天然產(chǎn)物是指天然來源(包括動(dòng)物、植物和微生物等)的次生代謝產(chǎn)物,具有廣泛的生物活性。由于其結(jié)構(gòu)多樣性和獨(dú)特性,天然產(chǎn)物在藥物研發(fā)中一直扮演著重要的角色,有53%的化學(xué)藥品屬于天然產(chǎn)物及其衍生物。對(duì)天然產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)多樣性、化學(xué)空間進(jìn)行分析可以加深人類對(duì)天然產(chǎn)物與生物進(jìn)化、環(huán)境壓力關(guān)系的認(rèn)識(shí),促進(jìn)基于天然產(chǎn)物的藥物研發(fā)。為了研究不同生物來源的天然產(chǎn)物之間的結(jié)構(gòu)、性質(zhì)差異,本論文對(duì)動(dòng)物、植物和微生物來源的天然產(chǎn)物進(jìn)行了基于化學(xué)信息學(xué)的對(duì)比分析。首先,我們整理了天然產(chǎn)物詞典(Dictionary of Natural Products,DNP)中的結(jié)構(gòu)、生物來源以及化合物類型等信息。DNP注釋了186679個(gè)天然產(chǎn)物的來源信息,其中68.36%的天然產(chǎn)物來自于植物,19.39%來自于微生物,12.24%來自于動(dòng)物。DNP中有化合物類型信息的天然產(chǎn)物有201881個(gè),其中數(shù)量最多的化合物類型是萜類(33.80%)和生物堿(16.43%)�；赟ugar Buster算法,我們?cè)O(shè)計(jì)了糖基識(shí)別與去除流程,對(duì)天然產(chǎn)物進(jìn)行了去糖基化處理。結(jié)果表明,16.77%的天然產(chǎn)物含有糖或者類糖片段。其中,植物、微生...

【文章頁數(shù)】：64 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
縮略語表
1 前言
    1.1 天然產(chǎn)物
    1.2 天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫
    1.3 天然產(chǎn)物的化學(xué)信息學(xué)研究進(jìn)展
    1.4 化學(xué)信息學(xué)
        1.4.1 分子片段和骨架
        1.4.2 化學(xué)空間
    1.5 研究目的和意義
2 材料和方法
    2.1 技術(shù)路線
    2.2 天然產(chǎn)物結(jié)構(gòu)的提取
    2.3 天然產(chǎn)物的物種來源分類
    2.4 天然產(chǎn)物的化合物類型分類
    2.5 天然產(chǎn)物去糖基化
    2.6 天然產(chǎn)物物理化學(xué)性質(zhì)的計(jì)算
    2.7 分子片段分析
    2.8 化學(xué)空間展示
        2.8.1 SAR Map的生成
        2.8.2 Tree Map的生成
3 結(jié)果與分析
    3.1 天然產(chǎn)物化學(xué)結(jié)構(gòu)的提取與標(biāo)準(zhǔn)化
    3.2 天然產(chǎn)物分類
        3.2.1 天然產(chǎn)物物種分類
        3.2.2 天然產(chǎn)物化合物類型分類
    3.3 天然產(chǎn)物糖基化差異
        3.3.1 含糖分子在不同物種來源天然產(chǎn)物中的分布
        3.3.2 含糖分子在不同化合物類型的天然產(chǎn)物中的分布
        3.3.3 天然產(chǎn)物糖基數(shù)量的變化
    3.4 天然產(chǎn)物生物來源與結(jié)構(gòu)類型的關(guān)系
    3.5 不同生物來源天然產(chǎn)物物理化學(xué)性質(zhì)的差異
    3.6 不同生物來源天然產(chǎn)物的分子片段
        3.6.1 環(huán)簇分析
        3.6.2 RECAP片段分析
        3.6.3 Murcko骨架分析
    3.7 不同生物來源天然產(chǎn)物的化學(xué)空間
        3.7.1 SAR Map
        3.7.2 Tree Map
4 總結(jié)與展望
    4.1 總結(jié)
    4.2 展望
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝



本文編號(hào)：3790012