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盲鼴形鼠屬(Spalax)物種形成式樣的基因組研究

發(fā)布時(shí)間:2024-12-17 21:45
  物種形成是生物多樣性的基礎(chǔ)。生態(tài)物種形成(ecological speciation)是指以生態(tài)為基礎(chǔ)的歧化選擇使祖先物種的不同群體分化產(chǎn)生生殖隔離的物種形成過程。生態(tài)物種形成可分為輻射式(radiative speciation)和二歧式(bifurcating divergence)兩種方式。以色列境內(nèi)的盲鼴形鼠(Spalax)對(duì)不同氣候帶的適應(yīng)歧化形成了不同的物種,但其成種式樣尚未闡明。本研究通過比較Spalax屬的5個(gè)不同物種的基因組,解析了物種形成過程中的基因組分化、群體歷史、物種形成式樣及其各物種對(duì)不同氣候帶適應(yīng)的關(guān)鍵基因,主要研究結(jié)果如下:1、對(duì)分布于以色列境內(nèi)5個(gè)不同地區(qū)的52個(gè)個(gè)體進(jìn)行全基因組重測序,mapping到參考基因組,經(jīng)過過濾去除親緣關(guān)系近的個(gè)體后得到41個(gè)個(gè)體的全基因組數(shù)據(jù),采用進(jìn)化樹分析、主成分分析和遺傳結(jié)構(gòu)分析,結(jié)果表明Spalax屬5個(gè)物種呈現(xiàn)顯著的遺傳分化。同一物種內(nèi)的個(gè)體聚集在一起,5個(gè)種群相互分開。各物種編碼區(qū)和非編碼區(qū)SNPs構(gòu)建的進(jìn)化樹呈現(xiàn)相同的遺傳結(jié)構(gòu)。2、Spalax的5個(gè)物種均以二歧方式成種(其中S.galili chalk和S.gal...

【文章頁數(shù)】:79 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

圖1輻射式成種(A)和二歧式成種(B)形成式樣示意圖

圖1輻射式成種(A)和二歧式成種(B)形成式樣示意圖

1概述2態(tài)環(huán)境,進(jìn)化出多樣的表型,這種物種形成方式主要發(fā)生在島嶼物種形成過程中(圖1A)。由于它們幾乎同時(shí)分化,導(dǎo)致不同的種間基因流頻繁發(fā)生,很多情況下種對(duì)之間的基因流大小類似;并且由于分化時(shí)間短,祖先多態(tài)性也經(jīng)常保留在物種內(nèi),和基因流一起導(dǎo)致物種樹呈現(xiàn)平行式而非二歧式[8]。相....


圖2(A)染色體正常狀態(tài)和(B)羅伯遜易位狀態(tài)形成示意圖

圖2(A)染色體正常狀態(tài)和(B)羅伯遜易位狀態(tài)形成示意圖

┥⒌娜?齜較蛭?投?砂氳骸⑽誑死嫉厙?以及中東和非洲北部地區(qū)。這種氣候適應(yīng)性呈現(xiàn)出具有明顯趨勢的染色體數(shù)目差異,在盲鼴形鼠起源地區(qū)的染色體數(shù)目為2n=38,三個(gè)擴(kuò)散方向的終點(diǎn)均為2n=62[25]。在以色列境內(nèi)通過形態(tài)學(xué)、生理學(xué)、行為學(xué)、基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)等手段將盲鼴形鼠屬劃分....


圖3Spalax屬物種染色體羅伯遜易位示意圖

圖3Spalax屬物種染色體羅伯遜易位示意圖

1概述4羅伯遜易位(Robertsoniantranslocation),是在1916年由羅伯遜(Robertson)所發(fā)現(xiàn)而得名,是哺乳動(dòng)物中最常見的染色體重排之一[26,27],發(fā)生易位時(shí)兩條臨近的著絲粒染色體首先斷裂,然后它們的長臂在著絲粒處接合形成一條衍生染色體;兩個(gè)短臂....


圖4(A)盲鼴形鼠的地理分布、氣候特征、年降雨量與降雨天數(shù)

圖4(A)盲鼴形鼠的地理分布、氣候特征、年降雨量與降雨天數(shù)

1概述5體條數(shù)為2n=58,年降雨量為500~650mm,降雨天數(shù)為44~55天;S.judaei分布在溫暖干燥的以色列中南部地區(qū),深入到內(nèi)蓋夫沙漠北部地區(qū),如圖4A中的棕色區(qū)域,其染色體條數(shù)為2n=60,年降雨量為100~500mm,年降雨天數(shù)為15~45天;圖中的白色區(qū)域?yàn)榘?...



本文編號(hào):4016574

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