為了探究GhNAC201在棉花色素腺體發(fā)育中的作用,應(yīng)用RT-PCR的方法克隆了有腺體棉花中棉所12中GhNAC201基因的編碼區(qū)序列,并進(jìn)行生物信息學(xué)分析。利用熒光定量PCR對(duì)有腺體和無(wú)腺體棉花材料不同生育時(shí)期、不同組織部位和不同激素處理下GhNAC201基因的表達(dá)情況進(jìn)行分析。結(jié)果顯示,GhNAC201編碼區(qū)為948 bp,編碼315個(gè)氨基酸。GhNAC201蛋白分子量為36.8 ku,理論pI 5.97,二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)存在27.94%的α-螺旋、5.40%的β-轉(zhuǎn)角、18.10%的延伸鏈和48.57%的無(wú)規(guī)則卷曲。三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)表明,GhNAC201的26-190氨基酸與水稻脅迫應(yīng)答NAC1蛋白序列高度匹配,模型維度為X:55.229?,Y:36.150?,Z:46.112?。GhNAC201在30-163氨基酸處存在1個(gè)NAM結(jié)構(gòu)域,預(yù)測(cè)有5個(gè)蘇氨酸、6個(gè)絲氨酸和4個(gè)酪氨酸磷酸化位點(diǎn)位于NAM結(jié)構(gòu)域內(nèi)。亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)GhNAC201可能位于分泌通路或除線粒體、葉綠體之外的其他亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)。不同物種中GhNAC201同源蛋白序列的相似性較高,存在5個(gè)高度保守的基序。GhNAC201與亞...

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圖1GhNAC201編碼區(qū)的擴(kuò)增

利用RT-PCR技術(shù)克隆了中12中Gh-D06G2096的CDS序列(圖1),經(jīng)測(cè)序驗(yàn)證,與TM-1中參考序列(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)完全一致,參考Sun等[13]對(duì)陸地棉NAC基因的編號(hào),命名為GhNAC201(GenBank登錄號(hào):MN2....

圖2GhNAC201蛋白三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)

圖1GhNAC201編碼區(qū)的擴(kuò)增圖3GhNAC201磷酸化位點(diǎn)預(yù)測(cè)

圖3GhNAC201磷酸化位點(diǎn)預(yù)測(cè)

圖2GhNAC201蛋白三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)表2GhNAC201亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)Tab.2PredictionofsubcellularlocationofGhNAC201序列名稱Sequencename長(zhǎng)度Length葉綠體Chloroplast線粒體Mitoc....

圖4GhNAC201同源蛋白的進(jìn)化(A)及保守基序(B)分析

GhNAC201在有腺體棉各個(gè)組織的表達(dá)均極顯著高于無(wú)腺體棉,且有腺體棉的種子、苗期根、苗期莖、苗期葉和花后26d幼胚中GhNAC201豐度較高。2個(gè)無(wú)腺體棉材料中,GhNAC201僅在苗期根中表達(dá)量較高,在其他組織部位不表達(dá)或表達(dá)量很低(圖5-A)。在有腺體棉中12中,GhN....

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