析新方法及其在煙葉研究中的應(yīng)用

發(fā)布時間:2017-12-22 22:03

  本文關(guān)鍵詞:基于CE-MS的代謝組學(xué)分析新方法及其在煙葉研究中的應(yīng)用 出處:《大連理工大學(xué)》2016年博士論文 論文類型:學(xué)位論文


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【摘要】:植物代謝組學(xué)是一門從整體上研究植物受環(huán)境或基因擾動后其內(nèi)源性代謝物變化的科學(xué)。植物擁有比其他物種更為復(fù)雜多樣的代謝物,因而,如何精準又全面地獲得代謝組的信息,給分析方法提出了極大挑戰(zhàn)。質(zhì)譜是代謝組學(xué)最有用的分析工具,但單一分析技術(shù)和單一組學(xué)平臺已不能滿足植物功能研究的要求,亟待發(fā)展基于多平臺多組學(xué)的整合代謝組學(xué)方法。針對上述挑戰(zhàn),本論文基于毛細管電泳質(zhì)譜技術(shù)(CE-MS),旨在發(fā)展改進代謝物分析覆蓋度的新方法,并同時用于模式植物煙草的研究。(1)針對植物中重要硫代謝通路,采用毛細管電泳連續(xù)多進樣方式結(jié)合大體積進樣在線富集技術(shù),建立了高通量高靈敏度CE-MS靶向方法,并將其應(yīng)用于煙草和細胞樣品的分析。該方法實現(xiàn)了同時優(yōu)化多個實驗條件,有效地降低方法學(xué)開發(fā)時間,比傳統(tǒng)CE-MS方法通量提高5倍,靈敏度提高14.4-33.1倍,該方法可作為研究重要硫代謝通路的有效方法。(2)為了進一步擴大極性代謝組檢測覆蓋度,利用實驗設(shè)計理論優(yōu)化了煙草極性代謝組提取體系,建立了基于CE-MS的非靶向煙草代謝組學(xué)分析方法。采用該方法從煙草提取液中共鑒定出154個極性代謝物,包括氨基酸、有機酸、核苷、維生素和輔酶等。結(jié)果表明,該方法具有預(yù)處理簡單,重復(fù)性好,極性代謝組覆蓋度高等特點,非常適合煙草極性代謝組研究。(3)基于CE-MS和GC-MS良好的互補性,建立了多平臺整合的極性代謝組分析方法。將其應(yīng)用于三個典型種植產(chǎn)區(qū)煙草代謝研究,在煙草葉片中共鑒定出240個極性代謝物。進而通過差異代謝物關(guān)聯(lián)網(wǎng)絡(luò)拓撲結(jié)構(gòu)表明碳氮代謝分配和轉(zhuǎn)化規(guī)律與煙草的地域特色顯著相關(guān)。為了進一步明確代謝調(diào)控規(guī)律,對顯著相關(guān)的代謝通路進行深入分析,發(fā)現(xiàn)與河南產(chǎn)區(qū)相比,云南和貴州產(chǎn)區(qū)的成熟期中部葉片均具有較高氮素水平和三羧酸循環(huán)呼吸作用,但二者三羧酸循環(huán)底物和氮素轉(zhuǎn)化分配途徑不同;與河南和貴州產(chǎn)區(qū)相比,云南產(chǎn)區(qū)具有較強的光合能力和氮代謝能力;河南產(chǎn)區(qū)與其它兩地相比,戊糖磷酸代謝途徑和莽草酸代謝途徑中間體相互關(guān)聯(lián)緊密。(4)針對單一分析平臺、單一組學(xué)在生物功能研究中的局限性,建立了整合代謝組學(xué)分析方法。采用基于擬靶向和靶向GC-MS、非靶向和靶向LC-MS/UV以及非靶向CE-MS多平臺代謝組學(xué)分析方法,開展了煙草葉片對重要農(nóng)藝措施打頂?shù)膽?yīng)答機制研究。多平臺代謝組學(xué)分析方法在煙草葉片中共鑒定出367個代謝物,涉及煙草的主要初生、次生代謝途徑。結(jié)果表明,打頂對上部葉片影響較大,且上部葉代謝表型在打頂后初期和成熟期具有顯著不同的變化規(guī)律。進一步將代謝組學(xué)與轉(zhuǎn)錄組學(xué)整合,研究上部葉在打頂后不同時間點的應(yīng)答機制。與對照組比較,打頂初期上部葉片膜脂重組,光合能力以及碳固定能力增強,煙堿迅速積累;打頂改變了煙草葉片中營養(yǎng)分配,延緩了葉片衰老,增加了次生代謝產(chǎn)物在成熟期上部葉的積累。該研究結(jié)果表明基于多平臺、多組學(xué)的整合煙草代謝組學(xué)方法,可系統(tǒng)、深入地從分子水平闡釋打頂?shù)膽?yīng)答機制。
【學(xué)位授予單位】:大連理工大學(xué)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:Q946

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本文編號:1321201

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