位于小鼠1號染色體結(jié)核超敏感位點的胞內(nèi)病原體抗性基因1（Ipr1基因）在機(jī)體對抗胞內(nèi)病原體（如結(jié)核桿菌）感染的過程中起重要作用。其同源基因位于牛2號染色體以及人2號染色體的SP110（Ipr1）基因,能夠抑制結(jié)核桿菌在宿主細(xì)胞中的增殖。研究發(fā)現(xiàn),SP110的單核苷酸多態(tài)性和宿主是否易感結(jié)核密切相關(guān)。在胞內(nèi)病原體感染時,Ipr1/SP110被激活并參與細(xì)胞免疫的過程中,與Ipr1類似,免疫相關(guān)的GTP酶家族M蛋白1（Irgm1）在病原體入侵引起的自噬調(diào)控中具有十分重要的作用。Ipr1與Irgm1都屬于結(jié)核抗性基因,迄今為止,Ipr1以及Irgm1在宿主細(xì)胞中的調(diào)控方式尚不清楚。因此研究Ipr1以及Irgm1在細(xì)胞內(nèi)的表達(dá)調(diào)控對理解機(jī)體對抗胞內(nèi)病原體的機(jī)理具有重要作用。本研究結(jié)合生物信息學(xué)分析、分子生物學(xué)、生物化學(xué)及細(xì)胞生物學(xué)研究方法與技術(shù),深入探究了Ipr1基因的上游調(diào)控機(jī)制及其通過p53調(diào)控下游靶基因Irgm1的機(jī)制。主要研究結(jié)果如下:1.通過對NCBI數(shù)據(jù)庫中DNA病毒,RNA病毒以及多種結(jié)核桿菌菌株處理的免疫相關(guān)細(xì)胞（THP-1,RAW264.7等）的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)諾如病... 

【文章頁數(shù)】：138 頁

【學(xué)位級別】：博士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
主要符號對照表
文獻(xiàn)綜述
    第一章 結(jié)核抗性基因及相關(guān)信號通路的研究進(jìn)展
        1.1 結(jié)核病概述
            1.1.1 結(jié)核病的發(fā)現(xiàn)以及重要發(fā)展回顧
            1.1.2 結(jié)核病的現(xiàn)狀
            1.1.3 結(jié)核桿菌與宿主細(xì)胞之間的相互作用
            1.1.4 結(jié)核病的宿主導(dǎo)向治療
        1.2 Ipr1和Irgm1的研究進(jìn)展
            1.2.1 Ipr1基因的研究進(jìn)展
            1.2.2 Irgm1的研究進(jìn)展
        1.3 小鼠巨噬細(xì)胞內(nèi)信號通路的調(diào)控和功能
            1.3.1 cGAS/STING/TBK/IRF3信號通路
            1.3.2 cGAS通路在免疫調(diào)控中具有重要作用
            1.3.3 p53信號通路
        1.4 本研究的立項意義和內(nèi)容
試驗研究
    第二章 IRF3調(diào)控Ipr1表達(dá)的研究
        2.1 材料與方法
            2.1.1 材料
            2.1.2 方法
        2.2 結(jié)果
            2.2.1 乙型肝炎病毒、諾如病毒、仙臺病毒以及流感病毒激活SP110/Ipr1的表達(dá)
            2.2.2 H37Rv以及北京株激活Sp110/Ipr1的表達(dá)
            2.2.3 依托泊苷和阿糖孢苷激活細(xì)胞中Sp110/Ipr1的表達(dá)
            2.2.4 ISD激活I(lǐng)pr1的表達(dá)
            2.2.5 ISD處理激活I(lǐng)pr1啟動子區(qū)域的轉(zhuǎn)錄活性
            2.2.6 Ipr1啟動子區(qū)域具有高度保守性
            2.2.7 小鼠Ipr1啟動子區(qū)域含有ISRE,Statx以及Rel
            2.2.8 ISRE在Ipr1、 的轉(zhuǎn)錄激活中具有重要作用
            2.2.9 IRF3特異性結(jié)合Ipr1啟動子區(qū)的ISRE
        2.3 討論
        2.4 結(jié)論
    第三章 Ipr1調(diào)控Irgm1表達(dá)的研究
        3.1 材料與方法
            3.1.1 材料
            3.1.2 方法
        3.2 結(jié)果
            3.2.1 ISD激活RAW264.7細(xì)胞中Irgm1的表達(dá)
            3.2.2 敲降Ipr1引起Irgm1的下調(diào)
            3.2.3 參與調(diào)控Irgm1的microRNA預(yù)測
            3.2.4 NUDR和 Ipr1的SAND結(jié)構(gòu)域氨基酸組成相似
            3.2.5 Ipr1 影響TNF-α和Irgm1的啟動子活性
            3.2.6 Ipr1 不能結(jié)合TTCG基序
            3.2.7 Ipr1慢病毒表達(dá)載體的構(gòu)建
            3.2.8 穩(wěn)定表達(dá)Ipr1的RAW264.7細(xì)胞系驗證
            3.2.9 ChIP數(shù)據(jù)質(zhì)量檢測
            3.2.10 Ipr1在基因組上的結(jié)合位置
            3.2.11 Ipr1的結(jié)合位點統(tǒng)計
        3.3 討論
        3.4 結(jié)論
    第四章 p53調(diào)控Irgm1表達(dá)的研究
        4.1 材料與方法
            4.1.1 材料
            4.1.2 方法
        4.2 結(jié)果
            4.2.1 Irgm1啟動子核心區(qū)域的確定
            4.2.2 Irgm1啟動子區(qū)域順式作用元件預(yù)測
            4.2.3 人IRGM基因啟動子區(qū)域分析
            4.2.4 ActD激活I(lǐng)rgm1的表達(dá)
            4.2.5 ADR激活I(lǐng)rgm1 的表達(dá)
            4.2.6 p53上調(diào)Irgm1的啟動子活性
            4.2.7 干擾p53抑制ISD誘導(dǎo)的Irgm1的表達(dá)
        4.3 討論
        4.4 結(jié)論
    第五章 Ipr1通過Rpl11和Mdm2調(diào)控p53
        5.1 材料與方法
            5.1.1 材料
            5.1.2 方法
        5.2 結(jié)果
            5.2.1 Ipr1參與細(xì)胞內(nèi)信號通路的調(diào)控
            5.2.2 ISD處理導(dǎo)致RAW264.7細(xì)胞的G1-G0阻滯
            5.2.3 干擾Ipr1下調(diào)ISD誘導(dǎo)的p21表達(dá)
            5.2.4 Ipr1,p53以及Mdm2 的互作蛋白統(tǒng)計
            5.2.5 Ipr1,p53以及Mdm2 通過核糖體蛋白聯(lián)系在一起
            5.2.6 Ipr1與Npm1,Rpl11和Mdm2存在相互作用
            5.2.7 Ipr1 通過Rpl11調(diào)控Mdm2和p53的相互作用
            5.2.8 ISD提高M(jìn)dm2和Ipr1,Rpl11的互作
            5.2.9 Ipr1降低p53蛋白泛素化水平
            5.2.10 ISD THP-1細(xì)胞系中SP100和IRGM的影響
        5.3 討論
        5.4 結(jié)論
全文結(jié)論
    創(chuàng)新之處
參考文獻(xiàn)
致謝
個人簡歷


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]Animal models to study Mycobacterium tuberculosis and HIV co-infection[J]. Ming GUO,Wen-Zhe HO.  Zoological Research. 2014(03)



本文編號：3681009