環(huán)狀核糖核酸(circular ribonucleic acid,circular RNA或circRNA)是一類無5’帽子結(jié)構(gòu)及3’poly A尾,以共價鍵連接形成閉合環(huán)形結(jié)構(gòu)的非編碼RNA分子,通過轉(zhuǎn)錄后調(diào)控的方式參與動植物細(xì)胞的眾多代謝途徑.萊茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii,C. reinhardtii)是一種重要的真核單細(xì)胞模式微藻,為探究其是否存在環(huán)狀RNA,本研究通過RNA-Seq高通量測序分析正常與缺硫培養(yǎng)的C. reinhardtii RNA組學(xué)數(shù)據(jù),首次預(yù)測獲得218條環(huán)狀RNA序列,通過對比缺硫處理前后萊茵衣藻環(huán)狀RNA序列,獲得8條差異表達(dá)的環(huán)狀RNA序列(其中,5條為表達(dá)上調(diào)、3條為表達(dá)下調(diào)).本研究首次對單細(xì)胞真核微藻萊茵衣藻進(jìn)行環(huán)狀RNA的生物信息學(xué)預(yù)測,確認(rèn)萊茵衣藻環(huán)狀RNA響應(yīng)缺硫脅迫,為下一步揭示萊茵衣藻環(huán)狀RNA參與響應(yīng)萊茵衣藻缺硫的作用機(jī)制奠定基礎(chǔ).

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圖1缺硫前后萊茵衣藻中環(huán)狀RNA表達(dá)量密度分布

圖2萊茵衣藻缺硫前后環(huán)狀RNA的表達(dá)差異

本文編號：3884558