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鐵倍蚜屬線粒體基因組全序列及系統(tǒng)發(fā)育關系

發(fā)布時間:2023-01-26 08:09
  鐵倍蚜屬Kaburagia屬于昆蟲綱Insecta半翅目Hemiptera蚜科Aphididae綿蚜亞科Eriosomatinae五節(jié)根蚜族Fordini蚜蟲,是五倍子蚜類群的一個屬,包括4個亞種。鐵倍蚜屬為異寄主全周期型昆蟲,其第一和第二寄主植物分別為鹽膚木屬和苔蘚類部分植物。在第一寄主植物上寄生形成的蟲癭為五倍子的一種,特稱為肚倍,廣泛用于諸多領域,具有重要的經(jīng)濟價值。鐵倍蚜屬蚜蟲形成的倍子形態(tài)變異較大,其亞種的分類主要是根據(jù)其第一寄主植物和形成的倍子形狀確定的,對其不同亞種之間的遺傳變異和系統(tǒng)發(fā)育關系方面的研究尚未見系統(tǒng)的研究報道。動物線粒體基因組通常是一個閉合環(huán)狀的DNA分子,因其具有母系遺傳、進化速率快、無重組現(xiàn)象等特點,已經(jīng)作為很好的分子標記被廣泛用于研究物種之間的系統(tǒng)發(fā)育和進化關系,這也極大的推動了物種系統(tǒng)發(fā)育基因組學的發(fā)展,而鐵倍蚜屬蚜蟲的相關報道還比較少。本研究基于二代高通量測序技術測定了鐵倍蚜屬不同亞種10個樣本的線粒體全基因組序列,詳細分析了基因組序列信息和遺傳變異;與公共數(shù)據(jù)庫(GenBank)中相關序列進行比較,分析序列組成和結構變異,探討線粒體基因組在倍蚜亞... 

【文章頁數(shù)】:84 頁

【學位級別】:碩士

【文章目錄】:
中文摘要
ABSTRACT
第一章 引言
    1.1 鐵倍蚜屬概述
        1.1.1 鐵倍蚜屬生物學特點
        1.1.2 鐵倍蚜屬價值
        1.1.3 鐵倍蚜屬系統(tǒng)分類
    1.2 線粒體基因組基本特征
        1.2.1 線粒體基因組結構組成
        1.2.2 線粒體基因組的特性
        1.2.3 線粒體DNA在系統(tǒng)發(fā)育分析中的應用
    1.3 本研究目的意義
第二章 材料與方法
    2.1 實驗材料
    2.2 實驗試劑和儀器
        2.2.1 實驗試劑
        2.2.2 實驗儀器
    2.3 實驗方法
        2.3.1 基因組DNA提取
        2.3.2 序列測定
    2.4 數(shù)據(jù)分析方法
        2.4.1 線粒體基因組序列拼接和注釋
        2.4.2 鐵倍蚜屬線粒體基因組組成結構分析
        2.4.3 鐵倍蚜屬與近緣屬種線粒體基因組比較分析
        2.4.4 系統(tǒng)發(fā)育樹構建
        2.4.5 共線性分析
第三章 鐵倍蚜屬線粒體基因組特征分析
    3.1 線粒體基因組測序、拼接及注釋結果
    3.2 線粒體基因組基本特征
        3.2.1 蛋白質編碼基因
        3.2.2 RNA
        3.2.3 非編碼區(qū)
    3.3 密碼子偏好性分析
    3.4 討論
第四章 鐵倍蚜屬與近緣物種系統(tǒng)發(fā)育關系
    4.1 線粒體基因組比較分析
        4.1.1 組成成分
        4.1.2 基因堿基成分
        4.1.3 蛋白質編碼基因
        4.1.4 非編碼區(qū)
    4.2 系統(tǒng)發(fā)育關系分析
    4.3 鐵倍蚜屬與近緣屬種線粒體基因組共線性分析
    4.4 討論
總結與展望
參考文獻
攻讀學位期間取得的研究成果
致謝
個人簡歷及聯(lián)系方式


【參考文獻】:
期刊論文
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本文編號:3732340

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