家犬mtDNA高變區(qū)I多態(tài)性研究及法醫(yī)學(xué)意義
發(fā)布時(shí)間:2017-12-11 20:07
本文關(guān)鍵詞:家犬mtDNA高變區(qū)I多態(tài)性研究及法醫(yī)學(xué)意義
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【摘要】:目的MtDNA呈母系遺傳,是群體遺傳學(xué)研究理想的遺傳標(biāo)記物之一。利用直接測(cè)序的方法對(duì)毛發(fā)、白骨、腐敗組織等人源性疑難生物檢材的mtDNA多態(tài)檢驗(yàn),在案件的偵破中發(fā)揮著重要的作用。家犬是與人類(lèi)關(guān)系最為親密的動(dòng)物之一,其數(shù)量與日俱增,與家犬有關(guān)的案件時(shí)有發(fā)生。運(yùn)用mtDNA測(cè)序法建立犬科動(dòng)物毛發(fā)mtDNA高變區(qū)Ⅰ(HVR-I)多態(tài)的檢測(cè)方法,探討家犬與狼、不同品種家犬mtDNA單倍型及其相互關(guān)系,為涉及此類(lèi)檢材案件的偵辦服務(wù)。 方法采集了拉布拉多犬、史賓格犬、德國(guó)牧羊犬、羅威納犬、藏獒、杜伯文犬、金毛尋獵犬、昆明犬和昆明本地犬9個(gè)品種,共107只及2只狼無(wú)關(guān)個(gè)體的毛發(fā)。采用Investigator試劑盒(QIAamo公司,德國(guó))方法提取毛發(fā)樣本的mtDNA.用巢式PCR和直接測(cè)序進(jìn)行mtDAN HVR-I測(cè)序檢測(cè)。運(yùn)用)NAStar和Arlequin等軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析。 結(jié)果107只家犬和2只狼的毛發(fā)樣本mtDNA HVR-I擴(kuò)增的片段長(zhǎng)643bp。家犬中共檢出27個(gè)多態(tài)點(diǎn),多態(tài)位點(diǎn)的百分率為4.20%,多態(tài)點(diǎn)中以堿基轉(zhuǎn)換為主占25個(gè),顛換的位點(diǎn)有1個(gè),未檢見(jiàn)插入和缺失。昆明本地犬多態(tài)性位點(diǎn)最多有21個(gè),其次是拉布拉多和昆明犬分別有18和17個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)。堿基序列組成比率分別是26.76%(C)、30.19%(T)、27.38%(A)、15.67%(G)。根據(jù)上述多態(tài)點(diǎn)共界定A、B、C和F四個(gè)大的單倍群,21個(gè)單倍型,其頻率從0.94%-20.60%,其中單倍型A11的頻率最高。單倍型多樣性為0.898,平均核苷酸差異為5.66±2.74,平均核苷酸多樣度為0.0088±0.0047。在昆明犬和昆明本地犬都檢測(cè)出有9個(gè)單倍型,昆明犬的單倍型多樣性最高為0.847,其次為昆明本地犬,其單倍型多樣性為0.842。兩只狼的序列提交到美國(guó)國(guó)立生物技術(shù)息中心(NCBI)盲比結(jié)果為狼,其多態(tài)位點(diǎn)有兩個(gè)不同。 結(jié)論本研究獲取的犬科動(dòng)物mtDNA HVR-I群體遺傳學(xué)基礎(chǔ)數(shù)據(jù),表明犬科動(dòng)物mtDNAHVR-I有豐富的多態(tài)位點(diǎn);家犬與狼的mtDNA單倍型分型不相同,不同犬種與mtDNA單倍型無(wú)關(guān)聯(lián),利用犬毛mtDNAHVR-I的多態(tài)性及其單倍型多樣性為相關(guān)案件偵查提供線索或依據(jù)。
【學(xué)位授予單位】:昆明醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2013
【分類(lèi)號(hào)】:D919.4
【參考文獻(xiàn)】
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1 田力;宋小紅;云利兵;白鵬;劉志勇;蔣師;李英碧;;線粒體16srRNA和ND4基因在種屬鑒定中的應(yīng)用研究[J];中國(guó)法醫(yī)學(xué)雜志;2006年05期
2 程寶文;曾發(fā)明;路帆;李貌;翟滇;何瑋;邢豫明;魯靖;陳燕祥;吳道來(lái);肖春杰;;中國(guó)蒙古族群體mtDNA測(cè)序的聚類(lèi)分析及其法醫(yī)學(xué)意義[J];中國(guó)法醫(yī)學(xué)雜志;2007年02期
3 金鑫;Q謎,
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