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家犬mtDNA高變區(qū)I多態(tài)性研究及法醫(yī)學意義

發(fā)布時間:2017-12-11 20:07

  本文關(guān)鍵詞:家犬mtDNA高變區(qū)I多態(tài)性研究及法醫(yī)學意義


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【摘要】:目的MtDNA呈母系遺傳,是群體遺傳學研究理想的遺傳標記物之一。利用直接測序的方法對毛發(fā)、白骨、腐敗組織等人源性疑難生物檢材的mtDNA多態(tài)檢驗,在案件的偵破中發(fā)揮著重要的作用。家犬是與人類關(guān)系最為親密的動物之一,其數(shù)量與日俱增,與家犬有關(guān)的案件時有發(fā)生。運用mtDNA測序法建立犬科動物毛發(fā)mtDNA高變區(qū)Ⅰ(HVR-I)多態(tài)的檢測方法,探討家犬與狼、不同品種家犬mtDNA單倍型及其相互關(guān)系,為涉及此類檢材案件的偵辦服務(wù)。 方法采集了拉布拉多犬、史賓格犬、德國牧羊犬、羅威納犬、藏獒、杜伯文犬、金毛尋獵犬、昆明犬和昆明本地犬9個品種,共107只及2只狼無關(guān)個體的毛發(fā)。采用Investigator試劑盒(QIAamo公司,德國)方法提取毛發(fā)樣本的mtDNA.用巢式PCR和直接測序進行mtDAN HVR-I測序檢測。運用)NAStar和Arlequin等軟件進行數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析。 結(jié)果107只家犬和2只狼的毛發(fā)樣本mtDNA HVR-I擴增的片段長643bp。家犬中共檢出27個多態(tài)點,多態(tài)位點的百分率為4.20%,多態(tài)點中以堿基轉(zhuǎn)換為主占25個,顛換的位點有1個,未檢見插入和缺失。昆明本地犬多態(tài)性位點最多有21個,其次是拉布拉多和昆明犬分別有18和17個多態(tài)性位點。堿基序列組成比率分別是26.76%(C)、30.19%(T)、27.38%(A)、15.67%(G)。根據(jù)上述多態(tài)點共界定A、B、C和F四個大的單倍群,21個單倍型,其頻率從0.94%-20.60%,其中單倍型A11的頻率最高。單倍型多樣性為0.898,平均核苷酸差異為5.66±2.74,平均核苷酸多樣度為0.0088±0.0047。在昆明犬和昆明本地犬都檢測出有9個單倍型,昆明犬的單倍型多樣性最高為0.847,其次為昆明本地犬,其單倍型多樣性為0.842。兩只狼的序列提交到美國國立生物技術(shù)息中心(NCBI)盲比結(jié)果為狼,其多態(tài)位點有兩個不同。 結(jié)論本研究獲取的犬科動物mtDNA HVR-I群體遺傳學基礎(chǔ)數(shù)據(jù),表明犬科動物mtDNAHVR-I有豐富的多態(tài)位點;家犬與狼的mtDNA單倍型分型不相同,不同犬種與mtDNA單倍型無關(guān)聯(lián),利用犬毛mtDNAHVR-I的多態(tài)性及其單倍型多樣性為相關(guān)案件偵查提供線索或依據(jù)。
【學位授予單位】:昆明醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2013
【分類號】:D919.4

【參考文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前6條

1 田力;宋小紅;云利兵;白鵬;劉志勇;蔣師;李英碧;;線粒體16srRNA和ND4基因在種屬鑒定中的應(yīng)用研究[J];中國法醫(yī)學雜志;2006年05期

2 程寶文;曾發(fā)明;路帆;李貌;翟滇;何瑋;邢豫明;魯靖;陳燕祥;吳道來;肖春杰;;中國蒙古族群體mtDNA測序的聚類分析及其法醫(yī)學意義[J];中國法醫(yī)學雜志;2007年02期

3 金鑫;Q謎,

本文編號:1279735


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