從變形假單胞菌JUIM01中克隆到吡咯喹啉醌(PQQ)合成基因簇,闡明了其基因組成和生物學(xué)信息。根據(jù)已報(bào)道的假單胞菌的基因組進(jìn)行簡(jiǎn)并引物設(shè)計(jì),采用LA-PCR技術(shù)克隆變形假單胞菌的PQQ合成基因簇,對(duì)克隆的基因片段進(jìn)行測(cè)序并使用生物信息學(xué)方法進(jìn)行綜合分析。結(jié)果表明:克隆到的基因片段全長(zhǎng)為11 659 bp,其中包括pqqF、pqqA、pqqB、pqqC、pqqD、pqqE、pqqM、pqqH和pqqI共9個(gè)基因,編碼PQQ生物合成的前體短肽PqqA和合成途徑的相關(guān)酶;這些基因與熒光假單胞菌Pf0-1的PQQ合成基因簇的基因組成類(lèi)似,相應(yīng)基因的序列一致性達(dá)41%～94%。本研究中首次從變形假單胞菌中克隆到PQQ合成基因簇,并對(duì)其進(jìn)行生物信息學(xué)分析,為變形假單胞菌的PQQ生物合成途徑和胞內(nèi)再生機(jī)制的研究奠定了基礎(chǔ),進(jìn)而為提高2KGA的生產(chǎn)強(qiáng)度提供了理論支撐。

【文章頁(yè)數(shù)】：8 頁(yè)

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        1.1.1 菌株和質(zhì)粒
        1.1.2 培養(yǎng)基
        1.1.3 主要工具酶和試劑
    1.2 實(shí)驗(yàn)方法
        1.2.1 基因組DNA的提取
        1.2.2 PCR引物的設(shè)計(jì)與合成
        1.2.3目的基因片段的擴(kuò)增
        1.2.4 生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 PQQ合成基因簇的克隆與重組質(zhì)粒的構(gòu)建
    2.2 PQQ合成基因簇的基因組成
    2.3 PQQ合成基因簇的非編碼序列分析
    2.4 PQQ合成基因簇中各基因的生物信息學(xué)分析
3 結(jié)語(yǔ)



本文編號(hào)：3765280