中西醫(yī)學(xué)對霾危害的認(rèn)識及霾高暴露人群—交通警察鼻腔菌群的研究
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【部分圖文】:
圖2.細(xì)菌16S區(qū)域
成都中醫(yī)藥大學(xué)2018屆博士學(xué)位論文(3)Mark筆和簽字筆(4)無菌棉拭子(5)密封塑料袋(6)-80℃干冰(7)一次性手套1.2.5菌群結(jié)構(gòu)的16srRNA基因高通量測序1.2.5.1實驗原理16srRNA基因高通量測序又叫微生物免培養(yǎng)分析技術(shù),現(xiàn)已廣泛用....
圖4.信息分析流程圖
圖4.信息分析流程圖2實驗結(jié)果2.1測序數(shù)據(jù)處理生成OTUs為確保樣品間的比較有意義,首先應(yīng)保證足夠測序數(shù)據(jù)量。采用IlluminaHiSeq測序平臺得到原始Tags數(shù)據(jù)(RawTags),然后經(jīng)過嚴(yán)格的過濾處理得到高質(zhì)量的Tags數(shù)據(jù)(CleanTags....
圖5.各樣品的OTUs聚類和注釋情況統(tǒng)計
圖5.各樣品的OTUs聚類和注釋情況統(tǒng)計注:橫坐標(biāo)是樣品名;第一縱坐標(biāo)(TagsNumber)是Tags數(shù)目;TotalTags(紅色):指每個樣品的總的Tags目(等同于EffectiveTags,每個樣品用于OTU聚類等后續(xù)分析的有效數(shù)據(jù));Uniq....
圖6.各樣品在各分類水平上的序列數(shù)目
圖6.各樣品在各分類水平上的序列數(shù)目2.2.2測序數(shù)據(jù)量合理性稀釋性曲線(rarefactioncurve)可直接反映測序數(shù)據(jù)量的合理性,用來評價測序數(shù)據(jù)量是不是足以覆蓋樣本中全部的類群,表示測序數(shù)據(jù)量已漸進(jìn)合理,更多的數(shù)據(jù)量只會產(chǎn)生少量新的OTUs(圖7)。Rank....
本文編號:3908070
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