煙草NtMYB44b轉(zhuǎn)錄因子基因克隆以及生物信息學和表達分析
發(fā)布時間:2023-01-30 22:05
以栽培煙草(Nicotina tabacum)為研究對象,克隆獲得1個MYB轉(zhuǎn)錄因子家族成員基因NtMYB44b的全長cDNA編碼序列,其開放閱讀框長度為1 086 bp,編碼361個氨基酸。生物信息學分析表明,NtMYB44b分子質(zhì)量為39.86 kDa,N端含有2個MYB的DNA保守結合域,為R2R3-MYB型轉(zhuǎn)錄因子。實時熒光定量PCR分析結果表明,NtMYB44b在煙草根、莖、葉、花中均有表達,尤其以根中相對表達量最高;NtMYB44b經(jīng)100μmol·L-1茉莉酸甲酯(MeJA)、100 mg·L-1赤霉素(GA)、10μmol·L-1脫落酸(ABA)處理后,分別于6、6、12 h相對表達量顯著上調(diào),而50 mg·L-1水楊酸處理對該基因表達無顯著影響;經(jīng)100 g·L-1 PEG6000干旱脅迫處理后1 d,NtMYB44b相對表達量顯著下調(diào)。推測NtMYB44b能對上述濃度的MeJA、GA、ABA處理以及干旱脅迫產(chǎn)生應答。
【文章頁數(shù)】:9 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 實驗材料
1.2 實驗試劑
1.3 實驗方法
1.3.1 Nt MYB44b基因克隆
1.3.2 生物信息學分析
1.3.3 q RT-PCR
2 實驗結果
2.1 Nt MYB44b基因克隆及編碼蛋白氨基酸序列分析
2.2 多重序列比對及系統(tǒng)進化分析
2.3 Nt MYB44b基因組織特異性表達分析
2.4 Nt MYB44b對非生物脅迫的響應
3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]超量表達NtHAK1基因提高煙草干旱脅迫能力[J]. 張祎,秦利軍,趙丹,趙德剛. 植物生理學報. 2017(08)
[2]植物MYB44轉(zhuǎn)錄因子的功能及其在橡膠樹抗逆研究中的應用前景[J]. 王立豐,陸燕茜,王紀坤,覃碧,張冬. 熱帶農(nóng)業(yè)科學. 2017(05)
[3]植物轉(zhuǎn)錄因子MYB基因家族的研究進展[J]. 牛義嶺,姜秀明,許向陽. 分子植物育種. 2016(08)
[4]MYB轉(zhuǎn)錄因子在植物鹽脅迫調(diào)控中的研究進展[J]. 陳娜,遲曉元,潘麗娟,陳明娜,禹山林. 植物生理學報. 2015(09)
[5]20個煙草品種干旱脅迫下發(fā)芽和苗期生理特性及耐旱性評價[J]. 馬文廣,崔華威,李永平,鄭昀曄,王洋,秦國臣,胡晉. 種子. 2012(02)
[6]番茄冷誘導基因SlCMYB1的克隆及其在水稻中異源表達研究[J]. 張欣,程治軍,林啟冰,王久林,萬建民. 作物學報. 2011(04)
[7]轉(zhuǎn)錄因子在植物進化和抗逆中的作用[J]. 孫麗芳,邢少辰,張君,楊建福,王興智,董英山. 基因組學與應用生物學. 2009(03)
本文編號:3733470
【文章頁數(shù)】:9 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 實驗材料
1.2 實驗試劑
1.3 實驗方法
1.3.1 Nt MYB44b基因克隆
1.3.2 生物信息學分析
1.3.3 q RT-PCR
2 實驗結果
2.1 Nt MYB44b基因克隆及編碼蛋白氨基酸序列分析
2.2 多重序列比對及系統(tǒng)進化分析
2.3 Nt MYB44b基因組織特異性表達分析
2.4 Nt MYB44b對非生物脅迫的響應
3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]超量表達NtHAK1基因提高煙草干旱脅迫能力[J]. 張祎,秦利軍,趙丹,趙德剛. 植物生理學報. 2017(08)
[2]植物MYB44轉(zhuǎn)錄因子的功能及其在橡膠樹抗逆研究中的應用前景[J]. 王立豐,陸燕茜,王紀坤,覃碧,張冬. 熱帶農(nóng)業(yè)科學. 2017(05)
[3]植物轉(zhuǎn)錄因子MYB基因家族的研究進展[J]. 牛義嶺,姜秀明,許向陽. 分子植物育種. 2016(08)
[4]MYB轉(zhuǎn)錄因子在植物鹽脅迫調(diào)控中的研究進展[J]. 陳娜,遲曉元,潘麗娟,陳明娜,禹山林. 植物生理學報. 2015(09)
[5]20個煙草品種干旱脅迫下發(fā)芽和苗期生理特性及耐旱性評價[J]. 馬文廣,崔華威,李永平,鄭昀曄,王洋,秦國臣,胡晉. 種子. 2012(02)
[6]番茄冷誘導基因SlCMYB1的克隆及其在水稻中異源表達研究[J]. 張欣,程治軍,林啟冰,王久林,萬建民. 作物學報. 2011(04)
[7]轉(zhuǎn)錄因子在植物進化和抗逆中的作用[J]. 孫麗芳,邢少辰,張君,楊建福,王興智,董英山. 基因組學與應用生物學. 2009(03)
本文編號:3733470
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