水稻(Oryza sativa L.)是最重要的糧食作物之一,全球有超過一半人口以稻米為主食。為了保證世界糧食安全,水稻生產(chǎn)者需要考慮各種可能導(dǎo)致水稻減產(chǎn)的逆境脅迫因素并找到應(yīng)對方法。然而水稻對于外界諸多脅迫的調(diào)控機理仍是未解之謎,這導(dǎo)致水稻生產(chǎn)者找到應(yīng)對水稻減產(chǎn)的方法變得極其困難。諸多研究表明v-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog(MYB)轉(zhuǎn)錄因子參與植物體內(nèi)的抗逆響應(yīng)過程。因此研究水稻MYB轉(zhuǎn)錄因子家族應(yīng)對外界脅迫的機理對于揭示水稻抗逆脅迫機制變得極其重要,為水稻生產(chǎn)者找到脅迫減產(chǎn)的應(yīng)對方法提供理論指導(dǎo),對水稻的安全生產(chǎn)具有重大意義。本研究首先從水稻基因組中鑒定出所有的MYB轉(zhuǎn)錄因子家族成員,并對其進行了染色體定位分析;然后以水稻品種日本晴(Nipponbare)為材料,以下載獲得的不同逆境脅迫下水稻日本晴的轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)為樣本,分析生物逆境和非生物逆境脅迫下水稻不同MYB轉(zhuǎn)錄因子家族成員的表達(dá)特性,篩選獲得分別應(yīng)對生物逆境、非生物逆境和同時響應(yīng)兩種類型逆境脅迫的MYB家族成員,并進行了試驗驗證。具體結(jié)果如下。1.首先通過...

【文章頁數(shù)】：73 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
1 前言
    1.1 植物應(yīng)對外界逆境脅迫的機制
        1.1.1 植物應(yīng)對生物逆境脅迫的機理
        1.1.2 植物應(yīng)對非生物逆境脅迫的機理
    1.2 轉(zhuǎn)錄因子
        1.2.1 植物MYB轉(zhuǎn)錄因子
        1.2.2 植物MYB轉(zhuǎn)錄因子的作用機理
    1.3 存在的問題
    1.4 本文主要研究內(nèi)容
2 材料與方法
    2.1 試驗材料
        2.1.1 數(shù)據(jù)收集
        2.1.2 在線軟件工具
        2.1.3 供試品種材料
        2.1.4 試劑與藥品
        2.1.5 主要儀器設(shè)備
    2.2 試驗方法
        2.2.1 水稻MYB轉(zhuǎn)錄因子的鑒定
        2.2.2 水稻MYB轉(zhuǎn)錄因子家族成員的染色體定位
        2.2.3 水稻MYB轉(zhuǎn)錄因子的保守基序分析
        2.2.4 逆境脅迫下水稻RNA-seq數(shù)據(jù)的處理與分析
        2.2.5 基因芯片數(shù)據(jù)的處理與分析
        2.2.6 供試水稻品種材料的逆境脅迫處理
        2.2.7 水稻葉片總RNA的提取
        2.2.8 實時熒光定量PCR
        2.2.9 基因Os06g0714600啟動子的順式元件分析
        2.2.10 啟動子功能驗證載體構(gòu)建與轉(zhuǎn)化
        2.2.11 啟動子p4342063功能驗證與GUS染色
        2.2.12 MYB轉(zhuǎn)錄因子Os11g0700500 的結(jié)合位點分析
3 結(jié)果與分析
    3.1 水稻MYB轉(zhuǎn)錄因子的鑒定
    3.2 水稻MYB轉(zhuǎn)錄因子家族的染色體定位
    3.3 水稻MYB轉(zhuǎn)錄因子的保守基序預(yù)測
    3.4 水稻MYB轉(zhuǎn)錄因子的作用特性分析
        3.4.1 生物逆境脅迫下水稻轉(zhuǎn)錄譜中MYB的表達(dá)分析
        3.4.2 非生物逆境脅迫下水稻RNA-seq轉(zhuǎn)錄譜中MYB的表達(dá)分析
        3.4.3 生物與非生物逆境脅迫下水稻RNA-seq轉(zhuǎn)錄譜中MYB的表達(dá)分析
    3.5 水稻MYB轉(zhuǎn)錄因子的共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)與相關(guān)性分析
        3.5.1 共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)(WGCNA)分析結(jié)果
        3.5.2 相關(guān)性分析結(jié)果
        3.5.3 KEGG-pathway分析結(jié)果
    3.6 Os10g0478300和Os11g0700500 基因功能的試驗驗證
        3.6.1 水稻葉片總RNA提取結(jié)果分析
        3.6.2 逆境脅迫下兩個MYB基因的表達(dá)分析
    3.7 逆境脅迫下水稻Os11g0700500基因下調(diào)表達(dá)的調(diào)控機理
        3.7.1 基因Os06g0714600的啟動子順式元件分析
        3.7.2 基因Os06g0714600的啟動子功能分析
        3.7.3 MYB轉(zhuǎn)錄因子Os11g0700500 的結(jié)合序列分析
        3.7.4 MYB轉(zhuǎn)錄因子Os11g0700500 結(jié)合Os06g0714600 的啟動子序列分析
4 討論
    4.1 水稻MYB轉(zhuǎn)錄因子家族成員的鑒定與分析
    4.2 逆境脅迫下水稻MYB家族成員的表達(dá)特性
    4.3 逆境脅迫水稻MYB基因Os11g0700500 的作用機制
5 展望
    5.1 MYB轉(zhuǎn)錄因子家族成員響應(yīng)不同脅迫類型的異同分析
    5.2 MYB轉(zhuǎn)錄因子家族成員Os11g0700500對Os06g0714600 基因的調(diào)控驗證
    5.3 水稻抗逆機理的深入研究
參考文獻
附錄A 鑒定的151個Osmybs
附錄B WGCNA腳本
附錄C 相關(guān)性分析腳本
附錄D KEGG-pathway腳本
附錄E 本文中的引物序列
致謝



本文編號：3888061