煙草TIR-NBS基因家族的生物信息學(xué)分析
發(fā)布時間:2022-11-07 20:43
TIR-NBS基因是一類與植物抗病調(diào)節(jié)和生長發(fā)育密切相關(guān)的基因,其特征解析有助于對植物免疫和發(fā)育調(diào)節(jié)的認識。該研究通過生物信息學(xué)分析方法,從基因鑒定、染色體分布、基因結(jié)構(gòu)、蛋白性質(zhì)和結(jié)構(gòu)、信號肽、亞細胞定位和順式作用元件等方面,對煙草TIR-NBS基因家族進行了鑒定和分子特性分析。結(jié)果表明:煙草TIR-NBS基因家族含有30條成員,分布在21條染色體上,含有3~8個保守基序;編碼蛋白均為不穩(wěn)定蛋白,無信號肽,主要分布于細胞核、細胞質(zhì)和葉綠體中,二級結(jié)構(gòu)以α-螺旋和無規(guī)則卷曲為主要構(gòu)成元件;進化時主要受純化選擇作用,與番茄的TIR-NBS基因親緣關(guān)系最近;順式作用元件分析表明其可能受光照、溫度以及生長素、茉莉酸甲酯、脫落酸、水楊酸、赤霉素等激素調(diào)控。該研究結(jié)果為進一步探究TIR-NBS基因的生物學(xué)功能及提高植物產(chǎn)量和品質(zhì)提供了依據(jù)。
【文章頁數(shù)】:10 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 TIR-NBS基因家族鑒定
1.2 染色體定位分析
1.3 基因結(jié)構(gòu)與motif分析
1.4 蛋白結(jié)構(gòu)與亞細胞定位分析
1.5 TIR-NBS蛋白的理化性質(zhì)分析
1.6 進化選擇壓力分析
1.7 系統(tǒng)發(fā)育分析
1.8 順式作用元件分析
2 結(jié)果與分析
2.1 TIR-NBS基因家族成員
2.2 TIR-NBS基因家族的染色體分布
2.3 TIR-NBS基因的結(jié)構(gòu)組成
2.4 TIR-NBS蛋白結(jié)構(gòu)特點、細胞位置和信號肽
2.5 TIR-NBS蛋白的理化性質(zhì)
2.6 TIR-NBS基因的進化選擇
2.7 TIR-NBS基因家族的系統(tǒng)發(fā)育樹
2.8 TIR-NBS基因家族的順式作用元件組成
3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]水楊酸誘導(dǎo)黃瓜PCD的鑒定及相關(guān)基因的表達分析[J]. 陳沖,劉雙,王丹丹,池春玉,朱宏,金曉霞,丁國華. 華北農(nóng)學(xué)報. 2018(06)
[2]亞麻薺NBS類抗病基因家族的鑒定與分析[J]. 孫巖,劉寶玲,苑麗霞,薛金愛,賈小云,李潤植. 分子植物育種. 2017(04)
[3]植物TIR-NB-LRR類型抗病基因各結(jié)構(gòu)域的研究進展[J]. 尹玲,方輝,黃羽,盧江,曲俊杰. 廣西植物. 2017(02)
[4]水楊酸介導(dǎo)植物抗病的研究進展[J]. 汪尚,徐鷺芹,張亞仙,曾后清,杜立群. 植物生理學(xué)報. 2016(05)
[5]木薯EIN3基因的序列分析及其乙烯和茉莉酸甲酯誘導(dǎo)表達特性[J]. 叢漢卿,齊堯堯,張振文,陳松筆,喬飛. 分子植物育種. 2015(12)
[6]亞麻NBS類抗病基因家族全基因組分析[J]. 謝冬微,路穎,趙德寶,楊學(xué),粟建光,孫健. 中國麻業(yè)科學(xué). 2015(03)
[7]NBS-LRR類抗病蛋白介導(dǎo)的植物抗病應(yīng)答分子機制[J]. 房衛(wèi)平,謝德意,李志芳,李武,趙付安,孫瑤,段崢崢,楊曉杰. 分子植物育種. 2015(02)
本文編號:3704367
【文章頁數(shù)】:10 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 TIR-NBS基因家族鑒定
1.2 染色體定位分析
1.3 基因結(jié)構(gòu)與motif分析
1.4 蛋白結(jié)構(gòu)與亞細胞定位分析
1.5 TIR-NBS蛋白的理化性質(zhì)分析
1.6 進化選擇壓力分析
1.7 系統(tǒng)發(fā)育分析
1.8 順式作用元件分析
2 結(jié)果與分析
2.1 TIR-NBS基因家族成員
2.2 TIR-NBS基因家族的染色體分布
2.3 TIR-NBS基因的結(jié)構(gòu)組成
2.4 TIR-NBS蛋白結(jié)構(gòu)特點、細胞位置和信號肽
2.5 TIR-NBS蛋白的理化性質(zhì)
2.6 TIR-NBS基因的進化選擇
2.7 TIR-NBS基因家族的系統(tǒng)發(fā)育樹
2.8 TIR-NBS基因家族的順式作用元件組成
3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]水楊酸誘導(dǎo)黃瓜PCD的鑒定及相關(guān)基因的表達分析[J]. 陳沖,劉雙,王丹丹,池春玉,朱宏,金曉霞,丁國華. 華北農(nóng)學(xué)報. 2018(06)
[2]亞麻薺NBS類抗病基因家族的鑒定與分析[J]. 孫巖,劉寶玲,苑麗霞,薛金愛,賈小云,李潤植. 分子植物育種. 2017(04)
[3]植物TIR-NB-LRR類型抗病基因各結(jié)構(gòu)域的研究進展[J]. 尹玲,方輝,黃羽,盧江,曲俊杰. 廣西植物. 2017(02)
[4]水楊酸介導(dǎo)植物抗病的研究進展[J]. 汪尚,徐鷺芹,張亞仙,曾后清,杜立群. 植物生理學(xué)報. 2016(05)
[5]木薯EIN3基因的序列分析及其乙烯和茉莉酸甲酯誘導(dǎo)表達特性[J]. 叢漢卿,齊堯堯,張振文,陳松筆,喬飛. 分子植物育種. 2015(12)
[6]亞麻NBS類抗病基因家族全基因組分析[J]. 謝冬微,路穎,趙德寶,楊學(xué),粟建光,孫健. 中國麻業(yè)科學(xué). 2015(03)
[7]NBS-LRR類抗病蛋白介導(dǎo)的植物抗病應(yīng)答分子機制[J]. 房衛(wèi)平,謝德意,李志芳,李武,趙付安,孫瑤,段崢崢,楊曉杰. 分子植物育種. 2015(02)
本文編號:3704367
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