每個細(xì)胞的染色質(zhì)DNA只有一部分表現(xiàn)出生物學(xué)活性,其染色質(zhì)結(jié)構(gòu)疏松,基因組DNA呈松散狀態(tài),該區(qū)域能夠與轉(zhuǎn)錄元件結(jié)合,是染色質(zhì)中基因表達(dá)活躍的部分,人們稱之為染色質(zhì)開放區(qū)域或者易接近染色質(zhì)區(qū)域,剩下不活躍的部分則被緊密包裝成高度凝聚的染色質(zhì)而沉默下來。染色質(zhì)的開放和關(guān)閉狀態(tài)直接影響了包括基因表達(dá)、DNA復(fù)制和DNA修復(fù)在內(nèi)的多種基本細(xì)胞過程。與此同時,染色質(zhì)開放區(qū)域也是多種表觀遺傳修飾的共同結(jié)果,特別是與促進(jìn)基因表達(dá)相關(guān)的表觀遺傳修飾的共同作用結(jié)果�？寺游锎婊盥实汀l(fā)育異常,通常認(rèn)為是表觀修飾異常造成的。目前,克隆動物染色質(zhì)開放區(qū)域差異性分析還沒有任何相關(guān)研究,異常的表觀修飾如何調(diào)控和影響克隆動物染色質(zhì)狀態(tài)也并不清楚。為了理解體細(xì)胞克隆牛染色質(zhì)開放區(qū)域差異,我們選取外表健康存活的6頭克隆牛耳組織樣為研究對象,將其分成兩組,其中3頭(huiwa(HW),xingwa(XW),longwa(LW))克隆牛的供體核來源于胎兒成纖維細(xì)胞,另3頭克隆牛(S1231,S1232,S1253)的供體核來源輸卵管上皮細(xì)胞的體細(xì)胞,我們將這6種細(xì)胞的供體核進(jìn)行ATAC-seq和RNA-seq分析。在A...

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【學(xué)位級別】：碩士

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圖1-1DNA甲基化示意圖

體細(xì)胞克隆牛染色質(zhì)開放區(qū)域異常及其表觀遺傳學(xué)研究4者它對半甲基化DNA的偏好性較強(qiáng)，這從酶和生物化學(xué)性質(zhì)上也可以得到驗證。Dnmt1是首個被發(fā)現(xiàn)并成功獲得克隆表達(dá)的DNA甲基化轉(zhuǎn)移酶，它是一段有一千多個氨基酸組成。另外，還有一種酶Dnmt3L，該種酶是在體內(nèi)缺乏其他Dnmt酶時存....

圖1-2DNA去甲基化機(jī)制（LisaDM,etal,2013）

體細(xì)胞克隆牛染色質(zhì)開放區(qū)域異常及其表觀遺傳學(xué)研究6式[30]，它不管是在化學(xué)結(jié)構(gòu)和遺傳傳遞上都能保持相對的穩(wěn)定。在化學(xué)結(jié)構(gòu)中它能夠形成起到去甲基化屏障的碳-碳鍵，這里的碳-碳鍵就是由甲基和胞嘧啶堿基的5號位連接，它能夠起到保護(hù)甲基化的作用；在遺傳上因為Dnmt甲基轉(zhuǎn)移酶家族的存在....

圖1-3染色質(zhì)不同形態(tài)

9作用并抑制轉(zhuǎn)錄活性[32]。根據(jù)它們與酵母和亞細(xì)胞定位中的HDAC的同源性，十八種目前已知的HDAC被分為四類。I類（HDAC1-3和8），II（HDAC4-7,9和10）和IV（HDAC11）的酶活性需要鋅，而III類HDAC（sirtuins1-7）是尼古丁腺嘌呤二核苷酸（....

圖3-1支原體鑒定示意圖

273結(jié)果與分析3.1體細(xì)胞克隆牛細(xì)胞樣的ATAC-seq實驗將6株不同的體細(xì)胞克隆牛細(xì)胞從液氮罐中取出復(fù)蘇，然后鋪于適當(dāng)?shù)呐囵B(yǎng)平皿中培養(yǎng)。培養(yǎng)兩天后進(jìn)行細(xì)胞支原體污染鑒定（如3-1），確定無支原體污染。圖3-1支原體鑒定示意圖孔道1為huiwa；孔道2為longwa、孔道3為x....

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