青海省裂腹魚(yú)魚(yú)類至少有20種,占青海省土著魚(yú)類的40%以上;其中5種為瀕危物種,8種為易危物種。準(zhǔn)確的物種鑒定對(duì)于這些物種的保護(hù)至關(guān)重要。傳統(tǒng)分類學(xué)方法在裂腹魚(yú)類的物種鑒定中不僅操作繁復(fù),甚至易出現(xiàn)錯(cuò)誤。因此,有必要開(kāi)發(fā)一種能夠快速對(duì)各裂腹魚(yú)物種進(jìn)行準(zhǔn)確鑒定的方法。DNA條形碼技術(shù)(DNA barcoding)是一種用于快速鑒定物種的分子技術(shù),Self-Organized Map(SOM)可用于預(yù)測(cè)不同分類群間的特異性診斷位點(diǎn)。本研究基于COI基因,并以Cyt b基因作為分子參照,開(kāi)展了青海省裂腹魚(yú)DNA條形碼及其特征性診斷位點(diǎn)研究,主要研究結(jié)果如下:1.本研究共獲得了青海省24個(gè)采樣點(diǎn)159尾(8屬15種/亞種)裂腹魚(yú)的COI基因序列(648 bp)。經(jīng)Blast比對(duì),鑒定率達(dá)98%�；贙imura-2-Parameter(K2P)模型,COI序列的平均種間遺傳距離為9.17%,約為平均種內(nèi)遺傳距離(0.22%)的42倍;但僅5種裂腹魚(yú)的遺傳距離同時(shí)符合2%閾值和10倍原則,暗示種間距離與種內(nèi)距離存在重疊區(qū)。Cyt b序列分析也得到相同的結(jié)果。此外,Automatic Barcod...

【文章頁(yè)數(shù)】：56 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
中文摘要
Abstract
第一章 緒論
    1.1 裂腹魚(yú)資源及其研究現(xiàn)狀
        1.1.1 裂腹魚(yú)簡(jiǎn)介
        1.1.2 青海省裂腹魚(yú)資源狀況
        1.1.3 裂腹魚(yú)研究現(xiàn)狀
    1.2 DNA條形碼分子標(biāo)記及研究現(xiàn)狀
        1.2.1 DNA條形碼簡(jiǎn)介
        1.2.2 DNA條形碼分子標(biāo)記
        1.2.3 DNA條形碼研究現(xiàn)狀
    1.3 SOM法
    1.4 研究目的與意義
    1.5 分析軟件
第二章 材料與方法
    2.1 實(shí)驗(yàn)器材與試劑
        2.1.1 實(shí)驗(yàn)器材
        2.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
    2.2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.2.1 采樣
        2.2.2 DNA提取、PCR擴(kuò)增及測(cè)序
        2.2.3 數(shù)據(jù)分析
第三章 結(jié)果與分析
    3.1 基因組DNA提取及擴(kuò)增測(cè)序結(jié)果
    3.2 COI條形碼序列特征
    3.3 COI條形碼物種鑒定有效性
        3.3.1 Blast比對(duì)結(jié)果
        3.3.2 遺傳距離分析結(jié)果
        3.3.3 系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果
    3.4 裂腹魚(yú)類種級(jí)特征性診斷位點(diǎn)
第四章 討論
    4.1 COI條形碼有效性分析
    4.2 物種鑒定中的異常種群/個(gè)體分析
    4.3 COI片段作為DNA條形碼的優(yōu)劣勢(shì)
    4.4 SOM預(yù)測(cè)模型在物種水平上的可行性
    4.5 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物福利
第五章 結(jié)論與展望
參考文獻(xiàn)
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)歷



本文編號(hào)：3751304