外切酶循環(huán)放大技術(shù)檢測腫瘤標記物及其在分子邏輯門體系中的應(yīng)用研究
發(fā)布時間:2021-08-01 11:57
本文基于核酸外切酶循環(huán)放大技術(shù),實現(xiàn)了對血小板衍生因子(PDGF)和DNA等腫瘤標志物高靈敏、高選擇性檢測檢測,并建立分子邏輯門體系。主要開展了以下兩方面的工作:一、核酸外切酶級聯(lián)循環(huán)放大技術(shù)檢測血小板衍生因子本文建立了一種核酸外切酶級聯(lián)循環(huán)放大技術(shù),基于血小板衍生因子(PDGF-BB)與其適體的特異性識別作用,實現(xiàn)了對PDGF-BB的化學發(fā)光免標記高靈敏檢測。該體系由雙鏈DNA(核酸適體-受體)、兩種發(fā)卡結(jié)構(gòu)DNA分子,以及核酸外切酶組成。通過核酸適體與PDGF-BB的特異性識別并結(jié)合,運用ExoIII對雙鏈結(jié)構(gòu)的特異性剪切,實現(xiàn)核酸外切酶級聯(lián)循環(huán)放大。反應(yīng)后釋放出大量的DNA酶,其與hemin結(jié)合形成辣根過氧化物DNA模擬酶(DNAzyme),采用luminol-H2O2化學發(fā)光反應(yīng)體系檢測,對PDGF-BB的檢測限可達6.8×10-13M。本方法設(shè)計簡單,實驗條件溫和且為均相反應(yīng),免標記成本低,效率高。對于具有適體序列的生物分子具有廣泛適用性。二、核酸外切酶循環(huán)放大技術(shù)檢測DNA及其在分子邏輯門體系中的應(yīng)用研究基于核酸外切酶循環(huán)放大技術(shù)實現(xiàn)了對DNA的高靈敏檢測,并用于分子邏輯門...
【文章來源】:青島科技大學山東省
【文章頁數(shù)】:64 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
Exo-CARA法(循環(huán)IIIIIIII)免標記化學發(fā)光檢測PDGF-BB的原理圖
進而激活Recycle II。即, locker DNA與MB1的3'端互Exo III識別雙鏈結(jié)構(gòu),進而發(fā)生剪切作用。當剪切完兩條鏈,其中一條鏈就是blocker DNA,其繼續(xù)與MNA的循環(huán),稱這個循環(huán)過程稱為Recycle II,blocker這個循環(huán)中釋放的另一條鏈命名它為鏈A,其作為,當鏈A與MB2的3'端互補結(jié)合,進而發(fā)生ExoIII的剪先前的結(jié)構(gòu)分裂成兩條鏈,其中一條鏈就是鏈A,其,稱這個循環(huán)為Recycle III。這個循環(huán)中釋放的另一blocker DNA序列,從而引發(fā)Recycle II。如此,三個B不斷的積累。當反應(yīng)完畢后,鏈A和鏈B中的DNAz合,形成HRP模擬酶,采用Luminol-H2O2化學發(fā)光體發(fā)光信號。量對實驗體系影響的研究
后分別檢測各用量下的化學發(fā)光強度,以此確定Exo如圖2-2所示,在Exo III的用量在0~100U之間變化,度隨著Exo III用量的增加而增加,當酶用量大于50U著酶用量而增加。因此,選擇50 U作為最佳Exo III用時間對實驗體系影響的研究時間是影響Luminol-H2O2-DNAzyme化學發(fā)光體系的Exo III反應(yīng)時間為 10 min,20 min,30 min,45 m別檢測不同時間下的化學發(fā)光強度,以此來確定Ex影響。如圖2-3所示,體系的反應(yīng)時間在0~90 min之時,化學發(fā)光強度隨著時間的增強而增強,而當時間強度的變化就很不明顯,因此,選擇30 min作為體系
【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于DNA/RNA的邏輯門與邏輯運算[J]. 俞洋,陸建華,王東方,裴昊,樊春海. 科學通報. 2013(02)
[2]DNA聚合酶δ與腫瘤的關(guān)系[J]. 阮細玲,吳瓊,黃怡,李永繼,徐恒. 臨床與實驗病理學雜志. 2012(12)
[3]限制性核酸內(nèi)切酶的規(guī)范表達[J]. 王雪瑩,郭國慶. 編輯學報. 2012(03)
[4]真核生物DNA連接酶Ⅲ的功能演化[J]. 靳春艷,盛自章,黃京飛. 中國科學技術(shù)大學學報. 2012(04)
[5]肝硬化出血患者血小板4項參數(shù)及凝血因子的動態(tài)變化[J]. 洪煒,楊寧,何江英,曲芬,毛遠麗. 中國衛(wèi)生檢驗雜志. 2011(09)
[6]胃癌及癌旁正常組織中微小RNA表達譜的檢測[J]. 陸俊,宋軍,徐溢新,孟松,白津,鄭駿年,徐為. 中華實驗外科雜志. 2011 (08)
[7]使用DNA分子實現(xiàn)邏輯門操控[J]. 戴聞. 物理. 2011(05)
[8]肝病患者凝血因子、血小板參數(shù)檢測及臨床意義[J]. 張秀琴. 現(xiàn)代診斷與治療. 2011(02)
[9]腫瘤標記物在消化系統(tǒng)腫瘤診斷中的研究進展[J]. 劉慶峰,王濤,劉貴建. 中華臨床醫(yī)師雜志(電子版). 2011(05)
[10]微小RNA與腫瘤相關(guān)性研究[J]. 程文,高建平,張征宇. 醫(yī)學研究生學報. 2011(02)
碩士論文
[1]基于核酸外切酶Ⅲ輔助信號放大的化學發(fā)光共振能量轉(zhuǎn)移體系高靈敏檢測核酸[D]. 陳春.陜西師范大學 2013
本文編號:3315483
【文章來源】:青島科技大學山東省
【文章頁數(shù)】:64 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
Exo-CARA法(循環(huán)IIIIIIII)免標記化學發(fā)光檢測PDGF-BB的原理圖
進而激活Recycle II。即, locker DNA與MB1的3'端互Exo III識別雙鏈結(jié)構(gòu),進而發(fā)生剪切作用。當剪切完兩條鏈,其中一條鏈就是blocker DNA,其繼續(xù)與MNA的循環(huán),稱這個循環(huán)過程稱為Recycle II,blocker這個循環(huán)中釋放的另一條鏈命名它為鏈A,其作為,當鏈A與MB2的3'端互補結(jié)合,進而發(fā)生ExoIII的剪先前的結(jié)構(gòu)分裂成兩條鏈,其中一條鏈就是鏈A,其,稱這個循環(huán)為Recycle III。這個循環(huán)中釋放的另一blocker DNA序列,從而引發(fā)Recycle II。如此,三個B不斷的積累。當反應(yīng)完畢后,鏈A和鏈B中的DNAz合,形成HRP模擬酶,采用Luminol-H2O2化學發(fā)光體發(fā)光信號。量對實驗體系影響的研究
后分別檢測各用量下的化學發(fā)光強度,以此確定Exo如圖2-2所示,在Exo III的用量在0~100U之間變化,度隨著Exo III用量的增加而增加,當酶用量大于50U著酶用量而增加。因此,選擇50 U作為最佳Exo III用時間對實驗體系影響的研究時間是影響Luminol-H2O2-DNAzyme化學發(fā)光體系的Exo III反應(yīng)時間為 10 min,20 min,30 min,45 m別檢測不同時間下的化學發(fā)光強度,以此來確定Ex影響。如圖2-3所示,體系的反應(yīng)時間在0~90 min之時,化學發(fā)光強度隨著時間的增強而增強,而當時間強度的變化就很不明顯,因此,選擇30 min作為體系
【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于DNA/RNA的邏輯門與邏輯運算[J]. 俞洋,陸建華,王東方,裴昊,樊春海. 科學通報. 2013(02)
[2]DNA聚合酶δ與腫瘤的關(guān)系[J]. 阮細玲,吳瓊,黃怡,李永繼,徐恒. 臨床與實驗病理學雜志. 2012(12)
[3]限制性核酸內(nèi)切酶的規(guī)范表達[J]. 王雪瑩,郭國慶. 編輯學報. 2012(03)
[4]真核生物DNA連接酶Ⅲ的功能演化[J]. 靳春艷,盛自章,黃京飛. 中國科學技術(shù)大學學報. 2012(04)
[5]肝硬化出血患者血小板4項參數(shù)及凝血因子的動態(tài)變化[J]. 洪煒,楊寧,何江英,曲芬,毛遠麗. 中國衛(wèi)生檢驗雜志. 2011(09)
[6]胃癌及癌旁正常組織中微小RNA表達譜的檢測[J]. 陸俊,宋軍,徐溢新,孟松,白津,鄭駿年,徐為. 中華實驗外科雜志. 2011 (08)
[7]使用DNA分子實現(xiàn)邏輯門操控[J]. 戴聞. 物理. 2011(05)
[8]肝病患者凝血因子、血小板參數(shù)檢測及臨床意義[J]. 張秀琴. 現(xiàn)代診斷與治療. 2011(02)
[9]腫瘤標記物在消化系統(tǒng)腫瘤診斷中的研究進展[J]. 劉慶峰,王濤,劉貴建. 中華臨床醫(yī)師雜志(電子版). 2011(05)
[10]微小RNA與腫瘤相關(guān)性研究[J]. 程文,高建平,張征宇. 醫(yī)學研究生學報. 2011(02)
碩士論文
[1]基于核酸外切酶Ⅲ輔助信號放大的化學發(fā)光共振能量轉(zhuǎn)移體系高靈敏檢測核酸[D]. 陳春.陜西師范大學 2013
本文編號:3315483
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