DNA納米邏輯門的構(gòu)建研究
發(fā)布時(shí)間:2021-07-28 03:10
隨著計(jì)算機(jī)科學(xué)對人類生活的影響越來越深遠(yuǎn),計(jì)算機(jī)逐漸發(fā)展成為社會生活中必不可少的一部分,隨著時(shí)間的推移,人類生活所需要和產(chǎn)生的信息量也越來越大,隨之而來的,便是對計(jì)算機(jī)存儲以及運(yùn)算速度的更高要求,使得現(xiàn)今計(jì)算機(jī)的發(fā)展不論從存儲還是運(yùn)算速度方面都達(dá)到了其物理極限,計(jì)算機(jī)的發(fā)展日趨捉襟見肘。因此,人們開始尋找新型的材料代替芯片來進(jìn)行計(jì)算機(jī)的制造。早在1959年加州理工學(xué)院的美國物理年會上Feynman便提出了分子計(jì)算這一偉大的想法,終于在1994年,隨著科學(xué)技術(shù)的發(fā)展,Adleman教授將DNA計(jì)算這一想法從理論變成了現(xiàn)實(shí),開啟了 DNA計(jì)算的新時(shí)代。DNA計(jì)算也憑借其并行性好、存儲量大、運(yùn)算速度快等特點(diǎn)一躍成為了計(jì)算機(jī)科學(xué)、生物科學(xué)、物理、化學(xué)、數(shù)學(xué)等學(xué)科領(lǐng)域的科學(xué)家們爭相研究的寵兒。本文首先介紹了 DNA計(jì)算的研究背景及優(yōu)勢,并對DNA計(jì)算中使用到的實(shí)驗(yàn)技術(shù)如PCR、瓊脂糖凝膠電泳、紫外分光光度法、聚丙烯酰胺凝膠電泳等實(shí)驗(yàn)操作進(jìn)行了大致的介紹。最主要的是對DNA計(jì)算發(fā)展至今所使用的技術(shù)進(jìn)行了歸納總結(jié),并提出了兩種邏輯計(jì)算模型,其中一個(gè)是利用化學(xué)發(fā)光共振能量轉(zhuǎn)移來實(shí)現(xiàn)的,而另一個(gè)則是通過...
【文章來源】:陜西師范大學(xué)陜西省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:71 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-1四種脫氧核苷酸結(jié)構(gòu)圖??在DNA中,四種脫氧核苷酸的連接方式一共有兩種:第一種是其中一個(gè)核苷??9??
陜西師范大學(xué)碩士學(xué)位論文??酸分子的磷酸基與另一個(gè)核苷酸分子3’碳原子上的羥基相連,形成磷酸二酯鍵;??第二種則是兩個(gè)核苷酸分子的含氮堿基遵循Watson-Crick堿基互補(bǔ)配對原則通過??氫鍵相連。其中,腺嘌呤與胸腺嘧啶通過兩個(gè)氫鍵相連,鳥嘌呤通過三個(gè)氫鍵與??胞嘧啶相連,即A=T,G=C。因此,GC含量高的DNA鏈會更穩(wěn)定,DNA雙鏈的??解旋會更難。多個(gè)核苷酸分子經(jīng)過3’一*5’磷酸二酯鍵即第一種方式連接成單鏈,??而單鏈再通過堿基互補(bǔ)配對原則即第二種方式連接成雙鏈DNA。??DNA不僅具有特定的化學(xué)組成,還具有特殊的雙螺旋空間結(jié)構(gòu)(圖2-2),??它的主要特點(diǎn)有[64]:?(1)?DNA分子是由兩條反向、平行、互補(bǔ)的脫氧核苷酸長??鏈構(gòu)成,其中一條DNA鏈為3’一^5’,另一條DNA鏈為在同一軸上相互??盤旋,每3.4nm形成一圈,直徑為2.0nm;?(2)?DNA分子中隣酸和脫氧核糖排列??在雙螺旋的外側(cè),構(gòu)成DNA的基本骨架,而含氮堿基則排列在雙螺旋的內(nèi)側(cè);(3)??DNA分子的兩條鏈通過氫鍵按堿基互補(bǔ)配對原則結(jié)合且在同一?DNA鏈上腺嘌呤??的數(shù)目與胸腺嘧啶的數(shù)目相等,即A=T,鳥嘌呤的數(shù)目與胞嘧啶的數(shù)目相等,即??G=C,堿基在DNA分子中排列順序的千變?nèi)f化導(dǎo)致了?DNA分子的多樣性。??
DNA計(jì)算中,可以通過聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)進(jìn)行DNA擴(kuò)增從而得到所為PCR反應(yīng)速度快,擴(kuò)增得到的DNA數(shù)目大等特點(diǎn),使得DNA行性高的優(yōu)勢展露無遺。此外,在進(jìn)行DNA鏈置換等操作時(shí),只兩條堿基互補(bǔ)配對的DNA單鏈在適當(dāng)?shù)柠}溶液中進(jìn)行雜交即可,長,也可在PCR儀中高溫加熱,以防止DNA單鏈進(jìn)行自我雜交出之后再逐步降溫進(jìn)行DNA雜交。??泳技術(shù)??帶電離子在電場的作用下向著相反方向移動(dòng)的現(xiàn)象就是電泳,電俄國莫斯科大學(xué)的斐迪南?弗雷德里克?羅伊斯(Ferdinand?Frederic?到1936年,A.W.K.蒂塞利烏斯制造了界面電泳儀,并使用它成蛋白的3種球蛋白,電泳技術(shù)逐漸開始被人們重視并開始推廣使鑒定和純化DNA片段。樣品的物理性質(zhì)如分子大小、電荷多少、間構(gòu)型、凝膠電泳使用的支持材料、電場強(qiáng)度以及緩沖液的離子強(qiáng)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]圖的最大團(tuán)與最大獨(dú)立集粘貼DNA計(jì)算模型[J]. 范月科,強(qiáng)小利,許進(jìn). 計(jì)算機(jī)學(xué)報(bào). 2010(02)
[2]DNA縮短法計(jì)算模型求解最大獨(dú)立集問題[J]. 張成,楊靜,許進(jìn),趙東明. 科學(xué)通報(bào). 2009(24)
[3]0-1規(guī)劃問題的閉環(huán)DNA算法[J]. 周康,覃磊,同小軍,許進(jìn). 系統(tǒng)工程與電子技術(shù). 2009(04)
[4]基于閉環(huán)DNA計(jì)算的最大獨(dú)立集問題的算法[J]. 周康,同小軍,劉文斌,許進(jìn). 計(jì)算機(jī)工程. 2008(04)
[5]基于分治的背包問題DNA計(jì)算機(jī)算法[J]. 李肯立,姚鳳娟,李仁發(fā),許進(jìn). 計(jì)算機(jī)研究與發(fā)展. 2007(06)
[6]最小頂點(diǎn)覆蓋問題的閉環(huán)DNA算法[J]. 周康,許進(jìn). 計(jì)算機(jī)工程與應(yīng)用. 2006(20)
[7]邊連通度問題的三維DNA圖結(jié)構(gòu)解法[J]. 方剛,張社民,許進(jìn). 系統(tǒng)工程與電子技術(shù). 2006(01)
[8]最小頂點(diǎn)覆蓋問題的改進(jìn)粘貼模型[J]. 董亞非,張家秀,殷志祥,許進(jìn). 電子與信息學(xué)報(bào). 2005(04)
[9]圖的最小頂點(diǎn)覆蓋問題的質(zhì)粒DNA計(jì)算模型[J]. 王淑棟,劉文斌,許進(jìn). 華中科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2004(11)
[10]最小頂點(diǎn)覆蓋問題的DNA分子算法[J]. 高琳,許進(jìn). 系統(tǒng)工程與電子技術(shù). 2004(04)
本文編號:3307083
【文章來源】:陜西師范大學(xué)陜西省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:71 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-1四種脫氧核苷酸結(jié)構(gòu)圖??在DNA中,四種脫氧核苷酸的連接方式一共有兩種:第一種是其中一個(gè)核苷??9??
陜西師范大學(xué)碩士學(xué)位論文??酸分子的磷酸基與另一個(gè)核苷酸分子3’碳原子上的羥基相連,形成磷酸二酯鍵;??第二種則是兩個(gè)核苷酸分子的含氮堿基遵循Watson-Crick堿基互補(bǔ)配對原則通過??氫鍵相連。其中,腺嘌呤與胸腺嘧啶通過兩個(gè)氫鍵相連,鳥嘌呤通過三個(gè)氫鍵與??胞嘧啶相連,即A=T,G=C。因此,GC含量高的DNA鏈會更穩(wěn)定,DNA雙鏈的??解旋會更難。多個(gè)核苷酸分子經(jīng)過3’一*5’磷酸二酯鍵即第一種方式連接成單鏈,??而單鏈再通過堿基互補(bǔ)配對原則即第二種方式連接成雙鏈DNA。??DNA不僅具有特定的化學(xué)組成,還具有特殊的雙螺旋空間結(jié)構(gòu)(圖2-2),??它的主要特點(diǎn)有[64]:?(1)?DNA分子是由兩條反向、平行、互補(bǔ)的脫氧核苷酸長??鏈構(gòu)成,其中一條DNA鏈為3’一^5’,另一條DNA鏈為在同一軸上相互??盤旋,每3.4nm形成一圈,直徑為2.0nm;?(2)?DNA分子中隣酸和脫氧核糖排列??在雙螺旋的外側(cè),構(gòu)成DNA的基本骨架,而含氮堿基則排列在雙螺旋的內(nèi)側(cè);(3)??DNA分子的兩條鏈通過氫鍵按堿基互補(bǔ)配對原則結(jié)合且在同一?DNA鏈上腺嘌呤??的數(shù)目與胸腺嘧啶的數(shù)目相等,即A=T,鳥嘌呤的數(shù)目與胞嘧啶的數(shù)目相等,即??G=C,堿基在DNA分子中排列順序的千變?nèi)f化導(dǎo)致了?DNA分子的多樣性。??
DNA計(jì)算中,可以通過聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)進(jìn)行DNA擴(kuò)增從而得到所為PCR反應(yīng)速度快,擴(kuò)增得到的DNA數(shù)目大等特點(diǎn),使得DNA行性高的優(yōu)勢展露無遺。此外,在進(jìn)行DNA鏈置換等操作時(shí),只兩條堿基互補(bǔ)配對的DNA單鏈在適當(dāng)?shù)柠}溶液中進(jìn)行雜交即可,長,也可在PCR儀中高溫加熱,以防止DNA單鏈進(jìn)行自我雜交出之后再逐步降溫進(jìn)行DNA雜交。??泳技術(shù)??帶電離子在電場的作用下向著相反方向移動(dòng)的現(xiàn)象就是電泳,電俄國莫斯科大學(xué)的斐迪南?弗雷德里克?羅伊斯(Ferdinand?Frederic?到1936年,A.W.K.蒂塞利烏斯制造了界面電泳儀,并使用它成蛋白的3種球蛋白,電泳技術(shù)逐漸開始被人們重視并開始推廣使鑒定和純化DNA片段。樣品的物理性質(zhì)如分子大小、電荷多少、間構(gòu)型、凝膠電泳使用的支持材料、電場強(qiáng)度以及緩沖液的離子強(qiáng)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]圖的最大團(tuán)與最大獨(dú)立集粘貼DNA計(jì)算模型[J]. 范月科,強(qiáng)小利,許進(jìn). 計(jì)算機(jī)學(xué)報(bào). 2010(02)
[2]DNA縮短法計(jì)算模型求解最大獨(dú)立集問題[J]. 張成,楊靜,許進(jìn),趙東明. 科學(xué)通報(bào). 2009(24)
[3]0-1規(guī)劃問題的閉環(huán)DNA算法[J]. 周康,覃磊,同小軍,許進(jìn). 系統(tǒng)工程與電子技術(shù). 2009(04)
[4]基于閉環(huán)DNA計(jì)算的最大獨(dú)立集問題的算法[J]. 周康,同小軍,劉文斌,許進(jìn). 計(jì)算機(jī)工程. 2008(04)
[5]基于分治的背包問題DNA計(jì)算機(jī)算法[J]. 李肯立,姚鳳娟,李仁發(fā),許進(jìn). 計(jì)算機(jī)研究與發(fā)展. 2007(06)
[6]最小頂點(diǎn)覆蓋問題的閉環(huán)DNA算法[J]. 周康,許進(jìn). 計(jì)算機(jī)工程與應(yīng)用. 2006(20)
[7]邊連通度問題的三維DNA圖結(jié)構(gòu)解法[J]. 方剛,張社民,許進(jìn). 系統(tǒng)工程與電子技術(shù). 2006(01)
[8]最小頂點(diǎn)覆蓋問題的改進(jìn)粘貼模型[J]. 董亞非,張家秀,殷志祥,許進(jìn). 電子與信息學(xué)報(bào). 2005(04)
[9]圖的最小頂點(diǎn)覆蓋問題的質(zhì)粒DNA計(jì)算模型[J]. 王淑棟,劉文斌,許進(jìn). 華中科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2004(11)
[10]最小頂點(diǎn)覆蓋問題的DNA分子算法[J]. 高琳,許進(jìn). 系統(tǒng)工程與電子技術(shù). 2004(04)
本文編號:3307083
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