中國西南喀斯特地域淡水蟹類的物種多樣性及分子系統(tǒng)地理學研究
發(fā)布時間:2023-05-07 02:24
目的:1.基于16S rRNA基因建立分布于中國西南喀斯特地域淡水蟹物種的系統(tǒng)發(fā)生樹,探討與確立中國淡水蟹類地理區(qū)劃分區(qū)單元與西南喀斯特地貌的關系。2.基于作者采集和南昌大學基礎醫(yī)學院淡水十足目甲殼動物與并殖吸蟲研究室標本庫所保藏的西南八省區(qū)的31屬129物種合計640個淡水蟹類個體,由此構建西南喀斯特地域淡水蟹類地理信息系統(tǒng)(GIS),旨在尋找喀斯特地貌與淡水蟹類物種的分布方式及物種多樣性間可能存在的內在規(guī)律。3.測定中國西南喀斯特地貌溪蟹科下7屬7種淡水蟹線粒體基因組,并進行系統(tǒng)發(fā)生分析以及比較線粒體基因組學研究,嘗試厘清中國西南喀斯特地貌淡水蟹類的分子系統(tǒng)發(fā)育關系,推演該地域淡水蟹類屬、種可能的分化年代。方法:1.基于對西南喀斯特地域淡水蟹類形態(tài)分類及其分子親緣的初步研究,樣點的選擇以淡水蟹類“種”為基準,依據喀斯特地貌特征來確定標本的具體采集地點,作者與研究團隊按照課題計劃前往擬定的地點進行標本采集,并統(tǒng)計研究室標本庫歷年已在西南喀斯特地域采集保存的淡水蟹類標本一同用于本項目研究。對所選取的標本在與模式標本比對的基礎上進行形態(tài)學鑒定,記錄標本采集樣點的經緯度等,并對其是否處于喀...
【文章頁數】:123 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第一章 引言
1.1 中國西南喀斯特地域特征概況
1.1.1 西南喀斯特的分布及特征
1.1.2 生物喀斯特
1.1.3 西南喀斯特的生物多樣性
1.2 中國西南喀斯特地域淡水蟹類的物種多樣性
1.3 中國大陸淡水蟹類的研究進展
1.3.1 形態(tài)學方面的分類研究
1.3.2 分子水平的分類研究
1.3.3 短尾類系統(tǒng)發(fā)生分析概況
1.3.4 線粒體基因組在短尾類中的研究概況
1.4 地理信息系統(tǒng)(GIS)研究概況
第二章 中國西南喀斯特淡水蟹類的分布格局的探討及地理信息系統(tǒng)(GIS)的構建與初步應用
2.1 實驗材料
2.1.1 樣本采集與保存
2.1.2 形態(tài)學分類與鑒定
2.1.3 主要實驗儀器和設備
2.2 實驗方法
2.2.1 DNA的提取
2.2.2 PCR擴增
2.2.3 數據選擇與分析
2.2.4 系統(tǒng)發(fā)生分析
2.2.5 地理信息系統(tǒng)分析
2.3 實驗結果
2.3.1 形態(tài)學分類鑒定
2.3.2 系統(tǒng)發(fā)生分析
2.3.3 基于地理信息系統(tǒng)分析淡水蟹類的分布格局
2.4 討論
第三章 中國西南喀斯特地域7屬7種淡水蟹線粒體全基因組分析
3.1 實驗材料
3.2 實驗方法
3.2.1 測序、組裝和注釋線粒體基因組
3.2.2 系統(tǒng)發(fā)生分析
3.2.3 分歧時間估算
3.3 實驗結果
3.3.1 凱里龍溪蟹Longpotamon kenliense
3.3.2 茂蘭中國溪蟹Chinapotamon maolanense
3.3.3 相似非擬溪蟹Aparapotamon similium
3.3.4 鏡頭華石蟹Sinolapotamon patellifer
3.3.5 興安內陸溪蟹Neilupotamon xinganense
3.3.6 靈川博特溪蟹Bottapotamon lingchuanense
3.3.7 寬腹小石蟹安順亞種Tenuilapotamon latilum anshunense
3.3.8 線粒體基因組組成及分析
3.3.9 基因重排分析
3.3.10 系統(tǒng)發(fā)生的分析
3.3.11 分歧時間估算
3.4 討論
第四章 結論
致謝
參考文獻
攻讀學位期間的研究成果
綜述
參考文獻
本文編號:3810058
【文章頁數】:123 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第一章 引言
1.1 中國西南喀斯特地域特征概況
1.1.1 西南喀斯特的分布及特征
1.1.2 生物喀斯特
1.1.3 西南喀斯特的生物多樣性
1.2 中國西南喀斯特地域淡水蟹類的物種多樣性
1.3 中國大陸淡水蟹類的研究進展
1.3.1 形態(tài)學方面的分類研究
1.3.2 分子水平的分類研究
1.3.3 短尾類系統(tǒng)發(fā)生分析概況
1.3.4 線粒體基因組在短尾類中的研究概況
1.4 地理信息系統(tǒng)(GIS)研究概況
第二章 中國西南喀斯特淡水蟹類的分布格局的探討及地理信息系統(tǒng)(GIS)的構建與初步應用
2.1 實驗材料
2.1.1 樣本采集與保存
2.1.2 形態(tài)學分類與鑒定
2.1.3 主要實驗儀器和設備
2.2 實驗方法
2.2.1 DNA的提取
2.2.2 PCR擴增
2.2.3 數據選擇與分析
2.2.4 系統(tǒng)發(fā)生分析
2.2.5 地理信息系統(tǒng)分析
2.3 實驗結果
2.3.1 形態(tài)學分類鑒定
2.3.2 系統(tǒng)發(fā)生分析
2.3.3 基于地理信息系統(tǒng)分析淡水蟹類的分布格局
2.4 討論
第三章 中國西南喀斯特地域7屬7種淡水蟹線粒體全基因組分析
3.1 實驗材料
3.2 實驗方法
3.2.1 測序、組裝和注釋線粒體基因組
3.2.2 系統(tǒng)發(fā)生分析
3.2.3 分歧時間估算
3.3 實驗結果
3.3.1 凱里龍溪蟹Longpotamon kenliense
3.3.2 茂蘭中國溪蟹Chinapotamon maolanense
3.3.3 相似非擬溪蟹Aparapotamon similium
3.3.4 鏡頭華石蟹Sinolapotamon patellifer
3.3.5 興安內陸溪蟹Neilupotamon xinganense
3.3.6 靈川博特溪蟹Bottapotamon lingchuanense
3.3.7 寬腹小石蟹安順亞種Tenuilapotamon latilum anshunense
3.3.8 線粒體基因組組成及分析
3.3.9 基因重排分析
3.3.10 系統(tǒng)發(fā)生的分析
3.3.11 分歧時間估算
3.4 討論
第四章 結論
致謝
參考文獻
攻讀學位期間的研究成果
綜述
參考文獻
本文編號:3810058
本文鏈接:http://sikaile.net/projectlw/swxlw/3810058.html
教材專著