發(fā)布時間：2022-12-11 11:02

　　細(xì)胞型朊蛋白錯誤折疊為致病型朊蛋白會引起人和哺乳動物患上神經(jīng)退行性疾病。該領(lǐng)域普遍接受的理論是朊蛋白分子結(jié)構(gòu)變化是朊病毒病及其感染性的原因,了解細(xì)胞型朊蛋白如何重新折疊成致病型朊蛋白一直是分子生物學(xué)、生物物理學(xué)、病理學(xué)和免疫學(xué)領(lǐng)域的“終極挑戰(zhàn)”。目前,細(xì)胞型朊蛋白錯誤折疊的機(jī)制和致病朊蛋白結(jié)構(gòu)解析兩個重大問題并沒有解決,本文將從力學(xué)的角度提出細(xì)胞型朊蛋白錯誤折疊的力學(xué)機(jī)制,并預(yù)測出一個科學(xué)合理的致病朊蛋白四階β-螺旋結(jié)構(gòu)模型。細(xì)胞型朊蛋白到致病型朊蛋白的構(gòu)象變化涉及到α螺旋的打開,生理條件下熱力學(xué)結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的螺旋打開是非常困難的。因此,本文先研究了其他正常α螺旋的結(jié)構(gòu)特征和穩(wěn)定機(jī)制,幫助了解細(xì)胞型朊蛋白α1螺旋結(jié)構(gòu)不穩(wěn)定的原因。使用拉伸分子動力學(xué)模擬觀察和分析了α1螺旋結(jié)構(gòu)打開過程的變化,得到外力作用下α1螺旋打開的去折疊路徑,幫助我們理解α1-螺旋在細(xì)胞型朊蛋白錯誤折疊過程中起到的作用。實驗條件下,細(xì)胞型朊蛋白在酸性環(huán)境下加入肝素等多聚陰離子會錯誤折疊為致病型朊蛋白。但是,現(xiàn)階段最先進(jìn)的技術(shù)也無法獲得細(xì)胞型朊蛋白錯誤折疊的動力學(xué)過程。因此,使用理論嚴(yán)謹(jǐn)和科學(xué)可信的分子動力學(xué)模擬是一個行... 

【文章頁數(shù)】：73 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
第一章 緒論
    1.1 課題背景和研究意義
        1.1.1 課題背景
        1.1.2 課題研究目的和意義
    1.2 國內(nèi)外研究現(xiàn)狀
        1.2.1 朊病毒病及其朊蛋白結(jié)構(gòu)
        1.2.2 朊蛋白錯誤折疊機(jī)制
        1.2.3 分子動力學(xué)模擬理論及其在朊病毒研究中的應(yīng)用
    1.3 主要研究內(nèi)容
        1.3.1 細(xì)胞型朊蛋白α1-螺旋破壞的力學(xué)行為
        1.3.2 朊蛋白構(gòu)象變化的分子動力學(xué)模擬
        1.3.3 朊蛋白錯誤折疊的力學(xué)機(jī)制
第二章 細(xì)胞型朊蛋白α1-螺旋破壞的力學(xué)行為
    2.1 引言
    2.2 α-螺旋結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性
        2.2.1 α-螺旋的結(jié)構(gòu)
        2.2.2 α-螺旋穩(wěn)定的力學(xué)原因
    2.3 細(xì)胞型朊蛋白α1-螺旋結(jié)構(gòu)的不穩(wěn)定性
        2.3.1 α1-螺旋結(jié)構(gòu)的不穩(wěn)定性表征
        2.3.2 螺旋不穩(wěn)定的原因
    2.4 拉伸α1-螺旋分子動力學(xué)模擬
        2.4.1 拉伸分子動力學(xué)理論
        2.4.2 模擬設(shè)置和步驟
        2.4.3 分析模擬結(jié)果
    2.5 本章小結(jié)
第三章 朊蛋白構(gòu)象變化的分子動力學(xué)模擬
    3.1 引言
    3.2 高溫條件下朊蛋白構(gòu)象變化分子動力學(xué)模擬
        3.2.1 模擬參數(shù)設(shè)置
        3.2.2 結(jié)果和討論
    3.3 酸性條件下朊蛋白構(gòu)象變化分子動力學(xué)模擬
        3.3.1 模擬理論
        3.3.2 參數(shù)設(shè)置
        3.3.3 分析結(jié)果
    3.4 本章小結(jié)
第四章 朊蛋白錯誤折疊的力學(xué)機(jī)制
    4.1 引言
    4.2 多聚陰離子啟動朊蛋白錯誤折疊的力學(xué)機(jī)制
        4.2.1 多聚陰離子起到的作用
        4.2.2 細(xì)胞型朊蛋白錯誤折疊的力學(xué)機(jī)制
    4.3 朊蛋白錯誤折疊后的結(jié)構(gòu)
        4.3.1 PrPSc結(jié)構(gòu)
        4.3.2 四階β-結(jié)構(gòu)的預(yù)測
    4.4 本章小結(jié)
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]未折疊蛋白質(zhì)的普遍初始熱力學(xué)亞穩(wěn)態(tài)[J]. 楊霖,郭帥,馬曉亮,侯成宇,史麗萍,李佳成,赫曉東.  生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2019(10)



本文編號：3718664