青海省裂腹魚魚類至少有20種,占青海省土著魚類的40%以上;其中5種為瀕危物種,8種為易危物種。準確的物種鑒定對于這些物種的保護至關(guān)重要。傳統(tǒng)分類學方法在裂腹魚類的物種鑒定中不僅操作繁復(fù),甚至易出現(xiàn)錯誤。因此,有必要開發(fā)一種能夠快速對各裂腹魚物種進行準確鑒定的方法。DNA條形碼技術(shù)(DNA barcoding)是一種用于快速鑒定物種的分子技術(shù),Self-Organized Map(SOM)可用于預(yù)測不同分類群間的特異性診斷位點。本研究基于COI基因,并以Cyt b基因作為分子參照,開展了青海省裂腹魚DNA條形碼及其特征性診斷位點研究,主要研究結(jié)果如下:1.本研究共獲得了青海省24個采樣點159尾(8屬15種/亞種)裂腹魚的COI基因序列(648 bp)。經(jīng)Blast比對,鑒定率達98%�；贙imura-2-Parameter(K2P)模型,COI序列的平均種間遺傳距離為9.17%,約為平均種內(nèi)遺傳距離(0.22%)的42倍;但僅5種裂腹魚的遺傳距離同時符合2%閾值和10倍原則,暗示種間距離與種內(nèi)距離存在重疊區(qū)。Cyt b序列分析也得到相同的結(jié)果。此外,Automatic Barcod...

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【學位級別】：碩士

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中文摘要
Abstract
第一章 緒論
    1.1 裂腹魚資源及其研究現(xiàn)狀
        1.1.1 裂腹魚簡介
        1.1.2 青海省裂腹魚資源狀況
        1.1.3 裂腹魚研究現(xiàn)狀
    1.2 DNA條形碼分子標記及研究現(xiàn)狀
        1.2.1 DNA條形碼簡介
        1.2.2 DNA條形碼分子標記
        1.2.3 DNA條形碼研究現(xiàn)狀
    1.3 SOM法
    1.4 研究目的與意義
    1.5 分析軟件
第二章 材料與方法
    2.1 實驗器材與試劑
        2.1.1 實驗器材
        2.1.2 實驗試劑
    2.2 實驗方法
        2.2.1 采樣
        2.2.2 DNA提取、PCR擴增及測序
        2.2.3 數(shù)據(jù)分析
第三章 結(jié)果與分析
    3.1 基因組DNA提取及擴增測序結(jié)果
    3.2 COI條形碼序列特征
    3.3 COI條形碼物種鑒定有效性
        3.3.1 Blast比對結(jié)果
        3.3.2 遺傳距離分析結(jié)果
        3.3.3 系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果
    3.4 裂腹魚類種級特征性診斷位點
第四章 討論
    4.1 COI條形碼有效性分析
    4.2 物種鑒定中的異常種群/個體分析
    4.3 COI片段作為DNA條形碼的優(yōu)劣勢
    4.4 SOM預(yù)測模型在物種水平上的可行性
    4.5 實驗動物福利
第五章 結(jié)論與展望
參考文獻
致謝
個人簡歷



本文編號：3751304