腹露蝗屬Fruhstorferiola Willemse,1922隸屬于直翅目Orthoptera,蝗總科Acridoidea,斑腿蝗科Catantopidae,黑蝗亞科Melanoplinae。為豐富腹露蝗屬分子系統(tǒng)學(xué)數(shù)據(jù),探討腹露蝗屬單系性和屬內(nèi)部分形態(tài)學(xué)物種的獨(dú)立性,本研究采用高通量測(cè)序結(jié)合克隆測(cè)序的方法,獲得了 7種腹露蝗屬蝗蟲(chóng)共72條線粒體全基因組數(shù)據(jù)并分析了腹露蝗屬線粒體全基因組特征。結(jié)合從GenBank上下載的20種相關(guān)蝗總科昆蟲(chóng)全線粒體數(shù)據(jù)和實(shí)驗(yàn)室積累腹露蝗屬COXI基因數(shù)據(jù),采用多種方法進(jìn)行了腹露蝗屬的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系研究、物種定界研究和條形碼分子鑒定成功率檢測(cè)。主要結(jié)果如下:1.七種腹露蝗線粒體基因組表征七種腹露蝗線粒體全基因組全長(zhǎng)在15679bp～15727bp之間,基因組成與亞庫(kù)巴果蠅一致,基因排列順序與亞庫(kù)巴果蠅相比trnK與trnD基因發(fā)生易位;線粒體全基因組全長(zhǎng)A+T堿基含量超過(guò)75%,表現(xiàn)出明顯的AT偏向;13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因起始密碼子均為ATN標(biāo)準(zhǔn)密碼子,終止密碼子除COI基因（終止密碼子為不完整的T）外均為完整的TAA或TAG。21個(gè)tRNA二級(jí)結(jié)構(gòu)為標(biāo)... 

【文章頁(yè)數(shù)】：125 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
1 引言
    1.1 腹露蝗屬研究概況
        1.1.1 腹露蝗屬分類(lèi)學(xué)研究進(jìn)展
        1.1.2 腹露蝗屬其他方面研究進(jìn)展
    1.2 昆蟲(chóng)線粒體基因組及分子鑒定研究進(jìn)展
        1.2.1 昆蟲(chóng)線粒體基因組研究進(jìn)展
        1.2.2 昆蟲(chóng)分子鑒定研究進(jìn)展
    1.3 研究的目的及意義
2 實(shí)驗(yàn)材料與研究方法
    2.1 實(shí)驗(yàn)材料
    2.2 測(cè)序方法
        2.2.1 高通量測(cè)序
        2.2.2 克隆測(cè)序
    2.3 線粒體基因組組裝與注釋
        2.3.1 線粒體基因組組裝
        2.3.2 線粒體基因組注釋
    2.4 分子系統(tǒng)學(xué)研究方法
        2.4.1 系統(tǒng)發(fā)育研究方法
        2.4.2 物種定界研究方法
        2.4.3 分子鑒定成功率檢測(cè)方法
3 腹露蝗屬昆蟲(chóng)線粒體全基因組基本特征
    3.1 基本結(jié)構(gòu)
    3.2 核苷酸組成分析
    3.3 蛋白質(zhì)編碼基因分析
    3.4 轉(zhuǎn)運(yùn)RNA與核糖體RNA分析
    3.5 A+T富集區(qū)分析
4 腹露蝗屬分子系統(tǒng)學(xué)研究
    4.1 系統(tǒng)發(fā)育研究
        4.1.1 數(shù)據(jù)集相關(guān)分析
        4.1.2 系統(tǒng)發(fā)育分析
    4.2 物種定界研究
        4.2.1 數(shù)據(jù)集相關(guān)分析
        4.2.2 物種定界NJ聚類(lèi)分析
        4.2.3 遺傳距離
        4.2.4 單倍型網(wǎng)絡(luò)圖
    4.3 分子鑒定成功率檢測(cè)
5 結(jié)論與展望
    5.1 七種腹露蝗線粒體全基因組特征
    5.2 系統(tǒng)發(fā)育
    5.3 物種定界
    5.4 分子鑒定
    5.5 創(chuàng)新點(diǎn)和展望
參考文獻(xiàn)
附錄A: 7種腹露蝗線粒體全基因組組成
附錄B: 7腹露蝗線粒體全基因組堿基組成
附錄C: 7種腹露蝗線粒體全基因組蛋白質(zhì)編碼基因密碼子使用頻率
附錄D: 7種腹露蝗線粒體全基因組TRNA二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)圖
附錄E: 不同線粒體單基因遺傳距離
附錄F: 基于不同單基因數(shù)據(jù)集所得單倍型網(wǎng)絡(luò)圖
附錄G 攻讀碩士學(xué)位期間的主要學(xué)術(shù)成果
    附錄G1: 科研項(xiàng)目
    附錄G2: 發(fā)表論文
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]DNA條形碼技術(shù)在昆蟲(chóng)分類(lèi)學(xué)中的研究進(jìn)展[J]. 魏明峰,張振旺.  農(nóng)學(xué)學(xué)報(bào). 2019(04)
[2]蚜蠅科昆蟲(chóng)比較線粒體基因組分析[J]. 李娟,李虎,霍科科.  陜西理工大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2019(01)
[3]直翅目昆蟲(chóng)線粒體基因組特征及系統(tǒng)發(fā)育研究[J]. 趙樂(lè),李雪娟,黃原.  生命科學(xué). 2018(01)
[4]無(wú)齒稻蝗和黃翅踵蝗線粒體基因組與系統(tǒng)發(fā)育分析[J]. 常會(huì)會(huì),楊麗平,劉菲,汪曉陽(yáng),邱忠營(yíng),李雪娟,黃原.  基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2018(01)
[5]白洋淀濕地蝗蟲(chóng)多樣性調(diào)查及DNA條形碼應(yīng)用研究[J]. 郝金鳳,張曉紅,王昱淞,劉金林,智永超,李新江.  生物多樣性. 2017(04)
[6]越北腹露蝗的生物學(xué)特性和生活史觀察[J]. 彭新春,吳習(xí)安,何國(guó)良,楊敬,熊躍芝.  湖南林業(yè)科技. 2014(03)
[7]鄭氏比蜢線粒體基因組全序列的測(cè)定與分析[J]. 楊輝,黃原.  動(dòng)物學(xué)研究. 2011(04)
[8]中國(guó)歷史蝗災(zāi)動(dòng)態(tài)的社會(huì)影響及生態(tài)環(huán)境意義[J]. 李鋼,王乃昂,李卓侖.  地理科學(xué)進(jìn)展. 2010(11)
[9]基于線粒體Cyt b,16S rDNA和核28S rDNA的中國(guó)斑腿蝗科（直翅目,蝗總科）九亞科間的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系研究[J]. 蘆榮勝,黃原,周志軍.  動(dòng)物分類(lèi)學(xué)報(bào). 2010(04)
[10]越北腹露蝗蟲(chóng)害發(fā)生程度分階段動(dòng)態(tài)預(yù)報(bào)[J]. 楊永生,蔣國(guó)華,宋艷華,涂宏蘭,彭惠英.  廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(08)

博士論文
[1]基于高通量測(cè)序的雛蝗屬線粒體基因組測(cè)定及分子系統(tǒng)學(xué)研究[D]. 董佳佳.陜西師范大學(xué) 2018
[2]直翅目昆蟲(chóng)線粒體基因組比較、譜系及進(jìn)化研究[D]. 邱忠營(yíng).陜西師范大學(xué) 2016
[3]直翅目部分物種的DNA條形編碼與譜系芯片研究[D]. 毛少利.陜西師范大學(xué) 2011

碩士論文
[1]基于線粒體基因組的中國(guó)黑蝗亞科系統(tǒng)發(fā)育研究[D]. 姜兵.中南林業(yè)科技大學(xué) 2019
[2]腹露蝗屬的訂正、系統(tǒng)發(fā)育及生物地理學(xué)研究[D]. 楊瑞.陜西師范大學(xué) 2015
[3]廣西弄崗自然保護(hù)區(qū)直翅目昆蟲(chóng)區(qū)系及部分物種的DNA條形編碼研究[D]. 韋滔.廣西師范大學(xué) 2014
[4]基于COⅡ＆18S rDNA基因序列的蝗總科部分種類(lèi)的分子系統(tǒng)學(xué)研究[D]. 魏秀娟.陜西師范大學(xué) 2011
[5]基于線粒體cytb基因序列的金線蛙分子系統(tǒng)地理學(xué)[D]. 劉奎.首都師范大學(xué) 2009



本文編號(hào)：3698368