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基于形態(tài)與分子數(shù)據(jù)的中國行軍蟻亞科分類及系統(tǒng)發(fā)育研究

發(fā)布時(shí)間:2023-03-18 17:16
  本研究基于形態(tài)測量學(xué)與分子系統(tǒng)學(xué)對中國行軍蟻亞科Dorylinae的分類和系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系進(jìn)行探討,通過對行軍蟻亞科6屬25種183號標(biāo)本選取14種性狀特征進(jìn)行測量,并將獲得的矩陣保存CSV格式,使用R軟件運(yùn)用形態(tài)測量學(xué)(人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和高斯混合聚類模型)的兩種方法進(jìn)行物種鑒定分析;采用PCR擴(kuò)增并測定8屬28種175號標(biāo)本COI基因的DNA條形碼基因片段,使用DNAtar、CLUSTALX 4.14、MEGA 7、BioEdit等軟件對所得序列進(jìn)行比對、剪切、拼接、堿基組成、堿基替換分析,運(yùn)用鄰接法(NJ)、最大似然法(ML)、貝葉斯推論法(BI)分別構(gòu)建行軍蟻亞科8屬28種系統(tǒng)發(fā)育樹。結(jié)合形態(tài)測量學(xué)與分子系統(tǒng)學(xué)分析,主要結(jié)果如下:(1)基于形態(tài)測量學(xué)對行軍蟻亞科6屬25種進(jìn)行物種鑒定,結(jié)果表明:人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分析的鑒定成功率為79.8%,種內(nèi)所有個(gè)體完全成功鑒定正確有2個(gè)種;高斯混合模型分析的鑒定成功率為88.5%,種內(nèi)完全成功鑒定有8個(gè)種,高斯混合模型更適合于中國行軍蟻亞科物種鑒定。(2)基于COI條形碼序列對行軍蟻亞科8屬28種構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,結(jié)果顯示:行軍蟻亞科中盲蟻屬Aenictu...

【文章頁數(shù)】:77 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
Abstract
第1章 前言
    1.1 中國蟻科分類簡介
    1.2 形態(tài)測量學(xué)研究
        1.2.1 形態(tài)測量學(xué)國內(nèi)外研究進(jìn)展
    1.3 分子系統(tǒng)學(xué)研究
        1.3.1 分子系統(tǒng)學(xué)在蟻科昆蟲的應(yīng)用
        1.3.2 分子系統(tǒng)學(xué)在行軍蟻亞科中的應(yīng)用
    1.4 立項(xiàng)依據(jù)
    1.5 研究目的
第2章 實(shí)驗(yàn)材料與方法
    2.1 形態(tài)測量學(xué)研究
        2.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        2.1.2 螞蟻標(biāo)本制作
        2.1.3 實(shí)驗(yàn)所需儀器
        2.1.4 圖片獲取與數(shù)據(jù)整理
        2.1.5 數(shù)據(jù)分析方法
            2.1.5.1 人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分析
            2.1.5.2 高斯混合模型
    2.2 分子系統(tǒng)學(xué)研究
        2.2.1 實(shí)驗(yàn)材料
        2.2.2 實(shí)驗(yàn)儀器
        2.2.3 實(shí)驗(yàn)試劑
        2.2.4 實(shí)驗(yàn)方法
            2.2.4.1 螞蟻DNA的提取
            2.2.4.2 樣品DNA檢測
            2.2.4.3 目的基因片段的PCR擴(kuò)增
            2.2.4.4 目的PCR產(chǎn)物的檢測
        2.2.5 數(shù)據(jù)處理方法
            2.2.5.1 序列比對、剪切和拼接
            2.2.5.2 雙節(jié)行軍蟻亞科COI基因條形碼的系統(tǒng)發(fā)育信號檢測
            2.1.5.3 構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹
第3章 行軍蟻亞科的形態(tài)測量學(xué)與分子系統(tǒng)學(xué)分析
    3.1 形態(tài)測量學(xué)分析
        3.1.1 人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分析
        3.1.2 高斯混合模型結(jié)果與分析
    3.2 雙節(jié)行軍蟻亞科的分子系統(tǒng)學(xué)研究
        3.2.1 COI序列特征
        3.2.2 COI基因部分片段的堿基替換分析
        3.2.3 系統(tǒng)發(fā)育信號檢測
        3.2.4 系統(tǒng)發(fā)育分析
        3.2.5 構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹
            3.2.5.1 鄰接法構(gòu)建NJ樹
            3.2.5.2 最大似然法構(gòu)建ML樹
            3.2.5.3 貝葉斯推論法構(gòu)建BI樹
第4章 討論
    4.1 行軍蟻亞科部分屬的形態(tài)測量分析
    4.2 行軍蟻亞科部分屬的系統(tǒng)發(fā)育分析
第5章 新種描述
    5.1 崇左盲蟻Aenictus chongzuoensis sp.nov
    5.2 雙色旁影蟻Parasyscia bicolor sp.nov
    5.3 云川旁影蟻Parasyscia yunchuani sp.nov
    5.4 八節(jié)卵角蟻Ooceraea octoantenma sp.nov
第6章 總結(jié)
參考文獻(xiàn)
附錄
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的論文情況
致謝



本文編號:3763541

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