西北太平洋五種海洋魚類的分子系統(tǒng)地理學(xué)研究
發(fā)布時(shí)間:2021-03-12 02:24
本文以西北太平洋小黃魚(Larimichthys polyactis)、高眼鰈(Cleisthenes herzensteini)、斯氏美首鰈(Glyptocephalus stelleri)、長(zhǎng)鰈(Tanakius kitaharai)、白氏文昌魚(branchiostoma belcheri)和帶魚(Trichiurus japonicus)為研究對(duì)象,采用線粒體DNA分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)這六種海洋物種的分子系統(tǒng)地理學(xué)進(jìn)行了研究,系統(tǒng)研究了這五種魚類和文昌魚的分子系統(tǒng)地理分布模式,闡述了五種海洋魚類和文昌魚的遺傳多樣性水平和遺傳結(jié)構(gòu)現(xiàn)狀,探討了其群體動(dòng)態(tài)歷史的演化過程,揭示歷史因素(更新世冰期等)和當(dāng)前環(huán)境因素(洋流等)對(duì)塑造海洋魚類群體遺傳結(jié)構(gòu)和分子系統(tǒng)地理分布模式的重要作用。主要研究結(jié)果如下:1、研究了小黃魚群體遺傳多樣性水平、遺傳結(jié)構(gòu)現(xiàn)狀及其群體動(dòng)態(tài)歷史,對(duì)小黃魚分布區(qū)內(nèi)16個(gè)群體共298個(gè)個(gè)體的線粒體DNA控制區(qū)第一高變區(qū)序列進(jìn)行了測(cè)定和分析。在小黃魚控制區(qū)序列上檢測(cè)到了高水平的基因多樣度,揭示小黃魚存在較高水平的遺傳多樣性。分子方差分析(AMOVA)和兩兩群體相比較的FST結(jié)果...
【文章來源】:中國(guó)海洋大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:156 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
中文摘要
英文摘要
第一章 分子系統(tǒng)地理學(xué)在海洋魚類中的研究進(jìn)展
1.1 前言
1.2 發(fā)展簡(jiǎn)史
1.3 研究?jī)?nèi)容
1.4 種內(nèi)系統(tǒng)地理格局的影響因素
1.4.1 外部因素
1.4.2 內(nèi)部因素
1.5 西北太平洋分子系統(tǒng)地理學(xué)研究
第二章 小黃魚群體遺傳多樣性和群體遺傳結(jié)構(gòu)研究
2.1 前言
2.2 材料與方法
2.2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.2.2 基因組DNA提取
2.2.3 PCR擴(kuò)增
2.2.4 序列測(cè)定
2.2.5 數(shù)據(jù)分析
2.3 結(jié)果
2.3.1 種內(nèi)序列多態(tài)
2.3.2 遺傳學(xué)關(guān)系
2.3.3 群體歷史動(dòng)態(tài)
2.3.4 群體遺傳結(jié)構(gòu)
2.4 討論
2.4.1 遺傳多態(tài)性研究
2.4.2 群體遺傳結(jié)構(gòu)研究
第三章 高眼鰈群體遺傳結(jié)構(gòu)研究
3.1 前言
3.2 材料與方法
3.2.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.2.2 基因組DNA提取
3.2.3 PCR擴(kuò)增
3.2.4 序列測(cè)定
3.2.5 數(shù)據(jù)分析
3.3 結(jié)果
3.3.1 種內(nèi)序列多態(tài)
3.3.2 NCPA分析
3.3.3 群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
3.3.4 群體歷史動(dòng)態(tài)
3.4 討論
3.4.1 遺傳多態(tài)性研究
3.4.2 群體遺傳結(jié)構(gòu)研究
3.4.3 群體動(dòng)態(tài)歷史研究
第四章 斯氏美首鰈分子系統(tǒng)地理學(xué)研究
4.1 前言
4.2 材料與方法
4.2.1 實(shí)驗(yàn)材料
4.2.2 基因組DNA提取
4.2.3 PCR擴(kuò)增
4.2.4 序列測(cè)定
4.2.5 數(shù)據(jù)分析
4.3 結(jié)果
4.3.1 種內(nèi)序列多態(tài)
4.3.2 群體動(dòng)態(tài)歷史研究
4.3.3 群體遺傳結(jié)構(gòu)研究
4.4 討論
4.4.1 遺傳多態(tài)性研究
4.4.2 群體動(dòng)態(tài)歷史研究
4.4.3 群體遺傳結(jié)構(gòu)研究
第五章 長(zhǎng)鰈群體遺傳多樣性與群體遺傳結(jié)構(gòu)研究
5.1 前言
5.2 材料與方法
5.2.1 實(shí)驗(yàn)材料
5.2.2 基因組DNA提取
5.2.3 PCR擴(kuò)增
5.2.4 序列測(cè)定
5.2.5 數(shù)據(jù)分析
5.3 結(jié)果
5.3.1 種內(nèi)序列多態(tài)
5.3.2 群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
5.3.3 遺傳發(fā)育分析
5.4 討論
5.4.1 遺傳多態(tài)性研究
5.4.2 群體遺傳結(jié)構(gòu)研究
第六章 基于線粒體DNA探討文昌魚屬的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系
6.1 前言
6.2 材料與方法
6.2.1 實(shí)驗(yàn)材料
6.2.2 基因組DNA提取
6.2.3 PCR擴(kuò)增
6.2.4 序列測(cè)定
6.2.5 數(shù)據(jù)分析
6.3 結(jié)果
6.3.1 序列變異分析
6.3.2 系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系
6.4 討論
第七章 帶魚群體遺傳結(jié)構(gòu)與動(dòng)態(tài)歷史研究
7.1 前言
7.2 材料與方法
7.2.1 實(shí)驗(yàn)材料
7.2.2 基因組DNA提取
7.2.3 PCR擴(kuò)增
7.2.4 序列測(cè)定
7.2.5 數(shù)據(jù)分析
7.3 結(jié)果
7.3.1 種內(nèi)序列多態(tài)
7.3.2 遺傳學(xué)關(guān)系
7.3.3 群體歷史動(dòng)態(tài)
7.3.4 群體遺傳結(jié)構(gòu)
7.4 討論
7.4.1 遺傳多態(tài)性研究
7.4.2 群體動(dòng)態(tài)歷史研究
7.4.3 群體遺傳結(jié)構(gòu)研究
第八章 總結(jié)
參考文獻(xiàn)
致謝辭
在學(xué)期間發(fā)表的論文
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]兩種黃蓋鰈線粒體DNA部分片段比較分析[J]. 張巖,肖永雙,高天翔,于函. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2009(02)
[2]從線粒體控制區(qū)全序列變異看短頜鱭和湖鱭的物種有效性[J]. 唐文喬,胡雪蓮,楊金權(quán). 生物多樣性. 2007(03)
[3]利用線粒體DNA控制區(qū)序列分析細(xì)鱗鮭種群的遺傳結(jié)構(gòu)[J]. 夏穎哲,盛巖,陳宜瑜. 生物多樣性. 2006(01)
[4]黃海南部小黃魚群體遺傳多樣性研究[J]. 許廣平,仲霞銘,丁亞平,劉培庭,湯建華,許璞. 海洋科學(xué). 2005(11)
[5]東海區(qū)小黃魚空間格局的地統(tǒng)計(jì)學(xué)分析[J]. 張寒野,程家驊. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2005(04)
[6]文昌魚秦皇島、青島和廈門地理種群形態(tài)特征的分化[J]. 閆路娜,左惠凱,曹玉萍. 動(dòng)物學(xué)研究. 2005(03)
[7]南黃海族小黃魚地方支族群洄游途徑與環(huán)境關(guān)系的探討[J]. 胡成建,張晶. 海洋漁業(yè). 2005(02)
[8]魚類線粒體DNA研究新進(jìn)展[J]. 郭新紅,劉少軍,劉巧,劉筠. 遺傳學(xué)報(bào). 2004(09)
[9]通過Cyt b基因同源序列比較評(píng)估廈門文昌魚的分類學(xué)地位[J]. 王義權(quán),許群山,彭宣憲,周涵韜. 動(dòng)物學(xué)報(bào). 2004(02)
[10]昌黎海區(qū)文昌魚初步調(diào)查[J]. 曹玉萍,閆路娜,謝松,劉震. 動(dòng)物學(xué)雜志. 2001(03)
本文編號(hào):3077514
【文章來源】:中國(guó)海洋大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:156 頁(yè)
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英文摘要
第一章 分子系統(tǒng)地理學(xué)在海洋魚類中的研究進(jìn)展
1.1 前言
1.2 發(fā)展簡(jiǎn)史
1.3 研究?jī)?nèi)容
1.4 種內(nèi)系統(tǒng)地理格局的影響因素
1.4.1 外部因素
1.4.2 內(nèi)部因素
1.5 西北太平洋分子系統(tǒng)地理學(xué)研究
第二章 小黃魚群體遺傳多樣性和群體遺傳結(jié)構(gòu)研究
2.1 前言
2.2 材料與方法
2.2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.2.2 基因組DNA提取
2.2.3 PCR擴(kuò)增
2.2.4 序列測(cè)定
2.2.5 數(shù)據(jù)分析
2.3 結(jié)果
2.3.1 種內(nèi)序列多態(tài)
2.3.2 遺傳學(xué)關(guān)系
2.3.3 群體歷史動(dòng)態(tài)
2.3.4 群體遺傳結(jié)構(gòu)
2.4 討論
2.4.1 遺傳多態(tài)性研究
2.4.2 群體遺傳結(jié)構(gòu)研究
第三章 高眼鰈群體遺傳結(jié)構(gòu)研究
3.1 前言
3.2 材料與方法
3.2.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.2.2 基因組DNA提取
3.2.3 PCR擴(kuò)增
3.2.4 序列測(cè)定
3.2.5 數(shù)據(jù)分析
3.3 結(jié)果
3.3.1 種內(nèi)序列多態(tài)
3.3.2 NCPA分析
3.3.3 群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
3.3.4 群體歷史動(dòng)態(tài)
3.4 討論
3.4.1 遺傳多態(tài)性研究
3.4.2 群體遺傳結(jié)構(gòu)研究
3.4.3 群體動(dòng)態(tài)歷史研究
第四章 斯氏美首鰈分子系統(tǒng)地理學(xué)研究
4.1 前言
4.2 材料與方法
4.2.1 實(shí)驗(yàn)材料
4.2.2 基因組DNA提取
4.2.3 PCR擴(kuò)增
4.2.4 序列測(cè)定
4.2.5 數(shù)據(jù)分析
4.3 結(jié)果
4.3.1 種內(nèi)序列多態(tài)
4.3.2 群體動(dòng)態(tài)歷史研究
4.3.3 群體遺傳結(jié)構(gòu)研究
4.4 討論
4.4.1 遺傳多態(tài)性研究
4.4.2 群體動(dòng)態(tài)歷史研究
4.4.3 群體遺傳結(jié)構(gòu)研究
第五章 長(zhǎng)鰈群體遺傳多樣性與群體遺傳結(jié)構(gòu)研究
5.1 前言
5.2 材料與方法
5.2.1 實(shí)驗(yàn)材料
5.2.2 基因組DNA提取
5.2.3 PCR擴(kuò)增
5.2.4 序列測(cè)定
5.2.5 數(shù)據(jù)分析
5.3 結(jié)果
5.3.1 種內(nèi)序列多態(tài)
5.3.2 群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
5.3.3 遺傳發(fā)育分析
5.4 討論
5.4.1 遺傳多態(tài)性研究
5.4.2 群體遺傳結(jié)構(gòu)研究
第六章 基于線粒體DNA探討文昌魚屬的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系
6.1 前言
6.2 材料與方法
6.2.1 實(shí)驗(yàn)材料
6.2.2 基因組DNA提取
6.2.3 PCR擴(kuò)增
6.2.4 序列測(cè)定
6.2.5 數(shù)據(jù)分析
6.3 結(jié)果
6.3.1 序列變異分析
6.3.2 系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系
6.4 討論
第七章 帶魚群體遺傳結(jié)構(gòu)與動(dòng)態(tài)歷史研究
7.1 前言
7.2 材料與方法
7.2.1 實(shí)驗(yàn)材料
7.2.2 基因組DNA提取
7.2.3 PCR擴(kuò)增
7.2.4 序列測(cè)定
7.2.5 數(shù)據(jù)分析
7.3 結(jié)果
7.3.1 種內(nèi)序列多態(tài)
7.3.2 遺傳學(xué)關(guān)系
7.3.3 群體歷史動(dòng)態(tài)
7.3.4 群體遺傳結(jié)構(gòu)
7.4 討論
7.4.1 遺傳多態(tài)性研究
7.4.2 群體動(dòng)態(tài)歷史研究
7.4.3 群體遺傳結(jié)構(gòu)研究
第八章 總結(jié)
參考文獻(xiàn)
致謝辭
在學(xué)期間發(fā)表的論文
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]兩種黃蓋鰈線粒體DNA部分片段比較分析[J]. 張巖,肖永雙,高天翔,于函. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2009(02)
[2]從線粒體控制區(qū)全序列變異看短頜鱭和湖鱭的物種有效性[J]. 唐文喬,胡雪蓮,楊金權(quán). 生物多樣性. 2007(03)
[3]利用線粒體DNA控制區(qū)序列分析細(xì)鱗鮭種群的遺傳結(jié)構(gòu)[J]. 夏穎哲,盛巖,陳宜瑜. 生物多樣性. 2006(01)
[4]黃海南部小黃魚群體遺傳多樣性研究[J]. 許廣平,仲霞銘,丁亞平,劉培庭,湯建華,許璞. 海洋科學(xué). 2005(11)
[5]東海區(qū)小黃魚空間格局的地統(tǒng)計(jì)學(xué)分析[J]. 張寒野,程家驊. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2005(04)
[6]文昌魚秦皇島、青島和廈門地理種群形態(tài)特征的分化[J]. 閆路娜,左惠凱,曹玉萍. 動(dòng)物學(xué)研究. 2005(03)
[7]南黃海族小黃魚地方支族群洄游途徑與環(huán)境關(guān)系的探討[J]. 胡成建,張晶. 海洋漁業(yè). 2005(02)
[8]魚類線粒體DNA研究新進(jìn)展[J]. 郭新紅,劉少軍,劉巧,劉筠. 遺傳學(xué)報(bào). 2004(09)
[9]通過Cyt b基因同源序列比較評(píng)估廈門文昌魚的分類學(xué)地位[J]. 王義權(quán),許群山,彭宣憲,周涵韜. 動(dòng)物學(xué)報(bào). 2004(02)
[10]昌黎海區(qū)文昌魚初步調(diào)查[J]. 曹玉萍,閆路娜,謝松,劉震. 動(dòng)物學(xué)雜志. 2001(03)
本文編號(hào):3077514
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