新型原卟啉原氧化酶抑制劑的設(shè)計(jì)及構(gòu)效關(guān)系研究
發(fā)布時(shí)間:2022-02-18 21:57
進(jìn)入本世紀(jì)以來,人們對生活質(zhì)量的要求越來越高,也越來越意識到只有與大自然和諧相處才能實(shí)現(xiàn)可持續(xù)發(fā)展,而“綠色”隨之成了當(dāng)今最火熱的詞之一。農(nóng)藥作為一種特殊的化學(xué)產(chǎn)品,進(jìn)入本世紀(jì)以來,既給人類帶來了巨大的利益,也帶來了大量的環(huán)境、健康等諸多問題,也使得綠色新農(nóng)藥的創(chuàng)制成為人類面臨的一項(xiàng)緊迫任務(wù)。綠色農(nóng)藥具有活性高、選擇性好、對農(nóng)作物無害、低殘留等優(yōu)點(diǎn),其創(chuàng)制的一個(gè)關(guān)鍵點(diǎn)在于找到活性高、選擇性好的先導(dǎo)化合物。隨著結(jié)構(gòu)生物學(xué)及計(jì)算化學(xué)等學(xué)科的不斷發(fā)展,計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)(CADD)方法得到了極大發(fā)展,使用CADD方法來指導(dǎo)新農(nóng)藥的創(chuàng)制,成為新農(nóng)藥創(chuàng)制中的一個(gè)極具潛力的方法。原卟啉原Ⅸ氧化酶(PPO)是葉綠素和血紅素生物合成中的一個(gè)關(guān)鍵酶,它不僅是除草劑的重要靶標(biāo),也可以作為醫(yī)藥的靶標(biāo)。以PPO為靶標(biāo)的除草劑因其優(yōu)良的特性一直廣受關(guān)注,但是這類除草劑使用中遇到的一些問題也要求我們繼續(xù)開發(fā)新的靶向PPO的抑制劑。本文的主要內(nèi)容正是圍繞著這一重要靶標(biāo)展開的基于CADD方法的新抑制劑設(shè)計(jì)工作。對已知高活性化合物的構(gòu)效關(guān)系研究可以為新抑制劑的設(shè)計(jì)提供很好的參照。本文第二章我們首先以hPPO和mtPVO...
【文章來源】:華中師范大學(xué)湖北省211工程院校教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:166 頁
【學(xué)位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
本論文主要?jiǎng)?chuàng)新點(diǎn)
第一章 文獻(xiàn)綜述
§1.1 引言
§1.2 原卟啉原氧化酶及其抑制劑的研究概況
1.2.1 原卟啉原氧化酶的生物學(xué)功能及其結(jié)構(gòu)
1.2.2 原卟啉原氧化酶抑制劑的研究進(jìn)展
§1.3 農(nóng)藥分子設(shè)計(jì)的基本思路
1.3.1 基于配體結(jié)構(gòu)的農(nóng)藥分子設(shè)計(jì)
1.3.2 基于受體結(jié)構(gòu)的農(nóng)藥分子設(shè)計(jì)
§1.4 計(jì)算機(jī)輔助農(nóng)藥分子設(shè)計(jì)的常用實(shí)驗(yàn)手段
1.4.1 分子對接
1.4.2 分子動力學(xué)模擬
1.4.3 吉布斯結(jié)合自由能的計(jì)算
1.4.4 三維定量構(gòu)效關(guān)系(3D-QSAR)
§1.5 課題的提出
參考文獻(xiàn)
第二章 幾類原卟啉原氧化酶抑制劑的構(gòu)效關(guān)系研究
§2.1 引言
§2.2 含苯并噻唑的噁(噻)二唑啉酮類抑制劑對人體PPO抑制活性的構(gòu)效關(guān)系研究
2.2.1 計(jì)算與實(shí)驗(yàn)方法
2.2.2 結(jié)果與討論
§2.3 含有苯并噻唑的三唑啉酮類抑制劑對煙草PPO抑制活性的構(gòu)效關(guān)系研究
2.3.1 計(jì)算與實(shí)驗(yàn)方法
2.3.2 結(jié)果與討論
§2.4 幾類原卟啉原氧化酶抑制的3D-QSAR研究
2.4.1 計(jì)算與實(shí)驗(yàn)方法
2.4.2 結(jié)果與討論
§2.5本章小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第三章 新型原卟啉原氧化酶抑制劑的選擇性研究
§3.1 引言
§3.2 幾種商品化抑制劑在人體及煙草原卟啉原氧化酶中的選擇性產(chǎn)生機(jī)制
§3.3 含苯并噁嗪的嘧啶二酮類抑制劑在人體及煙草原卟啉原氧化酶中的選擇性產(chǎn)生機(jī)制
§3.4 本章小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第四章 計(jì)算取代優(yōu)化方法的發(fā)展及其應(yīng)用
§4.1 引言
§4.2 計(jì)算與實(shí)驗(yàn)方法
4.2.1 CSO方法的構(gòu)建
4.2.2 CSO方法在細(xì)胞色素bc1復(fù)合物抑制劑苗頭化合物優(yōu)化中的應(yīng)用
§4.3 結(jié)果與討論
§4.4 本章小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第五章 新型原卟啉原氧化酶抑制劑的虛擬篩選
§5.1 引言
§5.2 計(jì)算與實(shí)驗(yàn)方法
5.2.1 虛擬篩選的策略設(shè)計(jì)
5.2.2 虛擬篩選的計(jì)算方法
§5.3 結(jié)果與討論
5.3.1 虛擬篩選分子的計(jì)算結(jié)果
5.3.2 虛擬篩選分子的生物活性測試
5.3.3 虛擬篩選分子與原卟啉原氧化酶的結(jié)合模式
§5.4 本章小結(jié)
參考文獻(xiàn)
全文總結(jié)
附錄
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的SCI論文情況
致謝
本文編號:3631622
【文章來源】:華中師范大學(xué)湖北省211工程院校教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:166 頁
【學(xué)位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
本論文主要?jiǎng)?chuàng)新點(diǎn)
第一章 文獻(xiàn)綜述
§1.1 引言
§1.2 原卟啉原氧化酶及其抑制劑的研究概況
1.2.1 原卟啉原氧化酶的生物學(xué)功能及其結(jié)構(gòu)
1.2.2 原卟啉原氧化酶抑制劑的研究進(jìn)展
§1.3 農(nóng)藥分子設(shè)計(jì)的基本思路
1.3.1 基于配體結(jié)構(gòu)的農(nóng)藥分子設(shè)計(jì)
1.3.2 基于受體結(jié)構(gòu)的農(nóng)藥分子設(shè)計(jì)
§1.4 計(jì)算機(jī)輔助農(nóng)藥分子設(shè)計(jì)的常用實(shí)驗(yàn)手段
1.4.1 分子對接
1.4.2 分子動力學(xué)模擬
1.4.3 吉布斯結(jié)合自由能的計(jì)算
1.4.4 三維定量構(gòu)效關(guān)系(3D-QSAR)
§1.5 課題的提出
參考文獻(xiàn)
第二章 幾類原卟啉原氧化酶抑制劑的構(gòu)效關(guān)系研究
§2.1 引言
§2.2 含苯并噻唑的噁(噻)二唑啉酮類抑制劑對人體PPO抑制活性的構(gòu)效關(guān)系研究
2.2.1 計(jì)算與實(shí)驗(yàn)方法
2.2.2 結(jié)果與討論
§2.3 含有苯并噻唑的三唑啉酮類抑制劑對煙草PPO抑制活性的構(gòu)效關(guān)系研究
2.3.1 計(jì)算與實(shí)驗(yàn)方法
2.3.2 結(jié)果與討論
§2.4 幾類原卟啉原氧化酶抑制的3D-QSAR研究
2.4.1 計(jì)算與實(shí)驗(yàn)方法
2.4.2 結(jié)果與討論
§2.5本章小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第三章 新型原卟啉原氧化酶抑制劑的選擇性研究
§3.1 引言
§3.2 幾種商品化抑制劑在人體及煙草原卟啉原氧化酶中的選擇性產(chǎn)生機(jī)制
§3.3 含苯并噁嗪的嘧啶二酮類抑制劑在人體及煙草原卟啉原氧化酶中的選擇性產(chǎn)生機(jī)制
§3.4 本章小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第四章 計(jì)算取代優(yōu)化方法的發(fā)展及其應(yīng)用
§4.1 引言
§4.2 計(jì)算與實(shí)驗(yàn)方法
4.2.1 CSO方法的構(gòu)建
4.2.2 CSO方法在細(xì)胞色素bc1復(fù)合物抑制劑苗頭化合物優(yōu)化中的應(yīng)用
§4.3 結(jié)果與討論
§4.4 本章小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第五章 新型原卟啉原氧化酶抑制劑的虛擬篩選
§5.1 引言
§5.2 計(jì)算與實(shí)驗(yàn)方法
5.2.1 虛擬篩選的策略設(shè)計(jì)
5.2.2 虛擬篩選的計(jì)算方法
§5.3 結(jié)果與討論
5.3.1 虛擬篩選分子的計(jì)算結(jié)果
5.3.2 虛擬篩選分子的生物活性測試
5.3.3 虛擬篩選分子與原卟啉原氧化酶的結(jié)合模式
§5.4 本章小結(jié)
參考文獻(xiàn)
全文總結(jié)
附錄
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的SCI論文情況
致謝
本文編號:3631622
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