病毒宏基因組學(xué)是一種新的病毒組學(xué)研究手段,隨著高通量測(cè)序技術(shù)的飛速發(fā)展,人們能夠從環(huán)境中快速發(fā)現(xiàn)、鑒定病毒基因組的組成并研究其特征。在過(guò)去的十年里,研究者們運(yùn)用病毒宏基因組學(xué)發(fā)現(xiàn)了許多新型病毒,增強(qiáng)了人們對(duì)不同環(huán)境中病毒組成、分布和多樣性的了解。因此,病毒宏基因組學(xué)已成為清晰描繪各種特殊環(huán)境中病毒圖譜、了解自然界中病毒分布動(dòng)態(tài)的有效工具。本文主要從病毒宏基因組的概念、樣品前處理和病毒總基因組提取方法、測(cè)序技術(shù)以及病毒宏基因組的應(yīng)用和發(fā)展前景方面進(jìn)行概述。

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圖3鴨腸道真核病毒相關(guān)序列的分類(lèi)學(xué)分布[35]

病毒宏基因組的出現(xiàn)為一些高傳染性和高致死性疾病提供了研究的可行性，利用與病毒宏基因組結(jié)合開(kāi)發(fā)的新技術(shù)還可以對(duì)病毒進(jìn)行實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)，為人類(lèi)未來(lái)戰(zhàn)勝這些疾病奠定基礎(chǔ)。此外，腸道中病毒是最豐富、最為多樣的生物，其對(duì)腸道微生物菌群的調(diào)節(jié)起到關(guān)鍵作用。病毒宏基因組學(xué)方法也可以對(duì)這些腸道中的病毒....

圖1病毒宏基因組和其他微生物宏基因組樣品處理流程

環(huán)境中樣品DNA的質(zhì)量直接關(guān)系到病毒宏基因組分析的結(jié)果[11]。在開(kāi)展病毒宏基因組分析時(shí)樣品的選擇和處理非常重要，應(yīng)該選擇病毒含量相對(duì)豐富且容易處理的樣品。對(duì)于含水樣品，可以選用切向流過(guò)濾(tangentialflowfiltration,TFF)，例如古氏病毒科(一種古細(xì)菌....

圖2納帕海病毒在科水平注釋結(jié)果統(tǒng)計(jì)圖

海洋具有極為豐富的病毒資源，病毒宏基因組的出現(xiàn)為海洋病毒基因組的研究帶來(lái)了便捷，將人們對(duì)病毒的視野延伸到了以往無(wú)法探測(cè)的未知領(lǐng)域，對(duì)病毒的海洋生態(tài)作用有了更深入的了解。海洋表層中的病毒表現(xiàn)出豐富的多樣性，海水中病毒顆粒含量約為107cells/mL，這些病毒在其宿主的發(fā)育、進(jìn)化....

圖1-1病毒宏基因組學(xué)研究主要技術(shù)路線示意圖

中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文第一章緒論5主要用于病毒檢測(cè)及新病毒的發(fā)現(xiàn)、病毒組的鑒定和病毒準(zhǔn)種的構(gòu)建等。1.3.2病毒組研究進(jìn)展圖1-1病毒宏基因組學(xué)研究主要技術(shù)路線示意圖Fig.1-1Diagrammaticrepresentationofmainstepsofaviralmet....

本文編號(hào)：3968544