為揭示在生物冶金工業(yè)生態(tài)系統(tǒng)和酸性礦山排水系統(tǒng)中占主導地位的嗜鐵鉤端螺旋菌（Leptospirillum ferriphilum）種內(nèi)進化機制,以嗜鐵鉤端螺旋菌株L. ferriphilum YSK、L. ferriphilum DX和L. ferriphilum ZJ的全基因組序列為研究對象,通過高通量測序并與已有的L. ferriphilumML-04菌株全基因組序列進行比較基因組學研究。結(jié)果表明,嗜鐵鉤端螺旋菌發(fā)生廣泛的種內(nèi)變異,可能來源于噬菌體的新基因片段的缺失與插入是導致嗜鐵鉤端螺旋菌基因組產(chǎn)生該異質(zhì)性的主要原因。另外,意外地發(fā)現(xiàn)嗜鐵鉤端螺旋菌株L. ferriphilumYSK和L. ferriphilumZJ的基因組中存在固氮基因簇。深入分析并進一步實驗證實菌株L. ferriphilumYSK的固氮基因簇繼承自其原始祖先而非源自橫向基因轉(zhuǎn)移。綜合上述研究結(jié)果可知,嗜鐵鉤端螺旋菌種群正在生物冶金體系中經(jīng)歷頻繁的基因重組,在近期的進化中產(chǎn)生許多緊密相關(guān)的基因組類型;同時,嗜鐵鉤端螺旋菌的重組過程深刻塑造其生理特性,并為其適應(yīng)不同的生態(tài)位奠定基礎(chǔ)。 

【文章來源】：Transactions of Nonferrous Metals Society of China. 2020,30(06)EISCICSCD

【文章頁數(shù)】：12 頁

【文章目錄】：
1 Introduction
2 Experimental
    2.1 Growth of L.ferriphilum strains and DNA isolation
    2.2 Genome sequencing,assembly and annotation
    2.3 Comparative genome analysis
    2.4 Phylogenetic analysis
    2.5 Nitrogen-free growth and RNA extraction
    2.6 Real-time quantitative PCR
3 Results and discussion
    3.1 General features of genomes of L.ferriphilum isolates
    3.2 Whole genome comparison of isolate YSK and ML-04
    3.3 nif gene cluster in L.ferriphillum YSK
    3.4 Quantitative N-cycling gene expression
4 Conclusions


【參考文獻】：
期刊論文
[1]不同碳材料輔助下混合中度嗜熱微生物浸出黃銅礦的比較研究（英文）[J]. 朱萍,劉學端,陳愛佳,劉宏偉,尹華群,邱冠周,郝曉東,梁伊麗.  Transactions of Nonferrous Metals Society of China. 2019(06)



本文編號：3222050