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DNA甲基化酶家族生物信息學(xué)分析及其在尼羅羅非魚(yú)中的表達(dá)和功能初探

發(fā)布時(shí)間:2024-06-11 23:24
  表觀(guān)遺傳學(xué)研究在不改變DNA序列下的可遺傳改變,DNA甲基化是表觀(guān)遺傳學(xué)研究的重要內(nèi)容之一。以往的研究表明DNA甲基化在魚(yú)類(lèi)的性別決定和分化過(guò)程中具有重要作用,DNA甲基化酶在此過(guò)程中發(fā)揮的作用仍不清楚,本研究分析了DNA甲基化酶在脊椎動(dòng)物中的系統(tǒng)進(jìn)化及其成員擴(kuò)增與動(dòng)物全基因組復(fù)制的關(guān)系,并研究了DNA甲基化酶家族成員在尼羅羅非魚(yú)不同組織、不同發(fā)育時(shí)期雌魚(yú)(卵巢)和雄魚(yú)(精巢)性腺以及由雌轉(zhuǎn)雄次發(fā)性逆轉(zhuǎn)過(guò)程中的表達(dá)。此外,在離體條件下,采用DNA甲基化酶抑制劑5-氮雜-2-脫氧胞苷(5-aza-dC)體外孵育羅非魚(yú)性腺組織,研究了抑制劑處理對(duì)DNA甲基化酶以及雌、雄通路關(guān)鍵基因表達(dá)的影響;在在體條件下,采用不同濃度梯度5-aza-dC浸浴或腹腔注射仔稚魚(yú),研究了抑制劑處理對(duì)羅非魚(yú)幼魚(yú)骨骼發(fā)育和性腺分化的影響,初步評(píng)估了DNA甲基化酶在尼羅羅非魚(yú)發(fā)育過(guò)程中的功能。主要研究結(jié)果如下:1)本研究在尼羅羅非魚(yú)基因組中鑒定了7個(gè)DNA甲基化酶家族成員,包括dnmt1、dnmt2、dnmt3aa、dnmt3ab、dnmt3ba、dnmt3bb.1和dnmt3bb.2,此外還從海鞘、象鯊、腔棘魚(yú)、爪...

【文章頁(yè)數(shù)】:73 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第1章 文獻(xiàn)綜述
    1 魚(yú)類(lèi)性別決定與性腺分化
        1.1 魚(yú)類(lèi)的性別
        1.2 魚(yú)類(lèi)的性別決定方式
        1.3 魚(yú)類(lèi)的性別分化
    2 DNA甲基化
        2.1 DNA甲基化機(jī)制
        2.2 DNA甲基化與基因表達(dá)調(diào)控
        2.3 DNA甲基化酶分類(lèi)及成員
        2.4 DNA甲基化酶結(jié)構(gòu)與功能
        2.5 DNA甲基化酶在脊椎動(dòng)物的表達(dá)模式
        2.6 DNA甲基化和DNA甲基化酶與性腺發(fā)育
    3 科學(xué)問(wèn)題的提出和本研究的目的意義
第2章 DNA甲基化酶家族生物信息學(xué)分析及表達(dá)研究
    1 引言
    2 材料和方法
        2.1 實(shí)驗(yàn)魚(yú)
        2.2 DNA甲基化酶家族成員鑒定
        2.3 DNA甲基化酶家族系統(tǒng)發(fā)育分析及基因定位
        2.4 DNA甲基化酶家族共線(xiàn)性分析
        2.5 DNA甲基化酶家族成員在羅非魚(yú)中的時(shí)空表達(dá)模式分析
        2.6 DNA甲基化酶家族成員表達(dá)模式驗(yàn)證
    3 結(jié)果
        3.1 尼羅羅非魚(yú)DNA甲基化酶鑒定
        3.2 DNA甲基化酶系統(tǒng)進(jìn)化分析
        3.3 DNA甲基化酶家族成員共線(xiàn)性分析
        3.4 DNA甲基化酶在羅非魚(yú)中的時(shí)空表達(dá)模式
        3.5 DNA甲基化酶表達(dá)模式驗(yàn)證結(jié)果分析
    4 討論
        4.1 DNA甲基化酶家族成員的分離、系統(tǒng)發(fā)生及共線(xiàn)性
        4.2 從頭甲基化酶在羅非魚(yú)性腺中的表達(dá)具有性差
        4.3 DNA甲基化酶復(fù)制基因在羅非魚(yú)中的表達(dá)模式發(fā)生分歧
第3章 DNA甲基化酶在羅非魚(yú)性腺發(fā)育中的功能
    1 引言
    2 材料和方法
        2.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
        2.2 主要試劑和儀器
        2.3 實(shí)驗(yàn)方法
    3 結(jié)果
        3.1 抑制劑體外孵育對(duì)甲基化酶基因和性腺分化關(guān)鍵基因表達(dá)的影響
        3.2 抑制劑浸浴后羅非魚(yú)畸形率和死亡率統(tǒng)計(jì)
        3.3 抑制劑腹腔注射后羅非魚(yú)性腺組織學(xué)檢測(cè)
    4 討論
        4.1 DNA甲基化酶抑制劑體外孵育上調(diào)性腺分化關(guān)鍵基因的表達(dá)
        4.2 DNA甲基化酶抑制劑浸浴導(dǎo)致羅非魚(yú)畸形率和死亡率增加
        4.3 DNA甲基化酶抑制劑腹腔注射使雌性羅非魚(yú)性逆轉(zhuǎn)
第4章 結(jié)論
本研究的不足與展望
參考文獻(xiàn)
致謝
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本文編號(hào):3992869

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