微生物廣泛分布于我們生活的環(huán)境甚至是極端環(huán)境中,季節(jié)性變化形成的復(fù)雜自然條件會直接影響微生物群落的結(jié)構(gòu)和功能特征。以黑龍江省漠河縣北極村和黑龍江源頭地洛古河村的地表水和淤泥為研究對象,利用宏基因組測序的分子生物學(xué)技術(shù),通過多元統(tǒng)計分析,得到如下結(jié)果:兩種環(huán)境下微生物的群落結(jié)構(gòu)中,淤泥和水體環(huán)境中的微生物群落一共獲得103門186綱347目645科2075屬,且主要類群絕大多數(shù)隸屬于細菌界,在門的水平上,總體來說隸屬于變形菌門Proteobacteria和擬桿菌門Bacteroidetes等的微生物為主要類群,在綱的水平上,α-變形桿菌綱Alphaproteobacteria、β-變形菌綱 Betaproteobacteria等為主要類群,在目的水平上,伯克氏菌目Burkholderiales等為主要類群,在科的水平中,柄桿菌科Caulobacteraceae,叢毛單胞菌科Comamonadaceae,黃桿菌科Flavobacteriaceae,間孢囊菌科Intrasporangiaceae等為各個樣本不同季節(jié)中較為豐富的主要類群,在屬的水平上,短波單胞菌屬Brevundimonas,柄...

【文章頁數(shù)】：59 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
1 緒論
    1.1 微生物多樣性
    1.2 環(huán)境微生物的國內(nèi)外相關(guān)研究進展
        1.2.1 極端環(huán)境微生物
        1.2.2 水生微生物和淤泥微生物
        1.2.3 季節(jié)變化對環(huán)境微生物的影響
    1.3 微生物傳統(tǒng)培養(yǎng)法的不足
    1.4 宏基因組的國內(nèi)外相關(guān)研究進展
    1.5 研究的目的與意義
    1.6 研究內(nèi)容與技術(shù)路線
        1.6.1 研究內(nèi)容
        1.6.2 技術(shù)路線
2 宏基因組測序及數(shù)據(jù)預(yù)處理
    2.1 試驗材料
        2.1.1 樣本微生物
        2.1.2 主要試劑與儀器
    2.2 研究方法
        2.2.1 樣品采集及處理
        2.2.2 DNA文庫構(gòu)建及質(zhì)量控制
        2.2.3 宏基因組測序的數(shù)據(jù)處理分析
    2.3 結(jié)果與分析
        2.3.1 數(shù)據(jù)評估及質(zhì)控的結(jié)果及分析
        2.3.2 序列拼接組裝的結(jié)果及分析
    2.4 本章小結(jié)
3 宏基因組分析微生物物種多樣性
    3.1 試驗材料
        3.1.1 樣本微生物
        3.1.2 主要試劑與儀器
    3.2 研究方法
        3.2.1 基因預(yù)測與基因豐度
        3.2.2 環(huán)境樣本α-多樣性
        3.2.3 環(huán)境樣本β-多樣性
    3.3 結(jié)果與分析
        3.3.1 基因預(yù)測與基因豐度的結(jié)果分析
        3.3.2 環(huán)境樣本α-多樣性的結(jié)果分析
        3.3.3 環(huán)境樣本β-多樣性的結(jié)果分析
    3.4 本章小結(jié)
4 宏基因組分析微生物群落結(jié)構(gòu)對季節(jié)性變化的響應(yīng)
    4.1 試驗材料
        4.1.1 樣本微生物
        4.1.2 主要試劑與儀器
    4.2 研究方法
    4.3 結(jié)果與分析
        4.3.1 界水平上的樣本微生物群落多樣性分析
        4.3.2 門水平上的樣本微生物群落多樣性分析
        4.3.3 綱水平上的樣本微生物群落多樣性分析
        4.3.4 目水平上的樣本微生物群落多樣性分析
        4.3.5 科水平上的樣本微生物群落多樣性分析
        4.3.6 屬水平上的樣本微生物群落多樣性分析
        4.3.7 小結(jié)
    4.4 本章小結(jié)
5 宏基因組分析微生物群落功能對季節(jié)性變化的響應(yīng)
    5.1 試驗材料
        5.1.1 樣本微生物
        5.1.2 主要試劑與儀器
    5.2 研究方法
    5.3 結(jié)果與分析
        5.3.1 COG功能注釋結(jié)果及分析
        5.3.2 KEGG功能注釋結(jié)果及分析
        5.3.3 CAZy功能注釋結(jié)果及分析
    5.4 本章小結(jié)
結(jié)論
參考文獻
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
致謝



本文編號：3834775