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中國東北梅花鹿種群遺傳多樣性初步研究

發(fā)布時間:2021-08-10 19:54
  梅花鹿(Cervus nippon)為國家Ⅰ級重點保護野生動物,分化為6個亞種:東北亞種(C.n.hortulorum)、華北亞種(C.n. mandurinui)、華南亞種(C.n.korpscni)、四川亞種(C.n.sichunicus)、山西亞種(C. n.grassianus)、臺灣亞種(C.n.taiouanus),其中山西亞種、華北亞種和臺灣亞種野外種群已經滅絕,野外殘存的東北亞種、華南亞種和四川亞種僅分布于黑龍江、吉林、江西、浙江、安徽、四川和甘肅等省破碎的棲息生境內。由于殘存的3個亞種種群數量稀少,野外很難發(fā)現,這對保護和恢復瀕臨滅絕的野生梅花鹿種群造成一定的困難。本文利用線粒體細胞色素6鑒定在中國東北地區(qū)采集的疑似野生梅花鹿樣品是否屬于梅花鹿,利用線粒體控制區(qū)比較野生東北梅花鹿遺傳多樣性與其他亞種的差異性,利用微衛(wèi)星標記綜合評價東北地區(qū)野生梅花鹿種群、圈養(yǎng)梅花鹿種群、散放梅花鹿種群遺傳多樣性現狀,得到結果如下:1.通過Blast比對線粒體細胞色素6序列確定糞便樣品的來源物種,確定52份疑似野生梅花鹿糞便樣品中屬于梅花鹿樣品18份,其他樣品均是狍子糞便樣品。2.采用1... 

【文章來源】:東北林業(yè)大學黑龍江省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數】:52 頁

【學位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 緒論
    1.1 梅花鹿概述
        1.1.1 梅花鹿的分類地位和分布
        1.1.2 梅花鹿保護遺傳學研究現狀
        1.1.3 種群主要威脅因素
    1.2 線粒體DNA(Mitochondrial DNA,mtDNA)
        1.2.1 線粒體細胞色素b
        1.2.2 線粒體控制區(qū)
    1.3 微衛(wèi)星DNA(Microsatellites DNA)
        1.3.1 微衛(wèi)星DNA的特點
        1.3.2 微衛(wèi)星DNA的應用
    1.4 研究目的和意義
2 材料與方法
    2.1 實驗材料
        2.1.1 實驗樣品
        2.1.2 主要試劑
        2.1.3 主要實驗儀器設備
    2.2 實驗方法
        2.2.1 DNA提取
        2.2.2 線粒體細胞色素b序列分析
        2.2.3 線粒體控制區(qū)全序列分析
        2.2.4 微衛(wèi)星分析
3 實驗結果
    3.1 糞便和肌肉DNA提取及引物擴增
    3.2 鑒定野生梅花鹿樣品
    3.3 個體識別
        3.3.1 圈養(yǎng)梅花鹿個體識別
        3.3.2 野生梅花鹿和圈養(yǎng)梅花鹿個體識別
    3.4 遺傳多樣性
        3.4.1 野生梅花鹿線粒體控制區(qū)檢測結果
        3.4.2 梅花鹿微衛(wèi)星檢測結果
4 討論
    4.1 取樣和總DNA提取
    4.2 引物篩選
    4.3 微衛(wèi)星引物的有效性評價
    4.4 東北地區(qū)野生梅花鹿分布
    4.5 東北地區(qū)梅花鹿遺傳多樣性評價
        4.5.1 梅花鹿線粒體遺傳多樣性評價
        4.5.2 梅花鹿微衛(wèi)星遺傳多樣性評價
        4.5.3 哈溫平衡和連鎖不平衡
    4.6 加強野生梅花鹿的保護力度
    4.7 保護愿景展望
結論
參考文獻
攻讀學位期間發(fā)表的學術論文
致謝


【參考文獻】:
期刊論文
[1]東北梅花鹿線粒體COⅡ基因序列的遺傳結構及其系統(tǒng)發(fā)育分析[J]. 徐佳萍,榮敏,楊福合,邢秀梅.  特產研究. 2011(04)
[2]應用mtDNA Cytb基因全序列分析中國5個馬鹿群體的遺傳多樣性和系統(tǒng)發(fā)育[J]. 張麗,滾雙寶,雷天云,劉麗霞,秦大偉,趙世峰.  華北農學報. 2010(04)
[3]吉林梅花鹿IGF-I基因啟動子區(qū)單核苷酸多態(tài)性分析[J]. 李趙志,嚴昌國,張立春,曹陽,金海國.  安徽農業(yè)科學. 2010(13)
[4]梅花鹿3個種群遺傳多樣性的微衛(wèi)星標記分析[J]. 孫海濤,李馨,耿忠誠,楊雋,劉文峰,王忠武,黃淑元.  動物學雜志. 2009(03)
[5]梅花鹿的微衛(wèi)星多態(tài)性及種群的遺傳結構[J]. 吳華,胡杰,萬秋紅,方盛國,劉武華,章叔巖.  獸類學報. 2008(02)
[6]勐養(yǎng)保護區(qū)亞洲象微衛(wèi)星位點篩選及種群遺傳多樣性分析[J]. 蔡清秀,林柳,潘文婧,羅述金,張立.  獸類學報. 2008(02)
[7]韓國與中國東北地區(qū)松鼠線粒體DNA控制區(qū)的序列變異(英文)[J]. KOH Hung Sun,張明海,王金星,SHIN Dong Sun,LEEBaeGeun.  獸類學報. 2006(01)
[8]從Cyt b基因全序列分析中國10個黃牛品種的系統(tǒng)進化關系[J]. 蔡欣,陳宏,雷初朝,王珊,張志清,薛愷,王新莊.  中國生物化學與分子生物學報. 2006(02)
[9]中國梅花鹿(Cervus nippon)遺傳多樣性及與日本梅花鹿間的系統(tǒng)關系[J]. 呂曉平,魏輔文,李明,楊光,劉海.  科學通報. 2006(03)
[10]川金絲猴群體的微衛(wèi)星多態(tài)性研究[J]. 潘登,李英,胡鴻興,蒙世杰,門正明,符云新,張亞平.  科學通報. 2005(22)

博士論文
[1]梅花鹿保護遺傳學研究[D]. 吳華.浙江大學 2004
[2]虎(Panthera tigris)微衛(wèi)星位點多態(tài)性及其在圈養(yǎng)種群管理中的應用[D]. 徐艷春.東北林業(yè)大學 2001

碩士論文
[1]長春雙陽梅花鹿群體遺傳結構的研究與分析[D]. 牛偉萍.吉林大學 2011



本文編號:3334683

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