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病毒宏基因組學研究進展

發(fā)布時間:2024-05-09 21:00
  病毒宏基因組學是一種新的病毒組學研究手段,隨著高通量測序技術的飛速發(fā)展,人們能夠從環(huán)境中快速發(fā)現(xiàn)、鑒定病毒基因組的組成并研究其特征。在過去的十年里,研究者們運用病毒宏基因組學發(fā)現(xiàn)了許多新型病毒,增強了人們對不同環(huán)境中病毒組成、分布和多樣性的了解。因此,病毒宏基因組學已成為清晰描繪各種特殊環(huán)境中病毒圖譜、了解自然界中病毒分布動態(tài)的有效工具。本文主要從病毒宏基因組的概念、樣品前處理和病毒總基因組提取方法、測序技術以及病毒宏基因組的應用和發(fā)展前景方面進行概述。

【文章頁數(shù)】:11 頁

【部分圖文】:

圖3鴨腸道真核病毒相關序列的分類學分布[35]

圖3鴨腸道真核病毒相關序列的分類學分布[35]

病毒宏基因組的出現(xiàn)為一些高傳染性和高致死性疾病提供了研究的可行性,利用與病毒宏基因組結合開發(fā)的新技術還可以對病毒進行實時監(jiān)測,為人類未來戰(zhàn)勝這些疾病奠定基礎。此外,腸道中病毒是最豐富、最為多樣的生物,其對腸道微生物菌群的調節(jié)起到關鍵作用。病毒宏基因組學方法也可以對這些腸道中的病毒....


圖1病毒宏基因組和其他微生物宏基因組樣品處理流程

圖1病毒宏基因組和其他微生物宏基因組樣品處理流程

環(huán)境中樣品DNA的質量直接關系到病毒宏基因組分析的結果[11]。在開展病毒宏基因組分析時樣品的選擇和處理非常重要,應該選擇病毒含量相對豐富且容易處理的樣品。對于含水樣品,可以選用切向流過濾(tangentialflowfiltration,TFF),例如古氏病毒科(一種古細菌....


圖2納帕海病毒在科水平注釋結果統(tǒng)計圖

圖2納帕海病毒在科水平注釋結果統(tǒng)計圖

海洋具有極為豐富的病毒資源,病毒宏基因組的出現(xiàn)為海洋病毒基因組的研究帶來了便捷,將人們對病毒的視野延伸到了以往無法探測的未知領域,對病毒的海洋生態(tài)作用有了更深入的了解。海洋表層中的病毒表現(xiàn)出豐富的多樣性,海水中病毒顆粒含量約為107cells/mL,這些病毒在其宿主的發(fā)育、進化....


圖1-1病毒宏基因組學研究主要技術路線示意圖

圖1-1病毒宏基因組學研究主要技術路線示意圖

中國農業(yè)科學院碩士學位論文第一章緒論5主要用于病毒檢測及新病毒的發(fā)現(xiàn)、病毒組的鑒定和病毒準種的構建等。1.3.2病毒組研究進展圖1-1病毒宏基因組學研究主要技術路線示意圖Fig.1-1Diagrammaticrepresentationofmainstepsofaviralmet....



本文編號:3968544

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