短花針茅荒漠草原單條土壤線蟲分子鑒定方法研究
發(fā)布時間:2023-10-02 06:47
土壤線蟲在土壤中具有重要的生態(tài)作用,目前大多通過形態(tài)學鑒定方法研究土壤線蟲,但該方法有很多弊端。為了更好地在分子水平上研究土壤線蟲群落及其多樣性,對內蒙古短花針茅荒漠草原土壤線蟲進行了單條線蟲的分子鑒定,通過比較4種不同的DNA提取方法(試劑盒法、凍融法、切割法、切割凍融法),確定了土壤線蟲最佳的DNA提取方法為切割凍融法。同時,選出10對土壤線蟲的通用引物經(jīng)過重復試驗,從10對引物中篩選出3對引物(分別為線蟲rDNA的18S區(qū)引物G18SU/R18Tyl1、28S區(qū)引物D2A/D3B、ITS區(qū)引物TW81/AB28)能達到較高的成功率,其中適用于內蒙古短花針茅荒漠草原土壤線蟲的最佳通用引物是:D2A/D3B(5‘-ACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTG-3’;5‘-TGCGAAGGAACCAGCTACTA-3’)。本研究通過明確短花針茅荒漠草原土壤線蟲最佳DNA提取方法和最佳通用引物,為進一步通過高通量測序技術在分子水平上進行土壤線蟲研究奠定基礎。
【文章頁數(shù)】:8 頁
【文章目錄】:
1 材料和方法
1.1 研究區(qū)概況
1.2 土壤樣品采集和線蟲形態(tài)學鑒定
1.3 土壤線蟲的分子鑒定方法
1.3.1 DNA提取方法
1.3.2 引物篩選
2 結果與分析
2.1 短花針茅荒漠草原土壤線蟲DNA提取的最佳方法
2.2 短花針茅荒漠草原土壤線蟲rDNA的18S區(qū)、28S區(qū)、ITS區(qū)最佳引物篩選
2.3 測序結果與分析
3 結論與討論
本文編號:3850311
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【文章目錄】:
1 材料和方法
1.1 研究區(qū)概況
1.2 土壤樣品采集和線蟲形態(tài)學鑒定
1.3 土壤線蟲的分子鑒定方法
1.3.1 DNA提取方法
1.3.2 引物篩選
2 結果與分析
2.1 短花針茅荒漠草原土壤線蟲DNA提取的最佳方法
2.2 短花針茅荒漠草原土壤線蟲rDNA的18S區(qū)、28S區(qū)、ITS區(qū)最佳引物篩選
2.3 測序結果與分析
3 結論與討論
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