土壤線蟲在土壤中具有重要的生態(tài)作用,目前大多通過(guò)形態(tài)學(xué)鑒定方法研究土壤線蟲,但該方法有很多弊端。為了更好地在分子水平上研究土壤線蟲群落及其多樣性,對(duì)內(nèi)蒙古短花針茅荒漠草原土壤線蟲進(jìn)行了單條線蟲的分子鑒定,通過(guò)比較4種不同的DNA提取方法(試劑盒法、凍融法、切割法、切割凍融法),確定了土壤線蟲最佳的DNA提取方法為切割凍融法。同時(shí),選出10對(duì)土壤線蟲的通用引物經(jīng)過(guò)重復(fù)試驗(yàn),從10對(duì)引物中篩選出3對(duì)引物(分別為線蟲rDNA的18S區(qū)引物G18SU/R18Tyl1、28S區(qū)引物D2A/D3B、ITS區(qū)引物TW81/AB28)能達(dá)到較高的成功率,其中適用于內(nèi)蒙古短花針茅荒漠草原土壤線蟲的最佳通用引物是:D2A/D3B(5‘-ACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTG-3’;5‘-TGCGAAGGAACCAGCTACTA-3’)。本研究通過(guò)明確短花針茅荒漠草原土壤線蟲最佳DNA提取方法和最佳通用引物,為進(jìn)一步通過(guò)高通量測(cè)序技術(shù)在分子水平上進(jìn)行土壤線蟲研究奠定基礎(chǔ)。

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【文章目錄】：
1 材料和方法
    1.1 研究區(qū)概況
    1.2 土壤樣品采集和線蟲形態(tài)學(xué)鑒定
    1.3 土壤線蟲的分子鑒定方法
        1.3.1 DNA提取方法
        1.3.2 引物篩選
2 結(jié)果與分析
    2.1 短花針茅荒漠草原土壤線蟲DNA提取的最佳方法
    2.2 短花針茅荒漠草原土壤線蟲rDNA的18S區(qū)、28S區(qū)、ITS區(qū)最佳引物篩選
    2.3 測(cè)序結(jié)果與分析
3 結(jié)論與討論



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