基于DNA和限制酶的邏輯計(jì)算模型的研究
發(fā)布時(shí)間:2024-05-11 18:02
DNA不僅承載著生命遺傳信息,還是天然的納米生物材料和元件。由于DNA分子自身的特異性、高并行性、微小性等天然特性,在信息存儲(chǔ)和處理過(guò)程中表現(xiàn)出了強(qiáng)大的并行計(jì)算能力和數(shù)據(jù)存儲(chǔ)能力,吸引了學(xué)者的廣泛關(guān)注。DNA分子被廣泛用于設(shè)計(jì)構(gòu)建各類功能結(jié)構(gòu)和器件,如DNA計(jì)算機(jī)、DNA傳感器、DNA芯片、DNA分子探針和分子信標(biāo)等。立足點(diǎn)介導(dǎo)的DNA鏈置換技術(shù)已經(jīng)廣泛應(yīng)用于構(gòu)建DNA設(shè)備,包括DNA傳感器、DNA分子機(jī)器和DNA電路,因?yàn)樗軌驅(qū)崿F(xiàn)動(dòng)態(tài)控制鏈置換反應(yīng)。分子雜交系統(tǒng)的能級(jí)會(huì)自動(dòng)趨于穩(wěn)定,DNA鏈置換技術(shù)正是基于此種特點(diǎn),通過(guò)向系統(tǒng)中加入一定長(zhǎng)度和序列的DNA鏈來(lái)誘導(dǎo)或者控制鏈置換反應(yīng),最終釋放另一條DNA鏈。傳統(tǒng)的鏈置換反應(yīng)體系中,立足點(diǎn)和分支遷移區(qū)域是共價(jià)連接的,預(yù)先暴露的立足點(diǎn)是激活進(jìn)一步級(jí)聯(lián)反應(yīng)的先決條件,因此能夠動(dòng)態(tài)地控制立足點(diǎn)的產(chǎn)生和移除將是非常有優(yōu)勢(shì)的。本研究將具有特異性識(shí)別功能的限制性核酸內(nèi)切酶引入DNA鏈置換中,作為DNA電路的輸入,通過(guò)控制立足點(diǎn)的生成和移除設(shè)計(jì)并實(shí)現(xiàn)了多種邏輯門,并構(gòu)建出多數(shù)表決分子電路,具體研究?jī)?nèi)容如下:研究了基于限制性核酸內(nèi)切酶的立足點(diǎn)生成和移除...
【文章頁(yè)數(shù)】:81 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第1章 緒論
1.1 研究背景和意義
1.2 國(guó)內(nèi)外研究進(jìn)展
1.3 研究?jī)?nèi)容與創(chuàng)新點(diǎn)
1.4 本章小結(jié)
第2章 生物計(jì)算理論研究基礎(chǔ)
2.1 分子生物學(xué)基礎(chǔ)理論
2.2 數(shù)理邏輯基礎(chǔ)
2.3 本章小結(jié)
第3章 限制性核酸內(nèi)切酶和DNA電路
3.1 引言
3.2 限制性核酸內(nèi)切酶的特性
3.3 限制性核酸內(nèi)切酶的相關(guān)應(yīng)用
3.4 限制性核酸內(nèi)切酶的最佳切割位點(diǎn)研究
3.5 本章小結(jié)
第4章 基于限制性核酸內(nèi)切酶的邏輯電路設(shè)計(jì)
4.1 引言
4.2 DNA邏輯門的設(shè)計(jì)
4.3 組合電路設(shè)計(jì)
4.4 分子材料設(shè)計(jì)
4.5 本章小結(jié)
第5章 基于限制性核酸內(nèi)切酶的邏輯電路實(shí)現(xiàn)
5.1 引言
5.2 邏輯門實(shí)驗(yàn)材料和方法
5.3 生物實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析
5.4 仿真實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析
5.5 分子邏輯門比較
5.6 本章小結(jié)
第6章 總結(jié)和展望
6.1 全文總結(jié)
6.2 工作展望
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表論文及科研情況
致謝
本文編號(hào):3970228
【文章頁(yè)數(shù)】:81 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第1章 緒論
1.1 研究背景和意義
1.2 國(guó)內(nèi)外研究進(jìn)展
1.3 研究?jī)?nèi)容與創(chuàng)新點(diǎn)
1.4 本章小結(jié)
第2章 生物計(jì)算理論研究基礎(chǔ)
2.1 分子生物學(xué)基礎(chǔ)理論
2.2 數(shù)理邏輯基礎(chǔ)
2.3 本章小結(jié)
第3章 限制性核酸內(nèi)切酶和DNA電路
3.1 引言
3.2 限制性核酸內(nèi)切酶的特性
3.3 限制性核酸內(nèi)切酶的相關(guān)應(yīng)用
3.4 限制性核酸內(nèi)切酶的最佳切割位點(diǎn)研究
3.5 本章小結(jié)
第4章 基于限制性核酸內(nèi)切酶的邏輯電路設(shè)計(jì)
4.1 引言
4.2 DNA邏輯門的設(shè)計(jì)
4.3 組合電路設(shè)計(jì)
4.4 分子材料設(shè)計(jì)
4.5 本章小結(jié)
第5章 基于限制性核酸內(nèi)切酶的邏輯電路實(shí)現(xiàn)
5.1 引言
5.2 邏輯門實(shí)驗(yàn)材料和方法
5.3 生物實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析
5.4 仿真實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析
5.5 分子邏輯門比較
5.6 本章小結(jié)
第6章 總結(jié)和展望
6.1 全文總結(jié)
6.2 工作展望
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表論文及科研情況
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本文編號(hào):3970228
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