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煙草TIR-NBS基因家族的生物信息學(xué)分析

發(fā)布時間:2022-11-07 20:43
  TIR-NBS基因是一類與植物抗病調(diào)節(jié)和生長發(fā)育密切相關(guān)的基因,其特征解析有助于對植物免疫和發(fā)育調(diào)節(jié)的認識。該研究通過生物信息學(xué)分析方法,從基因鑒定、染色體分布、基因結(jié)構(gòu)、蛋白性質(zhì)和結(jié)構(gòu)、信號肽、亞細胞定位和順式作用元件等方面,對煙草TIR-NBS基因家族進行了鑒定和分子特性分析。結(jié)果表明:煙草TIR-NBS基因家族含有30條成員,分布在21條染色體上,含有3~8個保守基序;編碼蛋白均為不穩(wěn)定蛋白,無信號肽,主要分布于細胞核、細胞質(zhì)和葉綠體中,二級結(jié)構(gòu)以α-螺旋和無規(guī)則卷曲為主要構(gòu)成元件;進化時主要受純化選擇作用,與番茄的TIR-NBS基因親緣關(guān)系最近;順式作用元件分析表明其可能受光照、溫度以及生長素、茉莉酸甲酯、脫落酸、水楊酸、赤霉素等激素調(diào)控。該研究結(jié)果為進一步探究TIR-NBS基因的生物學(xué)功能及提高植物產(chǎn)量和品質(zhì)提供了依據(jù)。 

【文章頁數(shù)】:10 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 TIR-NBS基因家族鑒定
    1.2 染色體定位分析
    1.3 基因結(jié)構(gòu)與motif分析
    1.4 蛋白結(jié)構(gòu)與亞細胞定位分析
    1.5 TIR-NBS蛋白的理化性質(zhì)分析
    1.6 進化選擇壓力分析
    1.7 系統(tǒng)發(fā)育分析
    1.8 順式作用元件分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 TIR-NBS基因家族成員
    2.2 TIR-NBS基因家族的染色體分布
    2.3 TIR-NBS基因的結(jié)構(gòu)組成
    2.4 TIR-NBS蛋白結(jié)構(gòu)特點、細胞位置和信號肽
    2.5 TIR-NBS蛋白的理化性質(zhì)
    2.6 TIR-NBS基因的進化選擇
    2.7 TIR-NBS基因家族的系統(tǒng)發(fā)育樹
    2.8 TIR-NBS基因家族的順式作用元件組成
3 討論


【參考文獻】:
期刊論文
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[3]植物TIR-NB-LRR類型抗病基因各結(jié)構(gòu)域的研究進展[J]. 尹玲,方輝,黃羽,盧江,曲俊杰.  廣西植物. 2017(02)
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[6]亞麻NBS類抗病基因家族全基因組分析[J]. 謝冬微,路穎,趙德寶,楊學(xué),粟建光,孫健.  中國麻業(yè)科學(xué). 2015(03)
[7]NBS-LRR類抗病蛋白介導(dǎo)的植物抗病應(yīng)答分子機制[J]. 房衛(wèi)平,謝德意,李志芳,李武,趙付安,孫瑤,段崢崢,楊曉杰.  分子植物育種. 2015(02)



本文編號:3704367

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