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多組學(xué)研究非離子表面活性劑對(duì)鞘氨醇單胞菌GY2B降解菲的影響機(jī)理

發(fā)布時(shí)間:2023-04-21 18:50
  隨著工業(yè)的發(fā)展化石燃料的需求和消耗量逐漸增加,導(dǎo)致環(huán)境中多環(huán)芳烴(PAHs)的含量急劇增加。多環(huán)芳烴具有致毒、致突變,致癌等特性,進(jìn)入環(huán)境中的PAHs會(huì)對(duì)生態(tài)環(huán)境及人類的健康造成嚴(yán)重的威脅,因此選擇高效合理的修復(fù)技術(shù)成為目前亟需解決的問(wèn)題。由于表面活性劑能增加PAHs的溶解性和生物可利用性而提高PAHs的生物降解,表面活性劑增效微生物修復(fù)已發(fā)展成為一種高效修復(fù)PAHs污染環(huán)境的方法。人們大量研究了表面活性劑對(duì)微生物降解PAHs的影響,但是,近年來(lái)表面活性劑對(duì)PAHs降解的影響爭(zhēng)議頗多(促進(jìn)、抑制和無(wú)明顯作用)。因此,為了能進(jìn)一步明確相應(yīng)的作用機(jī)理,本文研究了非離子表面活性劑對(duì)鞘氨醇單胞菌GY2B細(xì)胞特性及菲生物降解的影響,并利用多組學(xué)手段(蛋白組、基因組和轉(zhuǎn)錄組)探討其相關(guān)的作用機(jī)理。論文取得的主要成果如下:(1)選用三種具有代表性的非離子表面活性劑(Tween80、TritonX-100和Brij30)研究了它們對(duì)鞘氨醇單胞菌GY2B細(xì)胞表面特性(膜通透性、官能團(tuán)、元素)、細(xì)胞活性以及GY2B對(duì)菲生物降解效果的影響。Tween80、TritonX-100和Brij30分別促進(jìn),輕微和...

【文章頁(yè)數(shù)】:168 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:博士

【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 緒論
    1.1 多環(huán)芳烴污染概況
        1.1.1 多環(huán)芳烴(PAHs)簡(jiǎn)介
        1.1.2 多環(huán)芳烴(PAHs)污染環(huán)境修復(fù)現(xiàn)狀
    1.2 表面活性劑影響微生物修復(fù)PAHs污染的研究進(jìn)展
        1.2.1 菌體表面吸附
        1.2.2 跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)
        1.2.3 菌體細(xì)胞內(nèi)降解
    1.3 PAHs污染環(huán)境微生物修復(fù)的分子生物學(xué)研究
        1.3.1 微生物基因組學(xué)研究
        1.3.2 微生物基因組測(cè)序技術(shù)的發(fā)展
        1.3.3 微生物的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究
        1.3.4 微生物的蛋白組學(xué)研究
        1.3.5 PAHs微生物降解的分子生物學(xué)研究進(jìn)展
    1.4 選題依據(jù)及研究?jī)?nèi)容
第二章 非離子表面活性劑對(duì)Sphingomonas sp.GY2B細(xì)胞特性及降解菲的能力的影響研究
    2.1 實(shí)驗(yàn)材料
    2.2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.2.1 菲降解菌Sphingomonas sp. GY2B的培養(yǎng)
        2.2.2 表面活性劑對(duì)菌GY2B降解菲的影響
        2.2.3 流式細(xì)胞儀檢測(cè)GY2B細(xì)胞活性
        2.2.4 GY2B細(xì)胞形態(tài)觀察
        2.2.5 GY2B細(xì)胞表面特性分析
    2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與討論
        2.3.1 表面活性劑對(duì)GY2B生長(zhǎng)和細(xì)胞活性的影響
        2.3.2 表面活性劑對(duì)GY2B細(xì)胞膜通透性的影響
        2.3.3 表面活性劑對(duì)GY2B細(xì)胞表面元素組成和官能團(tuán)的影響
        2.3.4 表面活性劑對(duì)GY2B降解菲的影響
    2.4 本章小結(jié)
第三章 蛋白質(zhì)組學(xué)研究Tween80促進(jìn)Sphingomonas sp. GY2B降解菲的作用機(jī)理
    3.1 實(shí)驗(yàn)材料
    3.2 實(shí)驗(yàn)方法
        3.2.1 菲降解菌Sphingomonas sp.GY2B的培養(yǎng)
        3.2.2 差異表達(dá)蛋白分析
    3.3 結(jié)果與討論
        3.3.1 Tween80對(duì)GY2B蛋白質(zhì)表達(dá)的影響
        3.3.2 差異表達(dá)蛋白質(zhì)的功能分類
        3.3.3 Tween80促進(jìn)GY2B降解菲的功能蛋白分析
        3.3.4 Tween80促進(jìn)GY2B降解菲的作用機(jī)制(蛋白質(zhì)表達(dá)水平)
    3.4 本章小結(jié)
第四章 Sphingomonas sp. GY2B的全基因組測(cè)序
    4.1 實(shí)驗(yàn)菌株
    4.2 實(shí)驗(yàn)方法
        4.2.1 GY2B基因組DNA的提取
        4.2.2 GY2B基因組測(cè)序流程
        4.2.3 GY2B基因組測(cè)序數(shù)據(jù)的生物信息分析
        4.2.4 GY2B基因組測(cè)序數(shù)據(jù)的生物信息分析
    4.3 結(jié)果與討論
        4.3.1 GY2B基因組測(cè)序數(shù)據(jù)的組裝
        4.3.2 GY2B基因組組分分析
        4.3.3 GY2B基因組功能注釋
    4.4 本章小結(jié)
第五章 轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究Tween80促進(jìn)Sphingomonas sp. GY2B降解菲的作用機(jī)理
    5.1 實(shí)驗(yàn)材料
    5.2 實(shí)驗(yàn)方法
        5.2.1 菲降解菌Sphingomonas sp.GY2B的培養(yǎng)
        5.2.2 GY2B的轉(zhuǎn)錄組學(xué)測(cè)序
    5.3 結(jié)果與討論
        5.3.1 總RNA質(zhì)量評(píng)估
        5.3.2 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序質(zhì)量評(píng)估
        5.3.3 Tween80對(duì)GY2B基因表達(dá)的影響
        5.3.4 差異表達(dá)基因的GO功能和KEGG代謝通路分析
        5.3.5 差異基因表達(dá)的qRT-PCR驗(yàn)證
        5.3.6 Tween80促進(jìn)GY2B降解菲的功能基因分析
        5.3.7 Tween80促進(jìn)GY2B降解菲的調(diào)控機(jī)理(基因表達(dá)水平)
    5.4 本章小結(jié)
結(jié)論與展望
    本文結(jié)論
    本文主要?jiǎng)?chuàng)新點(diǎn)
    研究展望
參考文獻(xiàn)
附錄
攻讀博士學(xué)位期間取得的研究成果
致謝
附件



本文編號(hào):3796062

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