生物體依靠蛋白質(zhì)行使各式各樣的生物學(xué)功能,蛋白質(zhì)科學(xué)研究向來都是生物學(xué)研究的核心領(lǐng)域之一。傳統(tǒng)的蛋白質(zhì)科學(xué)研究遵循“序列-結(jié)構(gòu)-功能”的研究范式,即氨基酸序列決定其三維結(jié)構(gòu),三維結(jié)構(gòu)決定其生物學(xué)功能。然而,自上世紀(jì)90年代人們開始零星地發(fā)現(xiàn),某些蛋白質(zhì)不具備穩(wěn)定的三維結(jié)構(gòu),但依然能參與特定的生物學(xué)過程。隨著時(shí)間的推移,研究者發(fā)現(xiàn)了更多的此類蛋白,逐漸形成了一類與傳統(tǒng)蛋白質(zhì)不同的無序蛋白(Intrinsically Disordered Protein,IDP)。IDP在整體或者部分上包含無法形成穩(wěn)定三維結(jié)構(gòu)的氨基酸殘基片段,稱為無序區(qū)域(Intrinsically Disordered Region,IDR)。過去的二十年,IDR被報(bào)道在細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、蛋白質(zhì)磷酸化、染色質(zhì)結(jié)構(gòu)重塑、超級(jí)增強(qiáng)子(Super Enhancer,SE)等眾多生物學(xué)過程中發(fā)揮關(guān)鍵作用。更重要的是,近兩年的前沿研究表明,參與生物學(xué)過程的蛋白通過IDR形成液滴冷凝物而最終形成液液相分離現(xiàn)象,而液液相分離被報(bào)道與某些神經(jīng)退行性疾病的聯(lián)系極為密切。例如,FUS蛋白和hn RNPA1蛋白的IDR在肌萎縮側(cè)索硬化疾病中參與...

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【學(xué)位級(jí)別】：碩士

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圖1谷歌學(xué)術(shù)中近20年來發(fā)表的無序蛋白或無序區(qū)域論文數(shù)量Fig.1NumberofdisorderedproteinordisorderedregionpaperspublishedinGoogleScholar

0多種IDP。目前，常見研究IDP方面的數(shù)據(jù)庫除了DisProt系列之外，還有MobIDB3.0（Damianoetal2017）。前者主要注釋文獻(xiàn)中的蛋白質(zhì)的IDR，后者主要是在IDR、蛋白質(zhì)構(gòu)象多樣性和蛋白質(zhì)相互作用方面的注釋。越來越多IDP被收入到數(shù)據(jù)庫中以及數(shù)據(jù)庫對(duì)IDP....

圖2SUMO-1蛋白（Dunkeretal2008）

華中農(nóng)業(yè)大學(xué)2020屆碩士研究生學(xué)位（畢業(yè)）論文41.2.2部分無序區(qū)域擁有特異的二級(jí)結(jié)構(gòu)傳統(tǒng)蛋白質(zhì)被認(rèn)為擁有二級(jí)至四級(jí)的穩(wěn)定空間結(jié)構(gòu)。根據(jù)蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)，可以將蛋白質(zhì)分為四級(jí)，分別是一級(jí)結(jié)構(gòu)：組成多肽的氨基酸序列；二級(jí)結(jié)構(gòu)：多肽鏈中主鏈原子的局部空間排布不涉及側(cè)鏈部分的構(gòu)象，分為....

圖3BRD4與MED1在細(xì)胞內(nèi)聚集（Sabarietal2018）

基于混合序列復(fù)雜度方法的蛋白質(zhì)無序區(qū)域預(yù)測模型構(gòu)建7圖3BRD4與MED1在細(xì)胞內(nèi)聚集（Sabarietal2018）Fig.3BRD4andMED1formaggregationincells(Sabarietal2018)1.3.2無序區(qū)域中氨基酸殘基突變可能會(huì)打破液液相分離....

圖4氨基酸序列的混合復(fù)雜度Fig.4Hybridcomplexityoftheaminoacidsequenceω

華中農(nóng)業(yè)大學(xué)2020屆碩士研究生學(xué)位（畢業(yè)）論文

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