犁頭鰍（Lepturichthys fimbriata）是一種底棲的小型魚類,喜急流,產(chǎn)漂流性卵,主要分布在長江中上游干流及其支流。近年來,隨著長江上游流域梯級水電站的建設(shè)運(yùn)行,犁頭鰍的適宜棲息地正逐漸被壓縮,加上水域污染及過度捕撈,部分支流已很難發(fā)現(xiàn)犁頭鰍的蹤跡,其資源量面臨下降的趨勢。因此,本研究沿長江上游流域共采集7個種群的犁頭鰍,利用微衛(wèi)星和線粒體標(biāo)記,在分子層面上探究長江上游犁頭鰍的遺傳多樣性、遺傳結(jié)構(gòu)和種群歷史動態(tài),并提出保護(hù)建議。主要內(nèi)容和結(jié)果如下:1.微衛(wèi)星引物開發(fā)基于Illumina Novaseq 6000高通量測序技術(shù)開發(fā)犁頭鰍多態(tài)性微衛(wèi)星位點(diǎn)。高通量測序返回25180條可用微衛(wèi)星序列,從中挑選出180對微衛(wèi)星位點(diǎn)用于多態(tài)性篩選,最終獲得22對擴(kuò)增效果良好的微衛(wèi)星多態(tài)性位點(diǎn)。22對多態(tài)性微衛(wèi)星位點(diǎn)的等位基因數(shù)（NA）在9~30之間,觀測雜合度（HO）范圍在0.48~1.00之間,期望雜合度（HE）范圍在0.70~0.98之間,多態(tài)性信息含量（PIC）為0.75~0.96,表明本研究開發(fā)的引物多態(tài)性較好。2.基于微衛(wèi)星標(biāo)記的遺傳多樣性研究從22對多態(tài)性微衛(wèi)星位點(diǎn)中挑... 

【文章頁數(shù)】：67 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第1章 文獻(xiàn)綜述
    1.1 長江上游及魚類概況
        1.1.1 長江上游自然環(huán)境特征
        1.1.2 長江上游魚類多樣性
        1.1.3 水電站建設(shè)對長江上游產(chǎn)漂流性卵魚類的影響
    1.2 遺傳多樣性
        1.2.1 遺傳多樣性概念
        1.2.2 遺傳多樣性研究的意義
    1.3 遺傳多樣性研究中的分子標(biāo)記
        1.3.1 線粒體DNA及其在魚類種群遺傳學(xué)研究中的應(yīng)用
        1.3.2 微衛(wèi)星標(biāo)記及其在魚類種群遺傳學(xué)研究中的應(yīng)用
    1.4 犁頭鰍研究進(jìn)展
        1.4.1 犁頭鰍基礎(chǔ)生物學(xué)研究
        1.4.2 犁頭鰍遺傳多樣性研究
    1.5 本研究的目的及意義
第2章 基于微衛(wèi)星標(biāo)記的遺傳多樣性研究
    2.1 引言
    2.2 材料與方法
        2.2.1 實驗材料
        2.2.2 實驗儀器
        2.2.3 溶液配制
        2.2.4 研究方法
        2.2.5 數(shù)據(jù)分析
    2.3 結(jié)果
        2.3.1 微衛(wèi)星位點(diǎn)組成
        2.3.2 多態(tài)性微衛(wèi)星位點(diǎn)開發(fā)
        2.3.3 遺傳多樣性
        2.3.4 遺傳結(jié)構(gòu)
    2.4 討論
        2.4.1 犁頭鰍微衛(wèi)星標(biāo)記開發(fā)
        2.4.2 犁頭鰍遺傳多樣性分析
        2.4.3 犁頭鰍遺傳結(jié)構(gòu)分析
    2.5 保護(hù)建議
第3章 犁頭鰍線粒體DNA遺傳多樣性研究
    3.1 引言
    3.2 材料與方法
        3.2.1 實驗材料
        3.2.2 實驗儀器
        3.2.3 研究方法
        3.2.4 數(shù)據(jù)分析
    3.3 結(jié)果
        3.3.1 序列變異及遺傳多樣性
        3.3.2 遺傳結(jié)構(gòu)
        3.3.3 種群歷史
    3.4 討論
        3.4.1 犁頭鰍遺傳多樣性分析
        3.4.2 犁頭鰍遺傳結(jié)構(gòu)分析
        3.4.3 犁頭鰍種群歷史分析
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
發(fā)表文章及科研實踐活動


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]大渡河樂山段魚類群落結(jié)構(gòu)特征研究[J]. 鄧旭艷,王文君,方艷紅,黃道明.  水生態(tài)學(xué)雜志. 2020(02)
[2]西昌華吸鰍的微衛(wèi)星引物篩選及赤水河四個地理種群的遺傳多樣性分析[J]. 張智,俞丹,劉飛,劉煥章.  水生生物學(xué)報. 2019(06)
[3]三個地理種群的董氏須鰍遺傳多樣性及種群歷史動態(tài)[J]. 陳浩,楊銀盆,張慧,陳詠霞.  水生生物學(xué)報. 2019(05)
[4]基于微衛(wèi)星標(biāo)記的黃唇魚遺傳多樣性研究[J]. 趙彥花,區(qū)又君,溫久福,李加兒,周慧.  南方水產(chǎn)科學(xué). 2019(04)
[5]甘肅省3種裂腹魚遺傳多樣性與地理種群分化[J]. 婁晉銘,張智,王太,高堅.  華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2019(04)
[6]長江刀鱭選育和野生群體遺傳多樣性的微衛(wèi)星分析[J]. 于愛清,施永海,鄧平平.  水產(chǎn)科技情報. 2019(03)
[7]高通量測序技術(shù)的研究進(jìn)展[J]. 李妍,徐興祥.  中國醫(yī)學(xué)工程. 2019(03)
[8]三峽庫區(qū)重要支流魚類多樣性初探[J]. 解崇友,牛亞兵,羅德懷,馮興無,蒲德永,彭作剛,曾波,王志堅.  長江流域資源與環(huán)境. 2018(12)
[9]基于高通量測序的中華鳑鲏基因組微衛(wèi)星特征分析及標(biāo)記開發(fā)[J]. 熊良偉,王帥兵,封琦,王建國,岳麗佳,張娟,吳云菲,王權(quán).  江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(18)
[10]基于微衛(wèi)星的中華鱉（Pelodiscus sinensis）選育世代遺傳多樣性監(jiān)測[J]. 程珂,陳辰,史燕,朱新平.  基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2018(09)

博士論文
[1]石爬鮡復(fù)合種局域適應(yīng)及物種形成的分子基礎(chǔ)研究[D]. 李燕平.西南大學(xué) 2017
[2]長江上游保護(hù)區(qū)長薄鰍和紅唇薄鰍種群生態(tài)及遺傳結(jié)構(gòu)比較研究[D]. 田輝伍.西南大學(xué) 2013
[3]鰍超科魚類分子系統(tǒng)發(fā)育研究[D]. 唐瓊英.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005

碩士論文
[1]長江上游梯級水電開發(fā)對魚類生物多樣性影響的初探[D]. 李陳.華中科技大學(xué) 2012



本文編號：3724166