基于形態(tài)與分子數(shù)據(jù)的中國行軍蟻亞科分類及系統(tǒng)發(fā)育研究
發(fā)布時間:2023-03-18 17:16
本研究基于形態(tài)測量學與分子系統(tǒng)學對中國行軍蟻亞科Dorylinae的分類和系統(tǒng)發(fā)育關系進行探討,通過對行軍蟻亞科6屬25種183號標本選取14種性狀特征進行測量,并將獲得的矩陣保存CSV格式,使用R軟件運用形態(tài)測量學(人工神經(jīng)網(wǎng)絡和高斯混合聚類模型)的兩種方法進行物種鑒定分析;采用PCR擴增并測定8屬28種175號標本COI基因的DNA條形碼基因片段,使用DNAtar、CLUSTALX 4.14、MEGA 7、BioEdit等軟件對所得序列進行比對、剪切、拼接、堿基組成、堿基替換分析,運用鄰接法(NJ)、最大似然法(ML)、貝葉斯推論法(BI)分別構建行軍蟻亞科8屬28種系統(tǒng)發(fā)育樹。結合形態(tài)測量學與分子系統(tǒng)學分析,主要結果如下:(1)基于形態(tài)測量學對行軍蟻亞科6屬25種進行物種鑒定,結果表明:人工神經(jīng)網(wǎng)絡分析的鑒定成功率為79.8%,種內(nèi)所有個體完全成功鑒定正確有2個種;高斯混合模型分析的鑒定成功率為88.5%,種內(nèi)完全成功鑒定有8個種,高斯混合模型更適合于中國行軍蟻亞科物種鑒定。(2)基于COI條形碼序列對行軍蟻亞科8屬28種構建系統(tǒng)發(fā)育樹,結果顯示:行軍蟻亞科中盲蟻屬Aenictu...
【文章頁數(shù)】:77 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第1章 前言
1.1 中國蟻科分類簡介
1.2 形態(tài)測量學研究
1.2.1 形態(tài)測量學國內(nèi)外研究進展
1.3 分子系統(tǒng)學研究
1.3.1 分子系統(tǒng)學在蟻科昆蟲的應用
1.3.2 分子系統(tǒng)學在行軍蟻亞科中的應用
1.4 立項依據(jù)
1.5 研究目的
第2章 實驗材料與方法
2.1 形態(tài)測量學研究
2.1.1 實驗材料
2.1.2 螞蟻標本制作
2.1.3 實驗所需儀器
2.1.4 圖片獲取與數(shù)據(jù)整理
2.1.5 數(shù)據(jù)分析方法
2.1.5.1 人工神經(jīng)網(wǎng)絡分析
2.1.5.2 高斯混合模型
2.2 分子系統(tǒng)學研究
2.2.1 實驗材料
2.2.2 實驗儀器
2.2.3 實驗試劑
2.2.4 實驗方法
2.2.4.1 螞蟻DNA的提取
2.2.4.2 樣品DNA檢測
2.2.4.3 目的基因片段的PCR擴增
2.2.4.4 目的PCR產(chǎn)物的檢測
2.2.5 數(shù)據(jù)處理方法
2.2.5.1 序列比對、剪切和拼接
2.2.5.2 雙節(jié)行軍蟻亞科COI基因條形碼的系統(tǒng)發(fā)育信號檢測
2.1.5.3 構建系統(tǒng)發(fā)育樹
第3章 行軍蟻亞科的形態(tài)測量學與分子系統(tǒng)學分析
3.1 形態(tài)測量學分析
3.1.1 人工神經(jīng)網(wǎng)絡分析
3.1.2 高斯混合模型結果與分析
3.2 雙節(jié)行軍蟻亞科的分子系統(tǒng)學研究
3.2.1 COI序列特征
3.2.2 COI基因部分片段的堿基替換分析
3.2.3 系統(tǒng)發(fā)育信號檢測
3.2.4 系統(tǒng)發(fā)育分析
3.2.5 構建系統(tǒng)發(fā)育樹
3.2.5.1 鄰接法構建NJ樹
3.2.5.2 最大似然法構建ML樹
3.2.5.3 貝葉斯推論法構建BI樹
第4章 討論
4.1 行軍蟻亞科部分屬的形態(tài)測量分析
4.2 行軍蟻亞科部分屬的系統(tǒng)發(fā)育分析
第5章 新種描述
5.1 崇左盲蟻Aenictus chongzuoensis sp.nov
5.2 雙色旁影蟻Parasyscia bicolor sp.nov
5.3 云川旁影蟻Parasyscia yunchuani sp.nov
5.4 八節(jié)卵角蟻Ooceraea octoantenma sp.nov
第6章 總結
參考文獻
附錄
攻讀碩士學位期間發(fā)表的論文情況
致謝
本文編號:3763541
【文章頁數(shù)】:77 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第1章 前言
1.1 中國蟻科分類簡介
1.2 形態(tài)測量學研究
1.2.1 形態(tài)測量學國內(nèi)外研究進展
1.3 分子系統(tǒng)學研究
1.3.1 分子系統(tǒng)學在蟻科昆蟲的應用
1.3.2 分子系統(tǒng)學在行軍蟻亞科中的應用
1.4 立項依據(jù)
1.5 研究目的
第2章 實驗材料與方法
2.1 形態(tài)測量學研究
2.1.1 實驗材料
2.1.2 螞蟻標本制作
2.1.3 實驗所需儀器
2.1.4 圖片獲取與數(shù)據(jù)整理
2.1.5 數(shù)據(jù)分析方法
2.1.5.1 人工神經(jīng)網(wǎng)絡分析
2.1.5.2 高斯混合模型
2.2 分子系統(tǒng)學研究
2.2.1 實驗材料
2.2.2 實驗儀器
2.2.3 實驗試劑
2.2.4 實驗方法
2.2.4.1 螞蟻DNA的提取
2.2.4.2 樣品DNA檢測
2.2.4.3 目的基因片段的PCR擴增
2.2.4.4 目的PCR產(chǎn)物的檢測
2.2.5 數(shù)據(jù)處理方法
2.2.5.1 序列比對、剪切和拼接
2.2.5.2 雙節(jié)行軍蟻亞科COI基因條形碼的系統(tǒng)發(fā)育信號檢測
2.1.5.3 構建系統(tǒng)發(fā)育樹
第3章 行軍蟻亞科的形態(tài)測量學與分子系統(tǒng)學分析
3.1 形態(tài)測量學分析
3.1.1 人工神經(jīng)網(wǎng)絡分析
3.1.2 高斯混合模型結果與分析
3.2 雙節(jié)行軍蟻亞科的分子系統(tǒng)學研究
3.2.1 COI序列特征
3.2.2 COI基因部分片段的堿基替換分析
3.2.3 系統(tǒng)發(fā)育信號檢測
3.2.4 系統(tǒng)發(fā)育分析
3.2.5 構建系統(tǒng)發(fā)育樹
3.2.5.1 鄰接法構建NJ樹
3.2.5.2 最大似然法構建ML樹
3.2.5.3 貝葉斯推論法構建BI樹
第4章 討論
4.1 行軍蟻亞科部分屬的形態(tài)測量分析
4.2 行軍蟻亞科部分屬的系統(tǒng)發(fā)育分析
第5章 新種描述
5.1 崇左盲蟻Aenictus chongzuoensis sp.nov
5.2 雙色旁影蟻Parasyscia bicolor sp.nov
5.3 云川旁影蟻Parasyscia yunchuani sp.nov
5.4 八節(jié)卵角蟻Ooceraea octoantenma sp.nov
第6章 總結
參考文獻
附錄
攻讀碩士學位期間發(fā)表的論文情況
致謝
本文編號:3763541
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