綠色植物(Viridiplantae)是一類古老的光合真核生物,共有五十萬余種,分布廣泛,在全球生態(tài)系統(tǒng)中起著重要作用。綠色植物通過早期演化產(chǎn)生了兩大類群,一類是綠藻門,包括了多種生境、多種形態(tài)結(jié)構(gòu)的藻類,從海水、淡水到陸地,從浮游的單細胞、群體、多細胞到管狀等類群,另一類是鏈形植物門,包括有胚植物(現(xiàn)存的陸地植物:苔蘚以及維管植物)和輪藻門(雙星藻綱、鞘毛藻綱、輪藻綱、克里藻綱、綠疊球藻綱和中斑藻綱)。為了深入理解綠色植物的起源與演化歷史,構(gòu)建綠色植物可靠的時間軸是至關(guān)重要的。本文利用99種不同綠色植物的81個葉綠體蛋白編碼基因,結(jié)合21個化石標(biāo)定點,估算綠色植物以及各主要類群的起源與分化時間。我們進一步探究了拓撲結(jié)構(gòu)、分子鐘模型、分區(qū)模型、速率前驗參數(shù)以及化石標(biāo)定點對估算綠色植物分歧時間的影響。本研究發(fā)現(xiàn)改變速率前驗參數(shù)和拓撲結(jié)構(gòu)對估算分歧時間的影響較小。選擇不同的寬松分子鐘模型(獨立速率模型和自相關(guān)速率模型)僅影響古老節(jié)點分歧時間的估算。然而,使用不同的化石標(biāo)定點和分子鐘-分區(qū)模型時,對整個綠色植物各主要冠群節(jié)點的分歧時間影響較大。因此,本研究將影響分歧時間的不確定性因素進行整合...

【文章頁數(shù)】：76 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖1-1.被子植物的起源時間Figure1-1.Theorigintimeofangiosperm

體分化[15-28]（圖1-1），這意味著被子植物的化石記錄與分子鐘的估算時間存在著巨大的分歧。近年來，利用大量分子數(shù)據(jù)結(jié)合化石信息估算被子植物起源時間的研究尚未得到一致的結(jié)論。Morris等[28]使用852個核基因和37種不同的化石，估算被子植物起源于247-1....

圖1-2.陸地植物的起源時間Figure1-2.Theorigintimeoflandplants

3圖1-2.陸地植物的起源時間Figure1-2.Theorigintimeoflandplants

圖1-3.鏈形植物的起源時間Figure1-3.TheorigintimeofStreptophyta

近期關(guān)于鏈形植物分歧時間的研究也存在不一致的結(jié)論[28,38-40]（圖1-3），Sánchez-Baracaldo等[39]基于26個蛋白編碼基因和18種不同化石，使用三種分子鐘模型分別估算出鏈形植物起源于1180-660Ma、1140-860Ma、1120....

圖1-4.綠色植物的起源時間Figure1-4.Theorigintimeofgreenplants

分子鐘方法、不同分子數(shù)據(jù)集的研究也得到了不一致的綠色植物起源時間[28,29,38,44-47]（圖1-4）。Blank[38]等基于補償性似然速率修勻法以及貝葉斯算法，利用了三個數(shù)據(jù)集分別推算出綠色植物起源于1600-1570Ma、1740-1670Ma、1900-....

本文編號：3940942