鐵倍蚜屬線粒體基因組全序列及系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系
發(fā)布時(shí)間:2023-01-26 08:09
鐵倍蚜屬Kaburagia屬于昆蟲(chóng)綱Insecta半翅目Hemiptera蚜科Aphididae綿蚜亞科Eriosomatinae五節(jié)根蚜族Fordini蚜蟲(chóng),是五倍子蚜類(lèi)群的一個(gè)屬,包括4個(gè)亞種。鐵倍蚜屬為異寄主全周期型昆蟲(chóng),其第一和第二寄主植物分別為鹽膚木屬和苔蘚類(lèi)部分植物。在第一寄主植物上寄生形成的蟲(chóng)癭為五倍子的一種,特稱(chēng)為肚倍,廣泛用于諸多領(lǐng)域,具有重要的經(jīng)濟(jì)價(jià)值。鐵倍蚜屬蚜蟲(chóng)形成的倍子形態(tài)變異較大,其亞種的分類(lèi)主要是根據(jù)其第一寄主植物和形成的倍子形狀確定的,對(duì)其不同亞種之間的遺傳變異和系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系方面的研究尚未見(jiàn)系統(tǒng)的研究報(bào)道。動(dòng)物線粒體基因組通常是一個(gè)閉合環(huán)狀的DNA分子,因其具有母系遺傳、進(jìn)化速率快、無(wú)重組現(xiàn)象等特點(diǎn),已經(jīng)作為很好的分子標(biāo)記被廣泛用于研究物種之間的系統(tǒng)發(fā)育和進(jìn)化關(guān)系,這也極大的推動(dòng)了物種系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)的發(fā)展,而鐵倍蚜屬蚜蟲(chóng)的相關(guān)報(bào)道還比較少。本研究基于二代高通量測(cè)序技術(shù)測(cè)定了鐵倍蚜屬不同亞種10個(gè)樣本的線粒體全基因組序列,詳細(xì)分析了基因組序列信息和遺傳變異;與公共數(shù)據(jù)庫(kù)(GenBank)中相關(guān)序列進(jìn)行比較,分析序列組成和結(jié)構(gòu)變異,探討線粒體基因組在倍蚜亞...
【文章頁(yè)數(shù)】:84 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
ABSTRACT
第一章 引言
1.1 鐵倍蚜屬概述
1.1.1 鐵倍蚜屬生物學(xué)特點(diǎn)
1.1.2 鐵倍蚜屬價(jià)值
1.1.3 鐵倍蚜屬系統(tǒng)分類(lèi)
1.2 線粒體基因組基本特征
1.2.1 線粒體基因組結(jié)構(gòu)組成
1.2.2 線粒體基因組的特性
1.2.3 線粒體DNA在系統(tǒng)發(fā)育分析中的應(yīng)用
1.3 本研究目的意義
第二章 材料與方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.2 實(shí)驗(yàn)試劑和儀器
2.2.1 實(shí)驗(yàn)試劑
2.2.2 實(shí)驗(yàn)儀器
2.3 實(shí)驗(yàn)方法
2.3.1 基因組DNA提取
2.3.2 序列測(cè)定
2.4 數(shù)據(jù)分析方法
2.4.1 線粒體基因組序列拼接和注釋
2.4.2 鐵倍蚜屬線粒體基因組組成結(jié)構(gòu)分析
2.4.3 鐵倍蚜屬與近緣屬種線粒體基因組比較分析
2.4.4 系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)構(gòu)建
2.4.5 共線性分析
第三章 鐵倍蚜屬線粒體基因組特征分析
3.1 線粒體基因組測(cè)序、拼接及注釋結(jié)果
3.2 線粒體基因組基本特征
3.2.1 蛋白質(zhì)編碼基因
3.2.2 RNA
3.2.3 非編碼區(qū)
3.3 密碼子偏好性分析
3.4 討論
第四章 鐵倍蚜屬與近緣物種系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系
4.1 線粒體基因組比較分析
4.1.1 組成成分
4.1.2 基因堿基成分
4.1.3 蛋白質(zhì)編碼基因
4.1.4 非編碼區(qū)
4.2 系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系分析
4.3 鐵倍蚜屬與近緣屬種線粒體基因組共線性分析
4.4 討論
總結(jié)與展望
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間取得的研究成果
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)歷及聯(lián)系方式
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]鐵倍蚜屬棗鐵亞種mtDNA COI基因序列遺傳分化[J]. 李京隆,任竹梅. 山西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(04)
[2]高純食品鞣酸的中試工藝研究[J]. 張薇,徐景軼,武斌. 貴州工業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2008(05)
[3]五倍子的研究近況[J]. 樸春梅. 中國(guó)民間療法. 2005(02)
[4]癭綿蚜科系統(tǒng)發(fā)育研究(同翅目:蚜總科)(英文)[J]. 張廣學(xué),陳小琳. 昆蟲(chóng)學(xué)報(bào). 1999(02)
[5]北美的五倍子[J]. 李勇民. 貴州農(nóng)學(xué)院學(xué)報(bào). 1994(01)
[6]倍蚜寄主植物名錄[J]. 夏定久,李志國(guó). 林業(yè)科技通訊. 1993(11)
[7]棗鐵倍蚜(Kaburagia ensigallis)無(wú)翅孤雌僑蚜的發(fā)現(xiàn)及其經(jīng)濟(jì)意義[J]. 田澤君,隆孝雄,謝樹(shù)明,陳祥林. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 1992(02)
[8]五倍子與苔蘚植物[J]. 羅健馨,吳鵬程,徐希成. 植物雜志. 1984(06)
[9]中國(guó)青膚楊五倍子蚜蟲(chóng)的研究[J]. 向和. 昆蟲(chóng)分類(lèi)學(xué)報(bào). 1980(04)
[10]五倍子及其繁殖增產(chǎn)的途徑[J]. 唐覺(jué). 昆蟲(chóng)學(xué)報(bào). 1976(03)
本文編號(hào):3732340
【文章頁(yè)數(shù)】:84 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
ABSTRACT
第一章 引言
1.1 鐵倍蚜屬概述
1.1.1 鐵倍蚜屬生物學(xué)特點(diǎn)
1.1.2 鐵倍蚜屬價(jià)值
1.1.3 鐵倍蚜屬系統(tǒng)分類(lèi)
1.2 線粒體基因組基本特征
1.2.1 線粒體基因組結(jié)構(gòu)組成
1.2.2 線粒體基因組的特性
1.2.3 線粒體DNA在系統(tǒng)發(fā)育分析中的應(yīng)用
1.3 本研究目的意義
第二章 材料與方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.2 實(shí)驗(yàn)試劑和儀器
2.2.1 實(shí)驗(yàn)試劑
2.2.2 實(shí)驗(yàn)儀器
2.3 實(shí)驗(yàn)方法
2.3.1 基因組DNA提取
2.3.2 序列測(cè)定
2.4 數(shù)據(jù)分析方法
2.4.1 線粒體基因組序列拼接和注釋
2.4.2 鐵倍蚜屬線粒體基因組組成結(jié)構(gòu)分析
2.4.3 鐵倍蚜屬與近緣屬種線粒體基因組比較分析
2.4.4 系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)構(gòu)建
2.4.5 共線性分析
第三章 鐵倍蚜屬線粒體基因組特征分析
3.1 線粒體基因組測(cè)序、拼接及注釋結(jié)果
3.2 線粒體基因組基本特征
3.2.1 蛋白質(zhì)編碼基因
3.2.2 RNA
3.2.3 非編碼區(qū)
3.3 密碼子偏好性分析
3.4 討論
第四章 鐵倍蚜屬與近緣物種系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系
4.1 線粒體基因組比較分析
4.1.1 組成成分
4.1.2 基因堿基成分
4.1.3 蛋白質(zhì)編碼基因
4.1.4 非編碼區(qū)
4.2 系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系分析
4.3 鐵倍蚜屬與近緣屬種線粒體基因組共線性分析
4.4 討論
總結(jié)與展望
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間取得的研究成果
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)歷及聯(lián)系方式
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]鐵倍蚜屬棗鐵亞種mtDNA COI基因序列遺傳分化[J]. 李京隆,任竹梅. 山西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(04)
[2]高純食品鞣酸的中試工藝研究[J]. 張薇,徐景軼,武斌. 貴州工業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2008(05)
[3]五倍子的研究近況[J]. 樸春梅. 中國(guó)民間療法. 2005(02)
[4]癭綿蚜科系統(tǒng)發(fā)育研究(同翅目:蚜總科)(英文)[J]. 張廣學(xué),陳小琳. 昆蟲(chóng)學(xué)報(bào). 1999(02)
[5]北美的五倍子[J]. 李勇民. 貴州農(nóng)學(xué)院學(xué)報(bào). 1994(01)
[6]倍蚜寄主植物名錄[J]. 夏定久,李志國(guó). 林業(yè)科技通訊. 1993(11)
[7]棗鐵倍蚜(Kaburagia ensigallis)無(wú)翅孤雌僑蚜的發(fā)現(xiàn)及其經(jīng)濟(jì)意義[J]. 田澤君,隆孝雄,謝樹(shù)明,陳祥林. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 1992(02)
[8]五倍子與苔蘚植物[J]. 羅健馨,吳鵬程,徐希成. 植物雜志. 1984(06)
[9]中國(guó)青膚楊五倍子蚜蟲(chóng)的研究[J]. 向和. 昆蟲(chóng)分類(lèi)學(xué)報(bào). 1980(04)
[10]五倍子及其繁殖增產(chǎn)的途徑[J]. 唐覺(jué). 昆蟲(chóng)學(xué)報(bào). 1976(03)
本文編號(hào):3732340
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