茶樹類防御素CsDEF2基因的克隆與序列及表達(dá)分析
發(fā)布時間:2023-04-18 23:25
防御素(Defensin)是一類廣泛存在動植物中的陽離子短肽,具有多種防御功能。本研究利用轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫,從茶樹葉片中克隆了一個類防御素基因CsDEF2并對該基因進(jìn)行了生物信息學(xué)分析,CsDEF2的開放閱讀框(ORF)全長246 bp,編碼81個氨基酸,蛋白分子量8.68 k D,等電點(diǎn)9.12。序列比對和系統(tǒng)發(fā)育分析表明,CsDEF2是防御素家族中的新成員。此外,本研究對病原真菌(茶樹鐮刀菌)侵染后的茶樹葉片中該基因的表達(dá)水平進(jìn)行半定量分析。結(jié)果表明,茶樹鐮刀菌侵染的葉片Cs DEF2基因的表達(dá)量相較未侵染葉片明顯上調(diào),說明CsDEF2基因可能在防御真菌侵染發(fā)揮作用。以上研究結(jié)果為提高茶樹及其它作物的生物抗性提供了新的靶基因,同時也為探討茶樹生物抗性奠定了基礎(chǔ),具有重要的理論與應(yīng)用價值。
【文章頁數(shù)】:9 頁
【文章目錄】:
1 結(jié)果與分析
1.1 茶樹Cs DEF2基因克隆與序列分析
1.2 茶樹Cs DEF2生物信息學(xué)分析
1.2.1 Cs DEF2基因蛋白序列同源分析
1.2.2 蛋白理化性質(zhì)預(yù)測分析
1.2.3 Cs DEF2氨基酸親/疏水性分析
1.2.4 Cs DEF2蛋白信號肽預(yù)測與亞細(xì)胞定位
1.2.5 Cs DEF2蛋白的跨膜區(qū)結(jié)構(gòu)預(yù)測
1.2.6 Cs DEF2磷酸化位點(diǎn)預(yù)測與分析
1.2.7 茶樹Cs DEF2蛋白的保守結(jié)構(gòu)域分析
1.2.8 Cs DEF2蛋白二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)的預(yù)測與分析
1.3 病菌侵染后茶樹Cs DEF2基因半定量表達(dá)分析
2 討論
3 材料與方法
3.1 植物材料與試劑
3.2 茶葉總RNA提取與c DNA第一鏈的合成
3.3 茶樹Cs DEF2基因的克隆
3.4 茶樹Cs DEF2生物信息學(xué)分析
3.5 病原菌的分離培養(yǎng)及菌液制備
3.6 茶樹葉片病原菌的侵染
3.7 茶樹Cs DEF2基因的RT-PCR
作者貢獻(xiàn)
本文編號:3793244
【文章頁數(shù)】:9 頁
【文章目錄】:
1 結(jié)果與分析
1.1 茶樹Cs DEF2基因克隆與序列分析
1.2 茶樹Cs DEF2生物信息學(xué)分析
1.2.1 Cs DEF2基因蛋白序列同源分析
1.2.2 蛋白理化性質(zhì)預(yù)測分析
1.2.3 Cs DEF2氨基酸親/疏水性分析
1.2.4 Cs DEF2蛋白信號肽預(yù)測與亞細(xì)胞定位
1.2.5 Cs DEF2蛋白的跨膜區(qū)結(jié)構(gòu)預(yù)測
1.2.6 Cs DEF2磷酸化位點(diǎn)預(yù)測與分析
1.2.7 茶樹Cs DEF2蛋白的保守結(jié)構(gòu)域分析
1.2.8 Cs DEF2蛋白二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)的預(yù)測與分析
1.3 病菌侵染后茶樹Cs DEF2基因半定量表達(dá)分析
2 討論
3 材料與方法
3.1 植物材料與試劑
3.2 茶葉總RNA提取與c DNA第一鏈的合成
3.3 茶樹Cs DEF2基因的克隆
3.4 茶樹Cs DEF2生物信息學(xué)分析
3.5 病原菌的分離培養(yǎng)及菌液制備
3.6 茶樹葉片病原菌的侵染
3.7 茶樹Cs DEF2基因的RT-PCR
作者貢獻(xiàn)
本文編號:3793244
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