利用數(shù)據(jù)庫中已有的部分菰(Zizania latifolia Turcz.)核基因組序列,采用in silico方法開發(fā)其SSR引物,并選取我國不同緯度的5個菰野生種群,對合成的64對引物進(jìn)行篩選。結(jié)果顯示:64對引物中有15對至少在一個種群中表現(xiàn)出多態(tài)性;共發(fā)現(xiàn)84個等位基因,每個位點平均有5.6個等位基因。在5個種群中,觀察雜合度為0.000～0.941,預(yù)期雜合度為0.072～0.625。種群間的基因流(N_m=0. 576)水平較低導(dǎo)致了種群間表現(xiàn)出較高的遺傳分化(F_ST=0. 432)。進(jìn)一步對稻族其他物種的通用性檢測發(fā)現(xiàn),15個多態(tài)位點中,有8個位點在亞洲栽培稻(Oryza sativa L.)中得到擴(kuò)增,有9個位點在普通野生稻(O. rufipogon Griff.)中得到擴(kuò)增。

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【文章目錄】：
1 Materials and Methods
    1.1 SSR identification and primer design
    1.2 SSR validation and cross-transferability test
    1.3 Data analysis
2 Results
3 Discussion



本文編號：3803226