物種形成是生物多樣性的基礎(chǔ)。生態(tài)物種形成（ecological speciation）是指以生態(tài)為基礎(chǔ)的歧化選擇使祖先物種的不同群體分化產(chǎn)生生殖隔離的物種形成過(guò)程。生態(tài)物種形成可分為輻射式（radiative speciation）和二歧式（bifurcating divergence）兩種方式。以色列境內(nèi)的盲鼴形鼠（Spalax）對(duì)不同氣候帶的適應(yīng)歧化形成了不同的物種,但其成種式樣尚未闡明。本研究通過(guò)比較Spalax屬的5個(gè)不同物種的基因組,解析了物種形成過(guò)程中的基因組分化、群體歷史、物種形成式樣及其各物種對(duì)不同氣候帶適應(yīng)的關(guān)鍵基因,主要研究結(jié)果如下:1、對(duì)分布于以色列境內(nèi)5個(gè)不同地區(qū)的52個(gè)個(gè)體進(jìn)行全基因組重測(cè)序,mapping到參考基因組,經(jīng)過(guò)過(guò)濾去除親緣關(guān)系近的個(gè)體后得到41個(gè)個(gè)體的全基因組數(shù)據(jù),采用進(jìn)化樹分析、主成分分析和遺傳結(jié)構(gòu)分析,結(jié)果表明Spalax屬5個(gè)物種呈現(xiàn)顯著的遺傳分化。同一物種內(nèi)的個(gè)體聚集在一起,5個(gè)種群相互分開。各物種編碼區(qū)和非編碼區(qū)SNPs構(gòu)建的進(jìn)化樹呈現(xiàn)相同的遺傳結(jié)構(gòu)。2、Spalax的5個(gè)物種均以二歧方式成種（其中S.galili chalk和S.gal...

【文章頁(yè)數(shù)】：79 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖1輻射式成種（A）和二歧式成種（B）形成式樣示意圖

1概述2態(tài)環(huán)境，進(jìn)化出多樣的表型，這種物種形成方式主要發(fā)生在島嶼物種形成過(guò)程中（圖1A）。由于它們幾乎同時(shí)分化，導(dǎo)致不同的種間基因流頻繁發(fā)生，很多情況下種對(duì)之間的基因流大小類似；并且由于分化時(shí)間短，祖先多態(tài)性也經(jīng)常保留在物種內(nèi)，和基因流一起導(dǎo)致物種樹呈現(xiàn)平行式而非二歧式[8]。相....

圖2（A）染色體正常狀態(tài)和（B）羅伯遜易位狀態(tài)形成示意圖

┥⒌娜?齜較蛭?投?砂氳骸⑽誑死嫉厙?以及中東和非洲北部地區(qū)。這種氣候適應(yīng)性呈現(xiàn)出具有明顯趨勢(shì)的染色體數(shù)目差異，在盲鼴形鼠起源地區(qū)的染色體數(shù)目為2n=38，三個(gè)擴(kuò)散方向的終點(diǎn)均為2n=62[25]。在以色列境內(nèi)通過(guò)形態(tài)學(xué)、生理學(xué)、行為學(xué)、基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)等手段將盲鼴形鼠屬劃分....

圖3Spalax屬物種染色體羅伯遜易位示意圖

1概述4羅伯遜易位（Robertsoniantranslocation），是在1916年由羅伯遜（Robertson）所發(fā)現(xiàn)而得名，是哺乳動(dòng)物中最常見的染色體重排之一[26,27]，發(fā)生易位時(shí)兩條臨近的著絲粒染色體首先斷裂，然后它們的長(zhǎng)臂在著絲粒處接合形成一條衍生染色體；兩個(gè)短臂....

圖4（A）盲鼴形鼠的地理分布、氣候特征、年降雨量與降雨天數(shù)

1概述5體條數(shù)為2n=58，年降雨量為500～650mm，降雨天數(shù)為44～55天；S.judaei分布在溫暖干燥的以色列中南部地區(qū)，深入到內(nèi)蓋夫沙漠北部地區(qū)，如圖4A中的棕色區(qū)域，其染色體條數(shù)為2n=60，年降雨量為100～500mm，年降雨天數(shù)為15～45天；圖中的白色區(qū)域?yàn)榘?...

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