枇杷脂類相關(guān)質(zhì)體蛋白基因PAP的克隆及表達(dá)分析
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【部分圖文】:
圖4PAP基因推導(dǎo)的氨基酸序列與其他植物PAP氨基酸序列的多重比對(duì)
類胡蘿卜素是枇杷的重要呈色色素(洪敏等,2018a)。植物類胡蘿卜素是一類在質(zhì)體(包括植物組織器官中的葉綠體其他有色體等)中合成、積累的脂溶性色素,植物細(xì)胞內(nèi)不同類型的質(zhì)體可以進(jìn)行對(duì)類胡蘿卜素分子的錨定、儲(chǔ)藏或留存,以此達(dá)到對(duì)類胡蘿卜素的累積的調(diào)控作用(Luetal.,200....
圖1RNA電泳和PAP擴(kuò)增電泳
以‘大五星’(紅肉)和“川農(nóng)1-5-9”(白肉)提取RNA后經(jīng)反轉(zhuǎn)錄得到單鏈cDNA,利用簡(jiǎn)并引物PCR擴(kuò)增后得到一條788bp的條帶(圖1),克隆后獲得PAP基因堿基序列(圖2),比對(duì)后發(fā)現(xiàn)兩個(gè)品種PAP基因的cDNA序列相似率達(dá)99.47%,與白梨(Pyrus×brets....
圖2‘大五星’和‘川農(nóng)1-5-9’枇杷PAP基因序列比對(duì)
將由ORFFinder尋找出的氨基酸序列進(jìn)行同源性檢索對(duì)比(圖4),發(fā)現(xiàn)枇杷PAP蛋白與薔薇科的白梨(XP_018504515.1)、蘋果(XP_008393974.1)、野櫻(PQQ05784.1)、桃(XP_007209976.2)的一致性分別為97%、95%、86%、85....
圖3PAP蛋白三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
圖2‘大五星’和‘川農(nóng)1-5-9’枇杷PAP基因序列比對(duì)進(jìn)化樹(shù)建立的結(jié)果表明(圖5),說(shuō)明枇杷PAP蛋白與白梨的進(jìn)化關(guān)系最近,與擬南芥的進(jìn)化關(guān)系最遠(yuǎn),同時(shí)蘋果與枇杷的進(jìn)化關(guān)系也比較近,這與枇杷其他基因進(jìn)化關(guān)系分析也幾近相同。
本文編號(hào):3925076
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