本文關(guān)鍵詞：宏分類組學(xué)分析青藏高原禿鷲腸道菌群及放線菌新種的發(fā)現(xiàn)

  更多相關(guān)文章： 舊大陸禿鷲 宏分類組學(xué) 菌群 產(chǎn)氣莢膜梭菌 放線菌

【摘要】：禿鷲(vulture)是一種在我國青藏高原常見且主要的兇禽。以動物尸體為主要食物,還是天葬活動的重要參與者。可能會進(jìn)食因傳染病而死亡的人或動物的尸體。因此,禿鷲可能攜帶和傳播對其自身不致病,但對其它動物和人致病的病原體。本研究建立了宏分類組學(xué)(metataxonomics):利用三代高通量測序獲得近似16SrRNA基因全長序列,采用系統(tǒng)發(fā)生操作單元(Operational Phylogenetic Unit,OPU)分析方法,將眾多OPUs鑒定到“種”水平,以研究細(xì)菌菌群多樣性。我們采集的9只禿鷲的腸道糞便樣本,此9只禿鷲涵蓋了青藏高原舊大陸禿鷲的三個物種(高山禿鷲,胡禿鷲,禿鷲)。共得到54,135條高質(zhì)量16SrRNA基因序列,平均每個樣本6,015±1,058條序列,每條序列平均長度1,442 ±6.9 bp。這些序列被劃分為314個OPUs。其中,102個OPUs為已知細(xì)菌種,50個尚未被描述的細(xì)菌種,161個uncultured細(xì)菌。102個已知種中,有45個種是具有醫(yī)學(xué)意義的細(xì)菌;50個尚未被描述的種中,23個屬于包含致病菌的細(xì)菌屬中。所有314個OPUs中,6個OPUs存在于所有禿鷲樣本中。禿鷲腸道菌群中豐度最高的是產(chǎn)氣莢膜梭菌(Clostridium perfringens)沿在所有禿鷲樣本中所占比例高達(dá)30.8%。從禿鷲腸道樣本中分離培養(yǎng)得到了 107株產(chǎn)氣莢膜梭菌,MLST分析顯示共有45個ST型,本研究顯示禿鷲可能是土壤相關(guān)的產(chǎn)氣莢膜梭菌以及其他病原菌的攜帶源。同時,從禿鷲腸道樣本中分離到了三個放線菌新種,分別命名為Actinomyces vulturis,A.liubingyangii,以及一個尚未命名的新種a.sp.VUL4_3。用相似的分離培養(yǎng)方法從鼠兔糞便樣本中分離到一個放線菌新種,命名為A.gaoshouyii。
【學(xué)位授予單位】：中國疾病預(yù)防控制中心
【學(xué)位級別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號】：R37

【相似文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 鄧光貴;孫貫一;耿波;朱旭東;;豚鼠產(chǎn)氣莢膜梭菌感染傷口的α毒素檢測[J];創(chuàng)傷雜志;1990年01期

2 曾東;鄭曉麗;倪學(xué)勤;Joshua Gong;;四川地區(qū)雞場產(chǎn)氣莢膜梭菌的擴(kuò)增片段長度多態(tài)性分析[J];中國人獸共患病學(xué)報;2009年11期

3 董衛(wèi)超;劉凌;杜向黨;;動物源產(chǎn)氣莢膜梭菌耐藥性的研究進(jìn)展[J];中國人獸共患病學(xué)報;2012年11期

4 顧其芳;;食品中產(chǎn)氣莢膜梭菌檢測新方法探索[J];中國衛(wèi)生檢驗雜志;1993年02期

5 趙海潮,車應(yīng)龍,曾桂茹,何代平,鄒開勇;西藏地區(qū)產(chǎn)氣莢膜梭菌的初步分型[J];中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志;1996年01期

6 夏式X&,蘇堰,趙太銑,王采先,張玉換,趙西林,張晉萍;A型產(chǎn)氣莢膜梭菌對13種抗菌藥物的敏感性試驗[J];中國人獸共患病雜志;1986年05期

7 梁光軍,趙李祥,楊旭芹,賈紅,張小榮,文其乙,劉秀梵;應(yīng)用多重PCR方法鑒定糞樣和食品中分離的產(chǎn)氣莢膜梭菌[J];中國人獸共患病雜志;2005年05期

8 唐玲玲;石玉玲;;產(chǎn)氣莢膜梭菌實驗室診斷方法綜述[J];熱帶醫(yī)學(xué)雜志;2012年03期

9 楊毓環(huán);陳偉偉;洪錦春;張巧姬;;從鴨羽為原料的水洗羽毛制品中分離到產(chǎn)氣莢膜梭菌[J];中國衛(wèi)生檢驗雜志;2007年02期

10 Bartholomew BA;鄒放;;產(chǎn)氣莢膜梭菌腸毒素概述[J];國外醫(yī)學(xué)(衛(wèi)生學(xué)分冊);1986年02期

中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 王海榮;呂長輝;趙凱;柴同杰;陸承平;;山東省兔腹瀉病例產(chǎn)氣莢膜梭菌的分離及基因定型[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會動物傳染病學(xué)分會第十二次人獸共患病學(xué)術(shù)研討會暨第六屆第十四次教學(xué)專業(yè)委員會論文集[C];2012年

2 么宏強(qiáng);蘇佳;于立新;馬學(xué)恩;;A型產(chǎn)氣莢膜梭菌α毒素的提純鑒定及其基因的克隆[A];2012年中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會獸醫(yī)病理學(xué)分會暨中國病理生理學(xué)會動物病理生理專業(yè)委員會學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2012年

3 田冬青;蔣玉文;陳小云;楊京嵐;丁家波;;產(chǎn)氣莢膜梭菌多重PCR定型方法的建立[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會2006學(xué)術(shù)年會論文集（下冊）[C];2006年

4 李娜;吳建勇;李建軍;楊學(xué)云;王登峰;段新華;王治才;;D型產(chǎn)氣莢膜梭菌α毒素基因的克隆與高效表達(dá)[A];生態(tài)環(huán)境與畜牧業(yè)可持續(xù)發(fā)展學(xué)術(shù)研討會暨中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會2012年學(xué)術(shù)年會和第七屆全國畜牧獸醫(yī)青年科技工作者學(xué)術(shù)研討會會議論文集——T07家畜微生態(tài)與健康養(yǎng)殖專題[C];2012年

5 許崇利;歐陽紅生;許崇波;張艷平;;乳糖誘導(dǎo)劑對重組C型產(chǎn)氣莢膜梭菌α毒素基因表達(dá)的影響[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會動物傳染病學(xué)分會第十二次人獸共患病學(xué)術(shù)研討會暨第六屆第十四次教學(xué)專業(yè)委員會論文集[C];2012年

6 王光華;周繼章;藺國珍;鄭福英;曹小安;韓文祥;楊良存;宋竹青;邱昌慶;;產(chǎn)氣莢膜梭菌青海分離株α毒素基因克隆與核苷酸序列分析[A];第九屆中國生物毒素學(xué)術(shù)研討會論文摘要[C];2009年

7 梁光軍;趙李祥;楊旭芹;賈紅;張小榮;文其乙;劉秀梵;;應(yīng)用多重PCR方法鑒定糞樣和食品中產(chǎn)氣莢膜梭菌[A];人畜共患傳染病防治研究新成果匯編[C];2004年

8 許崇波;陳向東;許崇利;逄越;高鳳山;;C型產(chǎn)氣莢膜梭菌α、β1、β2基因融合[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會動物傳染病學(xué)分會第三屆豬病防控學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2008年

9 裴鳴;張和平;唐昌茂;史寧花;孔芳玲;于維東;白慧勤;馬遠(yuǎn)征;;家畜產(chǎn)氣莢膜梭菌病的病理形態(tài)學(xué)觀察[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會獸醫(yī)病理學(xué)分會第十一次獸醫(yī)病理學(xué)、第十次動物病理生理學(xué)學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2001年

10 李潔萍;倪學(xué)勤;曾東;劉麗達(dá);魏豪;;體外篩選拮抗產(chǎn)氣莢膜梭菌的雞源乳酸桿菌[A];第四屆第十次全國學(xué)術(shù)研討會暨動物微生態(tài)企業(yè)發(fā)展戰(zhàn)略論壇論文集（上冊）[C];2010年

中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前5條

1 孟祥莉;宏分類組學(xué)分析青藏高原禿鷲腸道菌群及放線菌新種的發(fā)現(xiàn)[D];中國疾病預(yù)防控制中心;2017年

2 王光華;產(chǎn)氣莢膜梭菌的分子診斷與免疫研究[D];中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2010年

3 蔡玉梅;山東省四大湖（庫）淡水魚產(chǎn)氣莢膜梭菌毒素型調(diào)查及致病機(jī)理研究[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2008年

4 林初文;產(chǎn)氣莢膜梭菌B型C58-1株α、β1和ε毒素的高效表達(dá)與免疫效力評價及生產(chǎn)工藝改進(jìn)[D];吉林大學(xué);2015年

5 宋佰芬;產(chǎn)氣莢膜梭菌α毒素基因在干酪乳桿菌基因組中的表達(dá)及免疫效果評價[D];東北農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 喬藝然;A型產(chǎn)氣莢膜梭菌感染雛雞病理形態(tài)學(xué)研究[D];東北農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

2 吳潔;A型產(chǎn)氣莢膜梭菌家兔感染模型的建立[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

3 劉雪慧;C、D型產(chǎn)氣莢膜梭菌二價類毒素疫苗及抗毒素血清的研制[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

4 聶思靜;產(chǎn)氣莢膜梭菌NetB毒素阻斷ELISA方法的建立與應(yīng)用[D];東北農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

5 馬壯;廣州市冷鮮雞產(chǎn)氣莢膜梭菌的污染分析及netB菌株的致病性研究[D];甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué);2016年

6 鮑長磊;產(chǎn)氣莢膜梭菌不同毒素型多重PCR和α毒素抗體ELISA檢測方法的建立及初步應(yīng)用[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2016年

7 孫劉妹;產(chǎn)氣莢膜梭菌四聯(lián)外毒素基因α-β2-ε-β1在重組干酪乳酸桿菌表達(dá)及遺傳穩(wěn)定性分析[D];東北農(nóng)業(yè)大學(xué);2016年

8 王瑩瑩;A型產(chǎn)氣莢膜梭菌主要抗原蛋白篩選及其免疫保護(hù)作用[D];東北農(nóng)業(yè)大學(xué);2016年

9 康文娟;雞源產(chǎn)氣莢膜梭菌多重PCR鑒定和藥敏實驗[D];中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2016年

10 賈珊珊;變溫模式下乳酸菌對雞肉制品的生物保護(hù)作用研究[D];合肥工業(yè)大學(xué);2016年

，

本文編號：1298532